兽医科讯：韩国报告首例猪呼吸道病毒1型病例

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NEWS

  韩国报告首例猪呼吸道病毒1型病例Jonghyun Park，Hye-Ryung Kim，Jong-Min Kim，Kyoung-Ki Lee，Won-Il Kim，Young S Lyoo，Oh-Deog Kwon，Choi-Kyu Park， PMID: 36174972
DOI: 10.1111/tbed.14715

猪呼吸道病毒1型（PRV1）是副粘病毒科呼吸道病毒属的一种新发病毒。2009年该病毒首次在中国香港被检出，随后几个美洲和欧洲国家也相继报道，表明该新发病毒可能已在全球传播。本文中，我们报告了在韩国7个省份16家养殖场的生猪中首次检出PRV1，经口腔拭子测试，其流行率为71.4%，提示该病毒可能已经在韩国猪群中广泛传播。为进一步分析韩国PRV1毒株的遗传特征，对3家养猪场的PRV1阳性样品进行基因测序，获得了全基因组和两条F基因序列。基于全基因组和F基因序列进行系统发育分析，结果显示3个韩国PRV1毒株均属于欧洲谱系1，与中国香港、德国和波兰毒株的亲缘关系较近。由于PRV1序列有限，我们无法获得韩国PRV1来源的证据。综上所述，PRV1首次在韩国猪群中检出，本研究对该病毒进行了基因特征分析。这些结果有助于人们更好地了解PRV1的全球地理分布情况和遗传特征。

原文链接：

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36174972/

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NEWS

 我国上海流浪犬库布病毒检测
及其基因特征分析

Bo Deng，Yuying Song，Liang Li，Yumen Zhou，Chunyan Zhu，Weiyi Zhang，Dongsheng Feng

PMID：36918497   

DOI：10.1007/s00705-023-05710-z

本研究采用实时定量反转录聚合酶链反应，对动物庇护所60只流浪狗直肠样品开展了犬库布病毒（canine kobuvirus）和其他肠道病毒检测。结果显示，犬库布病毒检出率为25%（15/60）。15份阳性样品中，其与犬瘟热病毒、犬冠状病毒、犬星状病毒、犬诺如病毒和犬轮状病毒的混合感染率分别为26.67%、20.00%、73.33%、0%和20.00%。基于VP1基因部分序列进行系统发育分析，发现这是一种新型犬库布病毒，是犬、猫库布病毒的重组体。贝叶斯进化分析显示，犬库布病毒VP1基因的进化速率为1.36×10^-4替换率/位点/年（95%最大后验密度区间，6.28×10^-7~4.30×10^-4替换率/位点/年）。VP1基因的分化时间约为19.44年前（95%最大后验密度区间，12.96~27.57年）。

原文链接：
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36918497/

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 2018-2019年俄罗斯中部羊痘疫情
病毒株遗传特征分析

Alena Krotova，Kseniya Shalina，Ali Mazloum，Dmitry Kwon，Antoinette Van Schalkwyk，Olga Byadovskaya，Alexander Sprygin

PMID：36217254   

DOI：10.1111/tbed.14727

基于2018—2019年在俄罗斯中部流行的羊痘病毒（SPPV）与该国使用的NISKHI疫苗株的全基因组序列，本研究调查了其系统发育基因组相关性。间隔一年的时间，相邻的图拉和莫斯科地区分别暴发了羊痘疫情。利用DNBSEQ-400平台（中国华大智造），通过trizol直接提取患羊结痂中的DNA，经测序，生成全基因组序列。系统发育分析显示，俄罗斯SPPV分离株与2000年印度克什米尔省斯利那加公布的序列（SPPV-斯利那加株）以及2000年哈萨克斯坦SPPV A株聚类。它们均属于含有NISKHI疫苗株的姐妹分支，因而结果表明近期疫情与广泛使用的疫苗株没有基因相关性。原文链接：

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36217254/

信息来源：中国动物卫生与流行病学中心

END

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