生物信息可视化软件公司Genialis完成230万美金融资，加快商业步伐！
美东时间11月13日，位于休斯顿的生物信息可视化云软件供应商Genialis公司宣布，完成种子轮融资230万美金。
本次融资将主要用于加速该团队在美国的扩张和Genialis平台的商业化。
生物云计算近年来发展快速，国外有SevenBridges Genomics、 DNAnexus等公司，而国内市场近期也涌现出例如拓美科DodoGene、烈冰NovelBrain®-Legend、百迈客云BMKCloud、华大BGI Online、聚道GeneDock、美吉I-Sanger等可视化生信分析平台与工具；借此背景，生信者言梳理Genialis的发展与相关产品信息，以供业内人士参详。
发展背景
早在2011年，Genialis诞生于卢布尔雅那大学 Blaž Zupan教授的生物信息学实验室。与美国贝勒医学院的研究人员合作，开发了一个转录组学数据可视化工具dictyexpress(1.0版本)。
Blaž Zupan教授
2013年9月成立Genialis公司。目前，该公司正式总部设在休斯敦，在斯洛文尼亚拥有全资子公司，负责软件开发。
公司网址：http://www.genialis.com
Blaž Zupan教授实验室页面链接中的
数据分析工具
Orange：https://orange.biolab.si/
Open source data visualization and analysis for novice and experts. Data mining through visual programming or Python scripting.
dictyExpress：http://dictyexpress.biolab.si/
An interactive search and exploration tool for the BCM Dictyostelium gene expression database.
GenePath：http://www.genepath.org/
Intelligent assistant for qualitative epistasis analysis and inference of genetic networks.
Genialis团队部分成员
公司的愿景是让所有的数据利益相关者，从实验者到数据科学家，对数据的发现过程拥有所有权并贡献他们的专业知识。Genialis着重于提供最好的用户体验保证大规模和可重复的高通量测序数据分析，并希望使研究人员通过实时交互可视化的工作流程，能更自主地分析他们的数据，释放他们的创造力，同时更有效、更自由地进行协作。
Genialis为科学家建立最直观的数据分析软件
产品信息
对于较大的机构，Genialis提供其完整的软件系统，该系统包括全面的可视化分析和生物信息工具、第三方软件集成及企业级安全部署；
对于个人实验室，Genialis可以提供他们需要的定制化应用模块。
企业平台与云端应用程序都是由相同的核心技术驱动的，具有许多共同的特性和功能。两者都拥有开源的Resolwe数据流引擎和 Real Time Interactive Visualizations，以促进科学探索和发现。
Genialis的开源项目Resolwe
Resolwe是Genialis的一个开源项目，Resolwe的目标是提供一个分析复杂数据流的强大、灵活的方法；共享数据分析pipeline和生物信息学专业知识；促进开源软件框架合作。
不论是在云端进行数据分析，还是本地分析，计算资源都可以很好的应对。并且，Resolwe在Apache 2.0开源许可证下是免费的。Resolwe也是通用的，即可以运行任何领域的任务。Genialis提供了一个称为 Resolwe Bioinformatics的pipeline package，具有多种生物信息学分析程序。
Disease variant discovery
其实早在2009年，贝勒医学院与卢布尔雅那大学合作盘基网柄菌群(Dictyostelium group)项目，即开发出dictyexpress1.0版本[PMID: 19706156 ]，用Web应用程序进行转录组学数据分析的探索。
1.0版本的问题在于不支持新数据的添加，服务器端需要对数据库进行手动更改；用户不能开发新的pipeline；扩展平台，包括其他的物种是很复杂的，在服务器端不灵活；此外，在服务器端不灵活，无法到其他物种的数据分析。
2017年6月发表于BMC Bioinformatics杂志的文章 dictyExpress: a web-based platform for sequence data management and analytics in Dictyostelium and beyond，详细介绍了dictyexpress2.0版本[PMID:28578698]，用于分析基因表达数据、ChIP-seq数据等。
另外，Genialis还与一个NGS文库试剂盒公司Swift Biosciences建立合作，为用户提供定制化的目标基因组测序（Genialis公司官网有视频介绍）。
该公司还与美国罗切斯特大学、德国勃林格殷格翰制药公司和伦敦大学学院、Diagenode公司等建立合作。
Accel-NGS® Adaptase™ Module enables an efficient NGS workflow for single-cell WGBS
种子轮融资
该轮融资由位于苏黎世的Redalpine创投(Redalpine Venture Capital)和波士顿的First Star创投（First Star Venture Capital）共同领投，斯洛文尼亚公司Pikasd.o.o跟投。
First Star创投的Drew Volpe如此解释这次融资：
“我们对Genialis团队印象深刻，他们结合了计算机科学和生物学的专业知识，以及强大的客户驱动的产品意识，在这个领域非常罕见。这反映了他们对每天使用他们的平台的科研人员的热情。”
／End.
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回复文字：果然科学，看一篇好玩的科普文。