5月长非编码RNA重磅研究
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长非编码RNA是一类长度大于200nt的不编码蛋白质，而以RNA形式发挥功能的分子。 近几年，长非编码RNA成为疾病，特别是肿瘤研究中的热门，重磅成果频出。本月，小编为大家带来的是长非编码RNA的最新综述和研究成果解读。
1. Nature Reviews Genetics：Towards a complete map of the human long non-coding RNA transcriptome
正确和完整的lncRNA注释是lncRNA研究的基础。虽然越来越多的研究表明lncRNA在生命过程中发挥重要作用，但是目前我们仍不能精确的鉴定lncRNA的数量和种类。lncRNA在测序技术中难以被全面的鉴定，主要有3个原因：1.lncRNA的表达量相对较低，这使得在无偏好性的测序分析中，它们难以被检测到。2.我们对lncRNA的序列功能知之甚少，难以通过类似寻找蛋白编码基因的开放阅读框ORF的方法从DNA序列上鉴定lncRNA。3.lncRNA普遍保守性较低，难以从序列相似性上寻找它们的同源基因。
尽管困难重重，但是新技术的开发使我们有望完整的认识lncRNA。该综述详细的介绍了在鉴定lncRNA上的困难与突破。
2. Nature Genetics：Analysis of the androgen receptor–regulated lncRNA landscape identifies a role for ARLNC1 in prostate cancer progression
雄激素受体在正常前列腺的发育以及前列腺癌的发生发展中发挥了非常重要的作用。来自美国的科学家在nature genetics上发表受雄激素受体调控的lncRNA研究，见下图：
研究者利用RNA-seq技术鉴定了一批在前列腺癌中受雄激素受体（AR）调控的基因，并结合CHIP-seq技术分析得到了直接受AR调控的基因，并主要分析了长非编码RNA的表达，发现长非编码RNA ARLNC1差异受AR调控最明显（下图），并将其作为接下来研究的主要对象。
研究者利用siRNA敲低ARLNC1，并进行了RNA-seq，通过聚类分析，发现AR信号通路发生了明显的改变，说明ARLNC1调控了AR信号通路。
那么，ARLNC1是如何影响AR信号通路的呢？由于长非编码RNA被报导可以通过直接或间接的RNA-RNA互作影响基因的表达，因此研究者利用IntraRNA网站分析了可能与ARLNC1互作的RNA分子。有趣的是，ARLNC1与AR基因的3UTR存在碱基互补配对，说明ARLNC1可以结合AR的mRNA。研究者利用荧光原位杂交技术进行了验证。
研究者发现ARLNC1与AR的互作会影响AR mRNA在细胞质中的丰度，进而影响AR的蛋白表达水平。在体内和体外实验中，研究者也证明了ARLNC1可以通过促进AR的表达发挥癌基因的作用。
3.nature communication: Activity dependent LoNA regulates translation by coordinating rRNA transcription and methylation.
核糖体对细胞内蛋白质的合成是不可缺少的。但是关于翻译的机器如何满足细胞内的需求变化，仍不清楚。来自中科大的研究者在nature communication上发表相关文章，发现长非编码RNA LoNA在rRNA生成过程中发挥重要作用。
研究者通过富集核仁，并对核仁中的RNA进行测序分析，发现核仁中有很多非编码RNA，其中长非编码RNA LoNA在核仁中显著富集，并且与rRNA的转录和蛋白翻译相关。
LoNA是如何影响rRNA的呢？研究者利用RNA pull down技术，发现LoNA与NCL蛋白互作，而NCL蛋白与rRNA的转录相关。
那么，LoNA又是如何影响蛋白翻译效率的呢？研究者发现LoNA可以影响多聚核糖体的分布，进而影响蛋白的翻译过程。
有趣的是，LoNA还可以影响神经突触的可塑性。神经突触与学习能力和记忆力息息相关，那么，LoNA是否会影响学习能力呢？研究者发现敲低LoNA可以提高小鼠的学习和记忆能力。说明LoNA有可能在神经退行性疾病中发挥重要作用，并成为治疗的靶标。
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