【实用贴】原始数据上传SRA新版流程
众所周知，做完高通量测序，发表文章前，大部分杂志都会要求上传NGS原始数据到SRA（见要发paper了，不会提交原始数据肿么办？），或者转录调控方面的数据，如转录组原始数据和表达量结果上传到GEO，相关教程贴心的小编已经给各位分享过了，参见【实用帖】手把手教你如何上传GEO数据库。
讲到这里，各位要疑惑了，既然都分享过了，又来絮叨啥啊。
首先，虽然新版的上传流程有更改，但是前面的步骤，基本没有变，简单写写；
准备工作：注册NCBI账号，已有账号则跳过此步骤，网址
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/account/?back_url=http%3A%2F%2Fwww.ncbi.nlm.nih.gov%2Fpubmed
1、创建BioProject
https://submit.ncbi.nlm.nih.gov/subs/bioproject/，在界面上选择 new submission 填写项目描述信息建立账号，依次填写SUBMITTER、PROJECT TYPE、TARGET、GENERAL INFO、BIOSAMPLE等信息，后面的BIOSAMPLE和PUBLICATIONS两个界面可以不写相关信息，都直接点Continue，进入OVERVIEW界面。如果有问题可返回修改，没问题的话即可点击submit提交。创建成功后，再次进入该网址，会出现BioProject编号，以PRJNA开头，可放在文章中。注：所有界面中都是带星号的为必填项。
2、创建BioSample
https://submit.ncbi.nlm.nih.gov/subs/biosample/，在界面选择 new submission。大致提交过程如下截图所示，最终提交完成后，每个样本会有一个样本编号，以SAMN开头，用于后面提交原始数据时，填写biosample_accession，和对应原始数据相匹配。
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3、原始数据提交SRA（Sequence Read Archive）
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Traces/sra_sub/sub.cgi，选择 NCBI PDA入口，填写个人信息后，点击 create new submission >> New submission。
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重点来了：填完描述样本和数据对应关系以及文库信息的SRA_metadata_acc.txt后，点击continue，单个样本数据量超过10Gb以上或者数据太多，需要用其他方式上传，比如FTP，勾选PTP上传选项后，会在下方出现“Select preload folder”，我们点击后发现没有文件夹。这时我们点击FTP upload instructions，会出现如下提示：
Address: ftp-private.ncbi.nlm.nih.gov
Username: subftp Password: w4pYB9VQ
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数据上传比较慢，等数据都上传完成后，再点击“Select preload folder”，即可出现上传好的原始数据，点击“Use selected folder”，继续即可。（其实可以先将数据上传到NCBI中，即先完成上述preload，到这步可以直接选择文件夹，不用等数据上传时间）
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后面全部提示Processed即上传完成。登陆https://submit.ncbi.nlm.nih.gov/subs/或SRA website，可查看数据提交结果。一般从ncbi-BioProject数据库查询该PRJNA号时，隔一至两天后可以看到原始数据已经链接至该PRJNA。
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