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我们生信技能树联盟的关注粉丝已经有十多万了,作为创始人的我非常开心看到这么多人认可我们生信技能树的努力,通过我们的教程提升了自己。虽然,绝大部分粉丝都已经跨越了这个入门阶段,但还是希望你花时间看完这个活动,推荐给有需求的朋友。
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活动细则
爆款入门提供的是R和Linux基础知识学习
首先是LINUX学习
第1阶段:把linux系统玩得跟Windows或者MacOS那样的桌面操作系统一样顺畅,主要目的就是去可视化,熟悉黑白命令行界面,可以仅仅以键盘交互模式完成常规文件夹及文件管理工作。 第2阶段:做到文本文件的表格化处理,类似于以键盘交互模式完成Excel表格的排序、计数、筛选、去冗余,查找,切割,替换,合并,补齐,熟练掌握awk,sed,grep这文本处理的三驾马车。 第3阶段:元字符,通配符及shell中的各种扩展,从此linux操作不在神秘! 第4阶段:高级目录管理:软硬链接,绝对路径和相对路径,环境变量 第5阶段:任务提交及批处理,脚本编写解放你的双手 第6阶段:软件安装及conda管理,让linux系统实用性放飞自我
然后是R学习
了解常量和变量概念 加减乘除等运算(计算器) 多种数据类型(数值,字符,逻辑,因子) 多种数据结构(向量,矩阵,数组,数据框,列表) 文件读取和写出 简单统计可视化 无限量函数学习
其实彻底入门生物信息学可能需要12天
会使用unix系统及基本shell命令 有一个高性能的计算集群(服务器) 会用R进行统计分析和数据可视化。
Session I: Introduction to Unix / Orchestra and NGS Data Analysis Session II: RNA-Seq Part I Session III: RNA-Seq Part II Session IV: RNA-Seq Part III and Related Technologies and Tools Session V: ChIP-Seq Session VI: Variant Calling
学徒第1月,基础知识介绍掌握:文档链接:https://mubu.com/doc/38tEycfrQg 密码:vl3q 学徒第2月,RNA-seq数据分析实战训练:文档链接:https://mubu.com/doc/38y7pmgzLg 密码:p6fo 学徒第3月,WES数据分析实战训练:文档链接:https://mubu.com/doc/1iDucLlG5g 密码:7uch 学徒第4月,ChIP-seq数据分析实战训练:文档链接:https://mubu.com/doc/11taEb9ZYg 密码:wk29
给学徒ChIP-seq数据处理流程(附赠长达5小时的视频指导) 九月学徒ChIP-seq学习成果展(6万字总结)(上篇) 九月学徒ChIP-seq学习成果展(6万字总结)(下篇) 主要是依托于我在生信技能树/生信菜鸟团过去五年举办的各种NGS组学线上教学经验,相关推文目录是: lncRNA数据分析传送门 (2017-12-21) 450K甲基化芯片数据处理传送门 ( 2017-09-09) ChIP-seq基础入门传送门 ( 2017-08-13) 转录组入门传送门 ( 2017-08-07)
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