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纪念英国Sanger研究所辉煌25周年,25 Genomes Project启动!

sxzy 生信者言 2022-03-29

英国Sanger研究所于1993年由人类基因组计划主导者John Sulston教授发起,威康信托和英国医学研究委员会共建,是世界上最为知名的基因测序中心之一,也是基因组学领域的领导者之一。


为庆祝2018年即将到来的25周年纪念,Sanger研究所近日推出25 Genomes Project。

25 Genomes Project作为是探索全球生物基因组的一部分,研究结果将对公众开放,其主要目的是研究英国本土最具代表性、从未被测序的25个物种,从黑莓到知更鸟,灌丛蟋蟀到褐鳟,这25个物种都生活在英国,代表着这个国家物种的丰富性。


通过这个项目,科学家们将更好地了解它们是如何到达英国,如何进化,以及不同物种如何适应不断变化的环境。可以了解英国的生物多样性,以期进一步保护和维持物种的多样性和生态平衡。

Sanger研究所联合了高校、科研机构和测序公司共计26家机构一起参与,包括illumina、PacBio、10X Genomics、伦敦自然历史博物馆爱丁堡大学、诺丁汉特伦特大学EMBL-EBI等。


有意思的是,Sanger研究所的合作伙伴中,测序大腕Illumina、Pacific Biosciences (PacBio)、10x Genomics都位列其中。可以预期的是,PacBio的长读长将会在这项计划中大放异彩,然而同样以读长闻名的三代测序新秀,总部位于英国牛津的Oxford Nanopore公司则不见踪影。

参与25 Genomes Project的学校


25 Genomes Project迈出了破解全球生物基因组密码的第一步。


高质量的基因组将为科学家打开一扇大门,从而了解英国物种对环境压力的反应,以及它们遗传学中的秘密,从而揭示它们何以在自然界繁荣或者濒临灭绝。


Sanger研究所所长Mike Stratton教授说:“我们的星球上有多少物种可以在未来几十年内被测序?原则上都可以。这个项目由此深思熟虑而来,我们正在着手对地球上所有生命进行测序。”



Mike Stratton教授



25 Genomes Project被切割为“20+5”模式。已有20个物种确定将被测序(详细列表见文末),主要涵盖五大类:

繁盛物种(Flourishing)

在英国数量稳步上升的物种

濒危物种(Floundering) 

濒危或数量减少的物种

危险物种(Dangerous)

入侵物种或有害物种

代表物种(Iconic) 

提到英国就会想到的标志性物种

神秘物种(Cryptic) 

形态上无法区分,但遗传结构差异明显、生物学特性明显不同的物种




另外,还有5个物种,Big Five,将直接以投票的形式由公众和学生共同投票选出:


投票时间:

2017年11月6日~2017年12月8日

参与口号:

I’m a Scientist, Get Me Out of Here

投票链接:

https://25genomes.imascientist.org.uk/



Sanger研究所在基因组研究领域的领导地位毋庸置疑。


1998年,第一个多细胞真核基因组,线虫基因组完成,该计划由Sanger研究院和华盛顿大学基因组测序中心合作完成。


2001年,第一个人类基因组计划完成,23对染色体中,有8对由Sanger研究所及合作者完成解析;


2013年,重要模式生物斑马鱼参考基因组测序完成,并深入解析了斑马鱼蛋白编码基因的功能;


2018年,建所25周年,值得期待。


25 Genomes Project已选定的20个物种




/End.


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回复文字:果然科学,看一篇好玩的科普文。

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