Science:利用新方法SPLiT-seq对发育中的小鼠脑部以及脊髓进行单细胞分析
自300年前列文虎克第一次对活细胞进行描述以来,一直到现在为止,我们对细胞类型及其功能仍然没有一个完整的细胞目录。
近年来,随着单细胞转录组测序技术的发展,单细胞转录组表达水平的高低已经成为了一种新的鉴别细胞类别的方式。单细胞RNA-seq(Single-cell RNA-seq (scRNA-seq))已经分析了正常或者疾病组织中成千上万的单细胞,但是,这些方法仍旧存在许多的问题,比如说实验成本。
研究者在本文中提出了一种新的单细胞RNA-seq方法--SPLiT-seq(split-pool ligation-based transcriptome sequencing (SPLiT-seq)),这种方法可以通过组合barcode来标记RNA的细胞来源。同时,SPLiT-seq可以与固定好的细胞或者核兼容,所以,可以高效的对样品进行重复检测,而不需要多余的设备。
在本文献中,研究者们对出生后第2天和第11天的小鼠脑和脊髓的156,049个单核进行转录组分析,发现了100多种细胞类型。SPLiT-seq给我们提供了一种单细胞转录组分析的新方式。
参考文献:
Single-cell profiling of the developing mouse brain and spinal cord with split-pool barcoding. Science. 2018 Mar 15. pii: eaam8999. doi: 10.1126/science.aam8999.
封面图片来源于视觉中国网站
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