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绘制神经网络的新方法-NetworkX

王海华 模型视角 2023-09-04

Network

NetworkX是一个用Python语言开发的图论与复杂网络建模工具,内置了常用的图与复杂网络分析算法,可以方便地进行复杂网络数据分析、仿真建模等工作。该库支持创建简单无向图、有向图和多重图,内置许多标准的图论算法,节点可为任意数据,支持任意的边值维度,功能丰富,简单易用。

NetworkX的主要特点包括:

灵活性强:可以创建不同类型的图,包括无向图、有向图和多重图,并支持自定义节点和边。

扩展性强:内置了大量的图论和网络算法,可以方便地对网络进行分析和操作。

可视化性好:支持将网络绘制成图像,方便观察和展示。

社区活跃:是一个开源项目,拥有活跃的开发者社区和用户社区,提供了大量的示例和文档。

下面我见使用Network 绘制一个简单的神经网络,如下图所示:

使用NetworkX绘制神经网络步骤

使用 networkx 绘制神经网络需要考虑网络的结构和布局。以下是使用 networkx 绘制神经网络的步骤和一些技巧:

步骤:

  • 初始化图:

使用 nx.DiGraph() 初始化一个有向图,因为神经网络是从输入层流向输出层的有向结构。

  • 添加节点:

对于每一层,为每个神经元添加一个节点。为了方便标识,可以给每个神经元一个独特的标签,例如 "Layer_1_Neuron_2" 表示第一层的第二个神经元。

  • 确定节点位置:

使用一个字典来保存每个节点的位置。这可以确保神经元在绘制时有序排列。可以选择在水平轴上按层次来放置节点,并在垂直轴上等距分隔每个神经元。

  • 添加边:

对于相邻的层,连接每个神经元到下一层的所有神经元。

  • 绘制图:

使用 nx.draw() 函数绘制图。可以设置各种参数来改变节点和边的颜色、大小和形状等。

技巧:

  • 调整布局:

networkx 有多种布局算法,例如 spring_layout 和 circular_layout。但对于神经网络,通常使用自定义布局更为合适,以确保层和神经元的有序排列。

  • 美化图:

使用 node_color、node_size、edge_color 等参数来调整节点和边的外观。使用 with_labels=True 参数来显示节点标签。

  • 调整边的样式:

可以使用 edge_color 和 width 参数来调整边的颜色和宽度。如果想表示权重或其他属性,可以为边添加标签或使用不同的线型和颜色。

  • 添加标题和标签:

使用 plt.title() 添加标题。如果需要更复杂的标签或注释,可以使用 matplotlib 的函数。

  • 扩展性:

当创建更大或更复杂的网络时,考虑将代码组织成函数或类,以提高可读性和可重用性。使用 networkx 绘制神经网络的主要优点是它提供了很大的灵活性,允许用户自定义网络的外观和结构。然而,对于大型或复杂的网络,可能需要额外的工具或库,如 PyTorch、TensorFlow 的可视化工具,以更有效地表示网络结构。

import matplotlib.pyplot as plt
import networkx as nx

def plot_neural_net(layers):
    """
    Plots a simple feed-forward neural network graph using networkx.
    Args:
    - layers (list of ints): a list where each item is the number of neurons in that layer.
      E.g., [2, 3, 1] means input layer has 2 neurons, one hidden layer with 3 neurons, and output layer with 1 neuron.
    """


    G = nx.DiGraph()
    pos = {}

    # Add nodes and their positions for each layer
    for i, layer_size in enumerate(layers):
        for j in range(layer_size):
            node_name = f"Layer_{i}_Neuron_{j}"
            G.add_node(node_name)
            pos[node_name] = (i, j - layer_size / 2)

    # Connect nodes between layers
    for i in range(len(layers) - 1):
        for j in range(layers[i]):
            for k in range(layers[i + 1]):
                G.add_edge(f"Layer_{i}_Neuron_{j}"f"Layer_{i+1}_Neuron_{k}")

    # Draw the graph
    nx.draw(G, pos, with_labels=True, node_size=2000, node_color="skyblue", font_size=10, font_weight='bold', width=2, edge_color="gray")

    plt.title("3-layer Neural Network")
    plt.show()

# Define the number of neurons in each layer for a 3-layer network
layers = [342]
plot_neural_net(layers)

下面是几种其他的绘制结果,稍稍变一下参数即可。

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