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结构速递 | 一周“结构”要览 VOL.52(2.27~3.05)

谭佳鑫 北京生物结构前沿研究中心 2024-04-29

上周发布了哪些“结构”文章?又取得了哪些科研进展?


结构速递栏目以每周“结构”相关领域刊文为主题,梳理一周结构发文大事记,“结构速递”为您传递最新、最快、最权威的结构资讯。

2023.2.27~2023.3.05

CNS刊登文章

01

 Science

2023/3/02

 “Unsaturated bond recognition leads to biased signal in a fatty acid receptor”


单个游离脂肪酸 (FA) 在代谢稳态中发挥着重要作用,其中许多是通过与40多个 GPCR的结合而发挥作用。GPR120(FFAR4)是脂肪酸受体家族成员之一,可识别长链脂肪酸,包括鱼油成分中的ω-3脂肪酸、亚油酸(LA)以及油酸 (OA) 等常见脂肪酸。GPR120被激活后可以偶联多个下游的不同效应器分子,包括Gq、Gs、G i 和 β-arrestin,涉及一系列代谢疾病。


来自山东大学于晓和孙金鹏研究团队,联合浙江大学医学院张岩团队以及山东大学第二医院冯世庆团队分别解析了在4种脂肪酸配体(EPA、LA、9-HSA、OA)和小分子激动剂TUG891激活下的GPR120-G i /G iq 复合物高分辨率三维结构。GPR120 配体口袋内的芳香族残基负责识别这些 FA 的位于不同位置的双键,并将配体识别与不同的效应子偶联起来。研究者揭示了 GPR120 如何区分刚性双键和柔性单键,并可能促进针对 GPR120 的药物设计。

原文链接

https://www.science.org/doi/10.1126/science.add6220



02

Cell 

2023/3/02

“Cryo-EM structure of gas vesicles for buoyancy-controlled motility”


气囊是充满气体的纳米级的“房间”,不同的细菌和古生菌群利用这些气囊控制它们的浮力。它们的特性和组装的分子基础仍不清楚。


来自荷兰代尔夫特理工大学的Arjen J. Jakob和David Maresca解析了由结构蛋白 GvpA 组成的气囊壳的 3.2 Å cryo-EM 结构,该结构蛋白自组装成由锥形尖端封闭的空心螺旋圆柱体。两个螺旋半壳通过 GvpA单体的特征排列连接,揭示了气囊生物发生的机制。GvpA 的折叠具有典型的受力薄壁圆柱体的波纹壁结构。上面的小孔使气体分子能够扩散到整个外壳,而异常疏水的内表面有效地排水。比较结构分析证实了气囊组装的进化守恒,并证明了 GvpC 增强了壳的分子特征。研究者将进一步研究气囊生物学,并促进用于超声成像的气囊分子工程。

原文链接

https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(23)00100-9



  Nature

本周无


2023.2.27~2023.3.05

子刊刊登文章


01

 Molecular Cell

3.02

“DAXX adds a de novo H3.3K9me3 deposition pathway to the histone chaperone network”


02

Nature Structural & Molecular Biology

3.02

“The structure of pathogenic huntingtin exon 1 defines the bases of its aggregation propensity”


03

Nature Communications

2.27

1.“Noncanonical electromechanical coupling paths in cardiac hERG potassium channel”

2.27

2.“Structure and mechanism of a tripartite ATP-independent periplasmic TRAP transporter”

2.28

3.“Structural mechanism for inhibition of PP2A-B56α and oncogenicity by CIP2A”

3.01

4.“Structural details of a Class B GPCR-arrestin complex revealed by genetically encoded crosslinkers in living cells”

3.01

5.“Crystal structure of a subtilisin-like autotransporter passenger domain reveals insights into its cytotoxic function”

3.01

6.“Automatic and accurate ligand structure determination guided by cryo-electron microscopy maps”

3.01

7.“Predicting locations of cryptic pockets from single protein structures using the PocketMiner graph neural network”

3.02

8.“Structural features discriminating hybrid histidine kinase Rec domains from response regulator homologs”

3.02

9.“A covalent BTK ternary complex compatible with targeted protein degradation”

3.02

10.“Disease-relevant β2-microglobulin variants share a common amyloid fold”

3.02

11.“Ligand-specific changes in conformational flexibility mediate long-range allostery in the lac repressor”

3.02

12.“rRNA methylation by Spb1 regulates the GTPase activity of Nog2 during 60S ribosomal subunit assembly”

3.03

13.“Fibroblastic reticular cells in lymph node potentiate white adipose tissue beiging through neuro-immune crosstalk in male mice”

3.03

14.“Variable microtubule architecture in the malaria parasite”

3.03

15.“Cryo-EM structure of human heptameric pannexin 2 channel”

3.03

16.“The dynamic nature of netrin-1 and the structural basis for glycosaminoglycan fragment-induced filament formation”


04

Science Advances

3.03

1.“Structural insights into TRAP association with ribosome-Sec61 complex and translocon inhibition by a CADA derivative”

3.03

2.“Cryo-EM structures of human SPCA1a reveal the mechanism of Ca2+/Mn2+ transport into the Golgi apparatus”


作者 | 谭佳鑫

审稿 | 肖媛

排版 | 囡囡

排版设计 | 可洲



Cell Research

本周无

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