为什么癌症病人据肿瘤单细胞水平的异质性但是细胞系没有
在回顾2014的science关于GBM的单细胞转录组文章，DOI: 10.1126/science.1254257 标题是；Single-cell RNA-seq highlights intratumoral heterogeneity in primary glioblastoma 在附件看到了一幅我当时忽略的图。
我发现肿瘤细胞具有病人异质性但是细胞系没有：
如下所示：
可以很清楚的看到，不同病人的肿瘤细胞之间差异还是蛮大的，病人内部的细胞之间的相关性是高于病人之间的，所以可以看到这个聚类是病人内部细胞在一起。但是最右边的两个细胞系就不是这样的啦，两个细胞系虽然也是具有肿瘤细胞异质性，但是相关性要普遍高于病人的肿瘤细胞。
下载表达矩阵看看
在https://singlecell.broadinstitute.org/single_cell/study/SCP10/glioblastoma-intra-tumor-heterogeneity#study-download可以拿到文章的表达矩阵，是 Glioblastoma_expressed_genes.txt 是 log2(TPM+1) expression matrix for all cells profiled including 5948 genes with highest expression.
给大家一个作业吧，做出上面的相关性热图。
这个非常简单，千万不要告诉我你完成不了，任何理由在我看来都是借口，谢谢！（如果你确实没有学过R语言，处于对单细胞数据分析感兴趣的阶段，那就做一点文献搜索，看看有没有其它文章也提出过这个问题哈）
如果你对单细胞转录组研究感兴趣，但又不知道如何入门，也许你可以关注一下下面的课程
看完记得顺手点个“在看”哦！
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