SNP Meta（四）—数据库寻找靶基因

找个idea，好难？

没事，我们有大数据呢！看看猴哥是怎么利用大数据选题的！

选题就是找个gene snp位点 和疾病进行配对哦，前提是要相关（有易感性），从病因、发病机制、病理上能说得清楚，这一点在成文中的前言和讨论中显得尤为重要。

先看OMIM数据库（遗传学）

--猴哥，来个糖尿病DM嘛

--好的

找到了位点哦

哇塞，这个位点上有好多gene啊，还有功能介绍

--猴哥，来个肿瘤的

--好的，大肠癌的看看

--哇塞，这么多gene 和大肠癌相关啊

--嗯啊，快把这些基因用excel装起来，查查别人写没有（猴哥）

--恩，好的

--上面的我会了，来个gene吧

--好勒，pd1在路上呢（猴哥）

--可以写pd-1与 ms dp sle哦，猴哥已经查了，没有同学写哦，想写的加快速度哦（猴哥）

--国内有没有可以用的数据库？

--有的哦，你看看GCBI，或许有收获哦！

--做gene snp 和肿瘤的meta分析最多了，那个数据库管用？

--cosmic  （肿瘤学的人都知道）

--找到了这么多基因，这么多疾病，怎么办呢？

--将gene 纵向排列，将疾病横向排列（猴哥），然后 组成一个 i行j列的表，然后我们可以写的文章数就是 i×j哦，别人写过的snpmeta就标记1，最后我们能写的就是i×j-N。

--这就是snpmeta能写这么多的“破剑式”！

META专栏主编

猴哥：Freescience公众号meta分析栏目现任主编。副主任医师，武汉大学肿瘤学博士，专注于胃肠道肿瘤分子生物学机制、系统评价/Meta分析、数据挖掘、临床统计研究。

想跟猴哥一起讨论meta话题？

猴哥qq：65498065

还有freescience meta交流群，欢迎加入哦

Freescience meta交流群

加小秘书后拉进去

点开并长按二维码加小秘书为好友

科学自由共享投稿请扔至[e-mail]

未经许可 不得转载长按二维码关注