第五版《全球生物多样性展望》领衔作者在绿会联合主办ICG-15分论坛的主旨分享 | GBIF与DNA衍生数据发布

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2024-08-23

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2020年10月29日，一场由中国绿发会联合主办的第十五届国际基因组学大会（ICG-15）分论坛在武汉以线下线上并举的方式圆满落幕。这场分论坛主题为“生物多样性与组学研究：生态文明时代的生命科学”，汇集世界顶尖学者，研讨了一系列生态文明视角下的关键议题。

全球生物多样性信息网络 (GBIF)秘书处副主任，同时也是世人瞩目之第五版《全球生物多样性展望》（GBO5）领衔作者Tim Hirsch，远程带来了一次主旨分享，主题为《作为通过GBIF绘制生物多样性分布工具的DNA衍生数据》（DNA-derived data as a tool for mapping biodiversity distributions through GBIF）。

GBIF是一个国际网络和研究基础设施，旨在为所有人提供有关地球上所有类型生命相关数据的开放式访问。通过GBIF.org平台向所有人免费提供的记录为研究人员和决策制定者提供无与伦比的信息资源，将几个世纪以来，以及整个地球上收集的有关物种被观察或收集的地点和时间的证据汇集到一起。2018年7月，绿会正式成为GBIF数据发布者，通过“公民科学家”项目和独创建立的“中华保护地”（CCAfa）体系，将在野外考察时和在保护地观测到的尤其具中国代表性的濒危物种数据在GBIF平台上通过综合发布工具包（IPT）进行发布。

Tim Hirsch先生团队曾多次与绿会秘书长周晋峰博士团队围绕昆明《生物多样性公约》缔约方大会第十五次会议（CBD COP15）、2020年后全球生物多样性框架、推动生态文明与可持续发展、通过地图绘制或共享观测实现生物多样性数据信息共享等议题开展互动研讨。

绿会秘书长向到访的Hirsch先生介绍绿会推动对白鱀豚踪迹开展考察的工作（来源：绿会）

Hirsch先生的本次分享着重介绍了GBIF通过使用通用数据标准和强大的数据索引和发现平台，可以从各种各样的异质证据源中普遍访问数据，这些证据源包括采集样本、人类观察、出版物、遥感，以及越来越多的来自DNA证据的数据。

通过GBIF获取的数据为一系列与可持续发展有关的研究和政策主题提供了信息，包括保护、气候变化、粮食安全和人类健康。最近的发展极大地提高了GBIF容纳来自DNA数据的能力。这些不仅包括可以通过常规的林奈分类法的科学名称来解释地理参考发生记录的功能，还可以通过由遗传相似性定义并以诸如条形码索引（BIN）和真菌物种假设（SH）标识符，映射到GBIF分类骨干。这些发展有可能大量增加通过GBIF发现数据的数量和分类范围，为更好地理解生物圈及其正在发生的变化提供新工具。

（来源：远程分享截屏）

Hirsch先生在分享中介绍了一个GBIF的新指南：《通过生物多样性数据平台发布DNA衍生数据》（Publishing DNA-derived data through biodiversity data platforms）。当遗传信息被用来描述或分类一个分类单元时，大多数使用者会预见到其在分子生态学或系统发育研究中的应用。重要的是要认识到，一个带有坐标和时间戳的序列是一个有价值的生物多样性事件，它在比其原始目的更广泛的背景下有用。

（来源：远程分享截屏）

为了实现这种潜力，需要通过生物多样性数据平台发现DNA衍生的数据。这一《通过生物多样性数据平台发布DNA衍生数据》指南将指导人们在更广泛的生物多样性数据背景下发布“带有日期和坐标的序列”的原则和方法。该指南涵盖了特定模式和术语的选择、常见缺陷和良好实践，但没有涉及特定于平台的细节。该指南将使任何对通过一般生物多样性数据平台（包括国家生物多样性门户网站）更好地发布DNA衍生数据感兴趣的人受益。

（完）

【参考来源：】

ICG-15官网（含详细议程）

https://icg-15.sciconf.cn/cn/web/index

GBIF：《通过生物多样性数据平台发布DNA衍生数据（团体审查草案）》

https://docs.gbif-uat.org/publishing-dna-derived-data/1.0/en/

文/牛静美审/绿宣编/Angel

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http://www.cbcgdf.org/NewsShow/4937/9972.html