接下来，科研团队探究了感染动物的呼吸道损伤情况。惊讶的是，在右肺的下部观察到片状的毛玻璃片样，多个不透明的区域；而肺部病变的范围从第3天扩展到了第6天；尸检显示整个下呼吸道有不同程度的巩固或结节，水肿，出血和坏死，表明是间质性肺炎。第3天，右肺下叶的部分呈暗红色，有大块斑块状出血，约占肺组织的15％；第10天该动物的右上叶和右下叶有两个红色的深色病灶，占10％的肺组织。然而，肺的表面和部分为灰色和白色，并有固结，并且肺的下叶比深红色的上叶坚硬，并有斑块状出血。对呼吸道组织和其他器官都进行了RT-qPCR分析。数据显示SARS-CoV-2在呼吸道中广泛存在，主要位于肺下叶。但在心脏，肝脏，脾脏，肾脏，肠，胃和生殖细胞中均未检测到特异性病毒RNA感染。不难猜测，呼吸道是SARS-CoV-2感染的主要目标，而其他器官可能不是直接目标。进一步，研究团队就恒河猴的组织病理学变化进行深入分析。发现，小支气管周围有损伤，左，右肺下叶损伤最多。观察到肺泡壁增厚，大量单核细胞和淋巴细胞以及少量嗜酸性粒细胞浸润。在严重病变区域，可见肺泡壁坏死，塌陷和纤维化，并伴有大量成纤维细胞增殖。在肺泡腔中，通常可以观察到轻度和中度的纤维素渗出，并且在其中一些中观察到透明膜的形成和肺出血。同时，细支气管的上皮细胞坏死并脱落，在粘膜和粘膜下层观察到单核和淋巴细胞浸润，甚至发生支气管周炎。肺毛细血管腔内有明显的血栓，并伴有内皮细胞肿胀和血管周炎。种种数据均表明，恒河猴感染新冠病毒表现出了同人类一样的以间质性肺炎为主的肺炎特征。最后，实验人员将恒河猴模型再次进行病毒攻击，以检验病毒在机体复制过程中是否诱导良好的中和抗体水平。值得高兴的是，经1 x 10^6 TCID50的病毒再次感染后，恒河猴模型没有检测到病毒RNA的存在，说明此模型诱导的中和抗体可以完全抵御病毒的再次攻击，且没有体温和体重的变化。以上实验都验证了恒河猴可完美的作为新冠病毒的模型动物。