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Nature | 高速原子力显微镜助力非典型TRPV五聚体的发现

朱盎岐 北京生物结构前沿研究中心 2024-04-28



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TRP通道(Transient receptor potential channel,瞬时受体电位通道)是一大类离子通道的超级家族,在真核生物中广泛表达。TRP通道对许多类型的刺激作出响应,并参与多种生物过程,包括感觉功能,如温度感知、疼痛感知和味觉感知,以及液体分泌、离子平衡等功能【1】。目前已经通过冷冻电镜解析了来自20多种不同TRP通道的210多个结构,所有这些结构都显示出TRP是四聚体。尽管有大量的TRPV通道结构,但仍有许多关于其门控循环的细节尚不清楚且存在争议,例如孔膨胀现象。这一现象在功能上已经报道了TRPV1、TRPV3、TRPA1和TRPV2突变体,其中长时间受热和/或激动剂激活会导致电导率显著增加,失去离子选择性,对大离子(如N-甲基-D-葡糖胺(NMDG+)、三羟甲基氨基甲烷(Tris+)和2-(甲基氨基)-乙醇(2-MAE+)具有渗透性,表明通道孔发生膨胀【2】。但是孔膨胀现象的原理仍然没有结构可以解释。


2023年8月30日,来自美国康奈尔医学院的Simon ScheuringNature上发表了题为“A pentameric TRPV3 channel with a dilated pore”的文章,通过使用高速原子力显微镜(HS-AFM),在单分子尺度上研究TRPV3通道,发现其可以在四聚体五聚体之间进行转换,并通过冷冻电镜解析了五聚体TRPV3的结构,发现了孔膨胀的结构原理。

作者选择TRPV3通道作为研究对象,将蛋白重新组装到脂质体上(图1a,用复染电镜观察蛋白脂质体),并使用高速原子力显微镜(HS-AFM)观察其分布状态,发现绝大部分呈现为四聚体形式(图1b),与以往解析的结构相吻合。


图1 将TRPV3组装到脂质体上并用高速原子力显微镜观察


同时,作者还额外发现有一部分TRPV3呈现为五聚体(图2a和图2b),这些五聚体每72度一个亚基,而经典四聚体的角度为每90度一个亚基(图2c)。同时五聚体形成的中央孔的直径增大(图2d)。


图2 五聚体TRPV3的组装形式


对单个TRPV3通道进行时间尺度上的观察,发现四聚体可以转变为五聚体(图3a),五聚体也可以转变为四聚体(图3b),并进行了数量上的总结(图3c)。通过添加可以使得孔膨胀的药物DPBA,发现五聚体TRPV3的比例显著增加(图3d)。


图3 TRPV3四聚体与五聚体之间的转变


为了获得五聚体TRPV3高分辨率的结构,作者在纯化蛋白融膜过程前添加DPBA,使五聚体的比例增加,再纯化蛋白,制备冷冻电镜样品。通过数据解析发现除了经典的四聚体结构(图4a)外,还可以在照片(图4b)中发现五聚体的颗粒(图4c),这些颗粒的二维平均也证实了五聚体的组装方式(图4d),并最终解析到了4.4 Å的五聚体TRPV3结构。不同于以往四聚体关闭(图4f)和开放(图4g)的结构,五聚体的TRPV3的孔直径显著增大(图4h),为TRPV孔膨胀的现象提供了结构基础。


图4 TRPV3四聚体与五聚体的冷冻电镜结构比较


原文链接

https://doi.org/10.1038/s41586-023-06470-1


参考文献

参考文献

【1】Khalil, M. et al. Functional role of transient receptor potential channels in immune cells and epithelia. Front. Immunol. 9, 174 (2018).


【2】Ferreira, L. G. B. & Faria, R. X. TRPing on the pore phenomenon: what do we know about transient receptor potential ion channel-related pore dilation up to now? J. Bioenerg. Biomembr. 48, 1–12 (2016).


供稿 | 朱盎岐

审稿 | 李浩田

责编 | 囡囡

排版 | 可洲


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