结构速递 | 一周“结构”要览 VOL.81(9.18~9.24)
上周发布了哪些“结构”文章？又取得了哪些科研进展？
结构速递栏目以每周“结构”相关领域刊文为主题，梳理一周结构发文大事记，“结构速递”为您传递最新、最快、最权威的结构资讯。
2023.9.18~2023.9.24
CNS刊登文章
01
Nature
2023/9/20
“Cryo-EM structures reveal native GABAA receptor assemblies and pharmacology”
A型γ-氨基丁酸受体（GABAAR）是大脑中的主要抑制受体，也是多种临床药物的靶点，包括麻醉剂、镇静剂、催眠药和抗抑郁药。然而，人们对GABAAR药理学的了解一直受阻于19个不同亚基可衍生出的大量五聚体组合以及临床相关受体结构知识的缺乏。
来自美国俄勒冈卫生与科学大学Eric Gouaux研究团队使用冷冻电镜揭示了GABAA受体的原生组装和药理作用。研究人员分离出了含有广泛表达的α1亚基的原生小鼠A型γ-氨基丁酸受体（GABAAR），并阐明了它们与治疗失眠（唑吡坦（ZOL）和氟拉西泮）和产后抑郁（神经类固醇异丙孕酮（APG））的药物复合物的结构。利用冷冻电镜（cryo-EM）分析和单分子光漂白实验，研究人员发现了大脑中的三种主要结构群：包含两个α1亚基的典型α1β2γ2受体，以及包含一个α1和一个α2或α3亚基的两种组合，其中包含单个α1的受体在跨膜和胞外结构域之间的排列更为紧凑。有趣的是，APG与跨膜α/β亚基界面结合，即使没有添加到样品中也是如此，这揭示了内源性神经类固醇在调节原生GABAAR中的重要作用。
原文链接
https://www.nature.com/articles/s41586-023-06556-w
02
Science
2023/9/21
“Structural basis for inactivation of PRC2 by G-quadruplex RNA”
Polycomb repressive complex 2 (PRC2)通过使组蛋白H3K27进行三甲基化来沉默基因。PRC2与许多前体信使RNA（pre-mRNAs）和长非编码RNA（lncRNAs）结合，具有对G-四链RNA的结合偏好性。
在这项研究中，来自美国科罗拉多大学博尔德分校的Vignesh Kasinath和Thomas R. Cech课题组合作解析了一个3.3Å分辨率的冷冻电镜结构，显示PRC2与G-四链RNA结合。值得注意的是，RNA通过同时结合两个PROMERS并诱导由两个催化亚基EZH2组成的蛋白质界面，从而阻止了核小体DNA相互作用和组蛋白H3尾部的可及性，从而介导了PRC2的二聚化。此外，EZH2的一个RNA结合环有助于RNA和DNA之间的交互，这是RNA调节PRC2的另一个活动。研究人员还发现了一个在EZH2的RNA结合环中的突变，这个突变可以增强PRC2的活性，从而激活了该复合物在斑马鱼中的功能。总之，这项研究揭示了RNA如何介导染色质修饰酶PRC2的调控机制，进一步丰富了我们对基因表达调控的理解。
原文链接
https://www.science.org/doi/full/10.1126/science.adh0059
03
Cell
2023/9/18
“CD1 lipidomes reveal lipid-binding motifs and size-based antigen-display mechanisms”
人体内有四种CD1抗原呈递分子，它们能够结合脂质抗原，用于向T细胞展示。来自哈佛医学院布莱根妇女医院的D. Branch Moody和黄守雄以及来自澳大利亚莫纳什大学的Jamie Rossjohn研究解析了这四种人类CD1抗原呈递分子的脂质组，为我们提供了自体脂质展示的地图。通过回答一个基本问题，研究发现有超过2000种CD1-脂质复合物，表明自体鞘脂和磷脂广泛呈现在其中。与肽抗原不同，许多脂质以未经化学处理的形式呈现。然而，每种类型的CD1蛋白质都会根据脂质的长度和化学成分差异编辑自体脂质组，以展示不同的捕获模体，这暗示了一般性的抗原呈现机制。具体而言，对于CD1a和CD1d，脂质的大小与CD1裂隙的体积相匹配。CD1c的裂隙大小更加变化多样，而CD1b则是个例外，其配体和裂隙存在极端大小不匹配，但这可以通过在一个裂隙中统一容纳两种小型脂质来解释。此外，构成综合CD1脂质组的化合物列表支持继续发现用于阻断脂质和T细胞抗原的脂质。这项研究为我们深入了解CD1系统如何展示脂质抗原以及与T细胞互动提供了重要见解。这有望为寻找新的脂质阻断剂和T细胞抗原提供有益信息。
原文链接
https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(23)00912-1
2023.9.18~2023.9.24
子刊刊登文章
01
Nature Structural & Molecular Biology
9.21
“Time-resolved cryo-EM (TR-EM) analysis of substrate polyubiquitination by the RING E3 anaphase-promoting complex/cyclosome (APC/C)”
02
Nature Communications
9.18
1. “Structure of human drug transporters OATP1B1 and OATP1B3”
9.18
2.“Molecular basis for bacterial N-glycosylation by a soluble HMW1C-like N-glycosyltransferase”
9.19
3.“Identification and characterization of endo-α-, exo-α-, and exo-β-D-arabinofuranosidases degrading lipoarabinomannan and arabinogalactan of mycobacteria”
9.20
4.“Synergism between CMG helicase and leading strand DNA polymerase at replication fork”
9.20
5. “Structural basis for the activation of a compact CRISPR-Cas13 nuclease”
9.21
6.“Structural basis of the activation of TRPV5 channels by long-chain acyl-Coenzyme-A”
9.21
7. “Thermodynamic forces from protein and water govern condensate formation of an intrinsically disordered protein domain”
9.21
8.“Organisation of the orthobunyavirus tripodal spike and the structural changes induced by low pH and K+ during entry”
9.22
9.“Acetylation discriminates disease-specific tau deposition”
9.22
10.“Structural basis of hydroxycarboxylic acid receptor signaling mechanisms through ligand binding”
9.22
11.“Determining subunit-subunit interaction from statistics of cryo-EM images: observation of nearest-neighbor coupling in a circadian clock protein complex”
9.22
12.“Structural insights into FSP1 catalysis and ferroptosis inhibition”
9.22
13.“Specific binding of GPR174 by endogenous lysophosphatidylserine leads to high constitutive Gs signaling”
9.23
14.“Single-chain dimers from de novo immunoglobulins as robust scaffolds for multiple binding loops”
9.23
15.“An inverse agonist of orphan receptor GPR61 acts by a G protein-competitive allosteric mechanism”
9.23
16.“Structure of the peroxisomal Pex1/Pex6 ATPase complex bound to a substrate”
9.23
17.“Structural basis for calcium-stimulating pore formation of Vibrio α-hemolysin”
Cell Research
本周无
Molecular Cell
本周无
Science Advances
本周无
作者 | 谭佳鑫
审稿 | 肖媛
责编 | 囡囡
设计、排版 | 可洲
推荐阅读
点击上方卡片
关注我们吧
END
我知道你“在看”哟