基因云平台DNAnexus完成5800万美元E轮融资,微软战略投资 | 明日之星
关键字:DNAnexus 基因大数据平台 E轮融资
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导语
2018年1月3日,DNAnexus宣布正式完成5800万美元E轮融资。本轮融资由Foresite Capital领投,微软、GV(原谷歌风险投资公司)、TPG Biotech、药明明码、Claremont Creek Ventures和MidCap Financial跟投。其中,微软为战略投资,药明明码(WuXi NextCODE)是继2015年4月其集团公司药明康德投资继续跟投DNAnexus。
融资企业:DNAnexus
投资机构:Foresite Capital、GV、TPG Biotech、药明明码、Claremont Creek Ventures、MidCap Financial、微软
融资轮次:E轮
融资金额:5800万美元
DNAnexus本次融资,是继2015年4月获得药明康德投资1500万美元后,新一轮融资。自2009年以来,DNAnexus获得融资总额达1.4亿美元。
DNAnexus表示,这笔资金将有助于公司扩大临床试验和技术开发,包括支持Illumina NovaSeq二代测序系统的Mosaic微生物组研究平台和CloudSeq软件工具等。
DNAnexus首席执行官Richard Daly表示:“融资有助于进一步发展和推出我们的转化医学解决方案,并扩大我们在临床试验基因组数据云基础管理方面的业务。下一波生物医学领域的真知灼见来自跨机构合作,这种合作伴随着快速增长的多组学数据。”
DNAnexus的成立可以追溯到2009年的斯坦福大学,位于湾区三藩市山景城,离谷歌总部不远(2017年产业盘点第三辑,内含DNAnexus年度大事件)。DNAnexus是一家B2B的基因大数据公司,为基因公司的大数据分析和管理提供云平台服务。
DNAnexus是较为成熟的基因云平台公司。基因云,顾名思义是将云计算应用于基因数据领域,包括云存储、云计算、交付、交易等。其中云计算属于SaaS或PaaS,重点不是纯计算,而是将生物信息软件、工具、流程等部署到云平台,实现模块化、自动化和可视化等。自多年前,DNAnexus开始与国内的药明明码(药明康德集团旗下企业)等公司合作,为药厂、科研院校等机构提供基因大数据的云平台服务。
1. 数据快速上传到云端
提供了多种上传方式,包括命令行上传,通过网络平台上传,从URL获取,或通过DNAnexus API直接上传
从流程任何阶段进行多线程数据上传,包括直接来自测序仪的数据
可进行自动校验,确保数据完整性
2. 构建自定义生物信息流程或流程迁移
将本地流程移植到云端,可上传和存储任何测序文件类型
提供开放的API和SDK命令行、Web界面,可视化操作的系统应用程序,可鼠标拖放式快速构建工作流程
提供Javascript工具包,快捷简单地将应用程序与DNAnexus集成
通过SSH访问工作节点进行调试;可在云端启动一个开发工作站
3. 细颗粒度的权限管理和数据工具分享
进行不同角色的数据细颗粒度访问的权限控制
建立用于基因组数据分析协作的在线环境
建立数据和应用程序共享的标准格式
发布自定义工具和流程,并与协作者共享
支持上游(如LIMS)和下游(如临床报告和可视化)集成,开放API和SDK
4. 数据安全
所有的数据加密
通过ISO 27001和27002认证,流程可追踪以确保可审计和可重复,双因素认证
单点登录(SSO)支持(SAML)
OAuth2支持
5. 其他特点
符合以下要求:HIPAA、CLIA、GCP、21 CFR第11、58和493部分,欧洲数据隐私法律和法规
提供了针对Microsoft Azure和Amazon Web Services上成本和时间优化实例类型的策略
支持1000个节点和数百万个对象
分析21种不同的实例类型
可提供GPU实例类型
流程管理:版本控制,标准错误日志,标注数据标签和属性
可支持项目、团队级别的成本核算
DNAnexus官网显示,应用场景主要包括生物制药研发、基因组中心。为诊断试剂研发和测序服务商提供不同的定价和服务。
核心团队
CEO
Richard Daly在医疗保健和基因组学方面拥有三十年的建设经验,其中包括在Baxter实验室工作13年。近年经常高频亲自往来中国参与云平台项目落地。
CMO
David Shaywitz作为首席医疗官,负责推动临床合作与管理,同工程团队以及外部合作伙伴进行密切的合作。
CTO
Balaji Venkateswaran 拥有超过20年的高度可扩展软件产品的构建经验。
首席云负责人
Omar Serang 拥有数十年建立全球运营团队和基础架构的经验,包括Amazon Web Services的云计算,Topsy Labs的社交网络实时分析服务等。
Foresite Capital是全球精准医疗领域知名的风险投资机构,在旧金山和纽约均设有办事处。专注于数据科学和机器学习等技术,在生物学和医疗保健方面的投资。投资Protfolio包括PacBio、Natera、Juno、Grail、Editas、Intellia Therapeutics等知名的精准医疗领域公司。
基因云平台,或者生物信息云平台,或者生命科学大数据平台,简单来讲,是将云计算模式应用到基因组、微生物组等数据上。主要实现的核心场景包括初级的计算、存储和交付,还包括后续的数据多中心管理、数据共享甚至数据交易等。这对于目前消费级基因数据和药厂的合作、肿瘤基因检测和临床试验的整合以及遗传病多中心诊断的应用都是至关重要的。目前国内这方面的独角兽屈指可数。笔者曾在2012年参与华大基因早期云平台的研发,以及DNAnexus合作者兼投资者药明明码的云平台的运营,有幸见识早期国内生物云的雏形,未来仍有很大空间需要挖掘,包括队列数据的管理、机器学习模块的嵌入、数据共享等。基因慧作为深圳市生物信息云计算产业促进会中32家会员单位之一 (详情) ,定位为数据决策机构,将重点持续关注生命科学大数据领域,欢迎合作交流。(基因慧 布三少)
参考链接
1.https://www.dnanexus.com
2.http://yourmap.net.cn/index/info/id/1598
2.https://www.crunchbase.com/organization/dnanexus
3.https://www.genomeweb.com/search/content/DNAnexus
编者:Candice | 校对:Cindy | 审核:尘灰
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