分子诊断实验室的信息化:从全民核酸走向全民健康还有多远?
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基因慧
在过去的一年中面对突发疫情,依托于各医疗机构、疾控机构的分子诊断实验室,提供了不可或缺的核酸检测能力,为实现大规模核酸检测乃至全员核酸检测提供了基础。在疫情防控常态化下,“十四五”规划纲提出2035远景目标:全面推进健康中国建设,这些应急时期的“产物”,有望通过信息化联网和技术升级等措施,在原有基础上发挥更大作用。分子诊断实验室的信息化将从全民核酸走向全民健康,这其中有多远的路要走?本文简析如下。
文章 | 基因慧 作者 | 朱指导 编辑 | vladmir 关键词 | 核酸检测 实验室信息系统图:实验室信息化场景(来源/华大智造)
3月12日,新华社全文发布《中华人民共和国国民经济和社会发展第十四个五年规划和2035年远景目标纲要》(以下简称该纲要)。该纲要涉及19篇,65个章节,20个专栏119项任务,以“全面推进健康中国建设”为主要目标。在专栏17的全民健康保障工程中列出了6项任务,其中第一项就是启动中国疾病预防控制中心二期项目,依托现有疾控机构建设15个左右区域公共卫生中心,升级改造20个左右国家重大传染病防控救治基地、20个左右国家紧急医学救援基地。
那么,从长远来看,在疫情期间建设的应急核酸检测力量,有没有可能转化为常规的公卫防控基础建设?如何贯彻落实“平时能服务、急时能应急、战时能应战”的“平战结合”方针?让我们从核酸检测的信息化管理谈起。
大规模检测的难点之一在于大人群信息的高效采集和统一管理。传统的人工录入和采集方法,费时费力,还容易出错。通过专业采样工具包、终端电脑和手机APP的电子录入方式,可以单独针对样本采集这一步骤实现信息化,已在实践中受到了广泛认可。由此及彼,在全民健康时代的个人信息采集、录入和统一管理,也可以基于这一基础加以推行和实现。
在《全员新型冠状病毒核酸组织实施指南》中,不仅对采样环节提出信息采集系统的明确要求,也明确提出:完善采样、运输、检测、结果报告、阳性样本跟踪等全环节的信息化建设。从单一步骤的信息化,到全流程的信息化,其重要性和便捷性不言而喻。全员核酸检测在武汉、青岛、石家庄等地的成功开展,为全民健康的落地,提供了宝贵的经验。
进一步地,在信息化采集和全流程信息化的基础上,搭建信息化管理网络将成为重中之重。通过核酸检测实验室的信息化网络,能够动态全面掌握各地各核酸检测机构基本情况和日检测能力,根据全员核酸检测启动地的需求进行科学、合理调配资源。这一点与医疗领域正在推进的智慧医院建设理念不谋而合。据了解,3月15日国家卫健委印发《医院智慧管理分级评估标准体系(试行)》,其中无医院管理信息系统视为0级,从开始运用信息化手段开展医院管理(1级)起步,到初步建立医院智慧管理信息系统、实现高级业务联动与管理决策支持功能(5级),不仅为各地各医院加强信息化建设提供了指导,也为核酸检测实验室的信息化建设提供了参考。
据《独立医学实验室资讯》不完全统计,现有的核酸检测力量大多来自医院、疾控和第三方实验室(见表1),但尚未形成系统化的防控网络。究其原因,各个核酸检测实验室之间相对独立,各分支机构所属的机动核酸检测力量相对分散,仅在紧急情况下可以快速集中支援。如何确保紧急情况下的统筹效果?除了加强应急演练以外,面对数量如此之多的实验室,还应重视信息化管理技术,积极搭建实验室信息化管理网络。
表1 全国核酸检测力量估算
(来源/独立医学实验室资讯)
通过对实验室信息化网络的搭建,不仅能够将各地核酸检测能力发挥到极致,还可以建立疫情监测响应系统、多点触发预警系统,为全民健康保障工程奠定坚实的基础。
而且,随着各地实验室能力的不断提升,从常规的核酸检测功能,到具备必要的未知病原筛查能力、病毒基因溯源分析能力,这些必要的升级均需基于一套成熟且稳定的信息化建设基础,才能减少底层基础信息的重复录入,并为不同维度的数据联结、数据挖掘和安全共享创造条件。
根据年初在毗邻河北的平定县搭建防控网络的实战经验,山西省已在2月初开始推行“健康山西网络实验室管理信息系统”的建设,利用5G技术实现大人群信息高效采集、自动化检测报告生成与推送、阳性预警联动多点触发、实验室饱和度监测等功能。据悉,该信息化系统将部署在山西省政务云,由网络实验室管理中心、实验室管理客户端、样本信息采集客户端三部分组成(见图1)。
图1 健康山西网络实验室管理信息系统的搭建理念示意图
(来源/华大智造)
面对突如其来的新冠疫情,各省市和地方政府都采取了相应的应对措施。从社区到街道办事处,从健康码到大数据管理平台,疫情促进了基层信息化建设,也为全面推进健康中国建设提供了信息化建设的基础。
疫情期间,针对新冠检测全流程的信息化管理,华大智造提供了以火眼实验室为标准的ZSM COVID智能信息采集系统和ZLIMS COVID火眼实验室系统。通过这两个系统,不仅能够实现多元化采集,而且还可以实现从信息录入到报告输出的全流程数字化管理,满足大规模样本核酸检测的需求,同时提供可视化的看板功能,支持多地联动和集中调度。
现在,基于这一整套成熟的实验室信息化系统,华大智造推出完整的分子诊断实验室信息化建设产品组合,包括三部分:样本信息采集客户端(含手机APP、采样工具包和PAD终端)、实验室管理客户端(ZLIMS实验室管理客户端工作站1台、含核酸检测实验室管理功能和测序实验室管理功能,条码打印机1台、扫描枪等)、网络实验室管理中心(含ZLIMS实验室管理客户端工作站1台、管理监控头工作站1台)。
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☆ 发布产业大数据平台优脉通YourMap
☆ 中国遗传学会生物产业促进委员会委员
☆ 发布数十份基因及数字生命健康领域行研报告
☆ 主办数字健康私董会、大湾区生命健康创新论坛
☆ 广东省精准医学应用学会政策研究应用分会常务委员
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