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两年过去了,你们的单细胞文章终于发出来了

生信技能树 单细胞天地 2022-06-07

最近在朋友圈看到非常多的报喜,都是单细胞相关课题的顺利结束以及文章的发表,不知道是不是因为疫情隔离期间的大半年的辛勤耕耘的结果。三年前我创立《单细胞天地公众号》开始大力宣传单细胞技术的前景,伴随着10X仪器的流行单细胞转录组技术也走入“寻常百姓家”。所以收到了越来越多的单细胞数据处理方面的求助,我也顺理成章的推出了两个课程,目前免费共享在B站视频:

全网第一个单细胞课程(免费基础课程)
  • 免费学习地址在B站:https://www.bilibili.com/video/av38741055 ,欢迎提问弹幕交流!
  • 务必听课后完成结业考核20题:https://mp.weixin.qq.com/s/lpoHhZqi-_ASUaIfpnX96w
  • 课程配套资料文档在:https://docs.qq.com/doc/DT2NwV0Fab3JBRUx0
技能树出品的第二个单细胞课程(进阶课程,仍然免费)
  • 详情请自行阅读介绍 https://mp.weixin.qq.com/s/bLfO-8ri_SNUepGs4UwRQw
  • 本课程长期答疑文档,https://docs.qq.com/doc/DT0FxbEpHYU5ZVlpu

因为课程涉及到知识点太多,所以我拆分成为了5个子课程,欢迎B站提问弹幕交流!全部链接是:

  • 「生信技能树」单细胞进阶数据处理之文献导读,链接是:https://www.bilibili.com/video/BV17f4y1R7N8
  • 「生信技能树」使用10X单细胞转录组数据探索免疫治疗,链接是:https://www.bilibili.com/video/BV1xD4y1S74P
  • 「生信技能树」单细胞基因组数据拷贝数变异分析流程,链接是:https://www.bilibili.com/video/BV1Yf4y1R75R
  • 「生信技能树」云服务器处理单细胞转录组数据,链接是:https://www.bilibili.com/video/BV154411Z7DU
  • 「生信技能树」使用Smart-seq2单细胞转录组数据探索小鼠性腺发育,链接是:https://www.bilibili.com/video/BV1454y1q77Z

我相信肯定是已经帮助了不少人,而且我很有信心,在完全免费后,能帮助更多的《单细胞天地公众号》以及《生信技能树公众号》的粉丝。

在这里我有一个学术请求,如果你对你的课题有一定的掌控能力,就是发表文章的时候说得上话,而且确实得到了我的代码和教程的帮助,或者在我们的平台咨询过单细胞数据分析相关的问题,希望你可以加上一个致谢,如下:

We thank Dr.Jianming Zeng(University of Macau), and all the members of his bioinformatics team, biotrainee, for generously sharing their experience and codes.

我们的教程覆盖面非常广泛

单细胞基础10讲

以及个性化汇总

cellranger流程相关

课题思路相关

还有:使用seurat3的merge功能整合8个10X单细胞转录组样本seurat3的merge功能和cellranger的aggr整合多个10X单细胞转录组对比

文献速递以及文献精读

单细胞天地每周发布1~2篇文献解读相关推文,希望大家紧跟前沿,学习 新的分析方法。


往期回顾

畅游Windows的Ubuntu子系统

在学生信这件事上我们还是坚持长期主义

CellChat:细胞间相互作用分析利器

R函数实现单细胞StackedVlnPlot

单细胞交响乐4-scRNA的归一化

scRNA-seq Clustering

Cell Ontology:解析细胞类型新维度

学生信只做数据分析不做湿实验发不了高分文章吗

外显子测序被Science评为年度十大突破的时候你在做什么

你还在花三五万做一个单细胞转录组吗?


如果你对单细胞转录组研究感兴趣,但又不知道如何入门,也许你可以关注一下下面的课程



看完记得顺手点个“在看”哦!


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