纪念英国Sanger研究所辉煌25周年,25 Genomes Project启动!
英国Sanger研究所于1993年由人类基因组计划主导者John Sulston教授发起,威康信托和英国医学研究委员会共建,是世界上最为知名的基因测序中心之一,也是基因组学领域的领导者之一。
为庆祝2018年即将到来的25周年纪念,Sanger研究所近日推出25 Genomes Project。
25 Genomes Project作为是探索全球生物基因组的一部分,研究结果将对公众开放,其主要目的是研究英国本土最具代表性、从未被测序的25个物种,从黑莓到知更鸟,灌丛蟋蟀到褐鳟,这25个物种都生活在英国,代表着这个国家物种的丰富性。
通过这个项目,科学家们将更好地了解它们是如何到达英国,如何进化,以及不同物种如何适应不断变化的环境。可以了解英国的生物多样性,以期进一步保护和维持物种的多样性和生态平衡。
Sanger研究所联合了高校、科研机构和测序公司共计26家机构一起参与,包括illumina、PacBio、10X Genomics、伦敦自然历史博物馆、爱丁堡大学、诺丁汉特伦特大学、EMBL-EBI等。
有意思的是,Sanger研究所的合作伙伴中,测序大腕Illumina、Pacific Biosciences (PacBio)、10x Genomics都位列其中。可以预期的是,PacBio的长读长将会在这项计划中大放异彩,然而同样以读长闻名的三代测序新秀,总部位于英国牛津的Oxford Nanopore公司则不见踪影。
25 Genomes Project迈出了破解全球生物基因组密码的第一步。
高质量的基因组将为科学家打开一扇大门,从而了解英国物种对环境压力的反应,以及它们遗传学中的秘密,从而揭示它们何以在自然界繁荣或者濒临灭绝。
Sanger研究所所长Mike Stratton教授说:“我们的星球上有多少物种可以在未来几十年内被测序?原则上都可以。这个项目由此深思熟虑而来,我们正在着手对地球上所有生命进行测序。”
Mike Stratton教授
25 Genomes Project被切割为“20+5”模式。已有20个物种确定将被测序(详细列表见文末),主要涵盖五大类:
繁盛物种(Flourishing)
在英国数量稳步上升的物种
濒危物种(Floundering)
濒危或数量减少的物种
危险物种(Dangerous)
入侵物种或有害物种
代表物种(Iconic)
提到英国就会想到的标志性物种
神秘物种(Cryptic)
形态上无法区分,但遗传结构差异明显、生物学特性明显不同的物种
另外,还有5个物种,Big Five,将直接以投票的形式由公众和学生共同投票选出:
投票时间:
2017年11月6日~2017年12月8日
参与口号:
I’m a Scientist, Get Me Out of Here
投票链接:
https://25genomes.imascientist.org.uk/
Sanger研究所在基因组研究领域的领导地位毋庸置疑。
1998年,第一个多细胞真核基因组,线虫基因组完成,该计划由Sanger研究院和华盛顿大学基因组测序中心合作完成。
2001年,第一个人类基因组计划完成,23对染色体中,有8对由Sanger研究所及合作者完成解析;
2013年,重要模式生物斑马鱼参考基因组测序完成,并深入解析了斑马鱼蛋白编码基因的功能;
2018年,建所25周年,值得期待。
25 Genomes Project已选定的20个物种
/End.
生信者言推荐阅读
扫码关注,获取更多精彩内容
我
是
彩
蛋
喜马拉雅FM搜索并订阅:生信者言;收听内容:
《一分钟听懂NGS基础概念》,让生信分析不再遥不可及
《亲爱的姑娘,你值得被温柔以待》,11个真实的人物故事
《众病之王:癌症传》,一起聆听人类对抗癌症的斗争史
回复文字:果然科学,看一篇好玩的科普文。