查看原文
其他

研究表观?是时候尝试下这个技术了!


有时候,

研究基因的转录调控,

没有具体的转录因子,

想研究某个转录因子结合序列苦于无chip级抗体,

。。。。。。

那可以尝试下ATAC-seq!

什么是ATAC-seq?


ATAC-seq(Assay for Transposase – Accessible Chromatin with high-throughput sequencing),是一种通过使用高通量测序对易接近转座酶核染色质进行分析的一种方法。通过高活性的Tn5转座酶将测序接头插入染色质的开放区域,然后通过测序数据来推断染色质区域的可接触性,并计算转录因子结合位点和核小体的区域位置。


Buenrostro,J,D, et al.Nature methods,2013.


技术流程在这儿~



ATAC-seq结合RNA-seq,可以更好地解释转录水平调控机制,从表观到基因表达,最终阐述疾病表型研究。



【百迈客合作案例及解读链接】

  非神经前体细胞转录因子Ptf1a可独立将成纤维细胞直接重编程为神经细胞

  RNA-seq&ATAC-seq揭示TRIM28参与HIV-1潜伏感染机制


看完案例是不是觉得ATAC-seq与RNA-seq很搭,那么划重点了~


既然这么搭

那就送!

做一个ATAC-seq,送一个RNA-seq!

就是这么实在!

欢迎联系我们哦~


 


您可能也对以下帖子感兴趣

文章有问题?点此查看未经处理的缓存