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体系课1课表出炉|一站式掌握36个实用数据库,筛选你最中意的分子

TBM学院 肿瘤标志物学术前沿 2022-07-02
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关于肿瘤标志物挖掘技术与应用体系课

由肿瘤测序及大数据分析专家委员会倾力打造,已搭建9大课程体系及主体课程内容,涵盖从基础的公共数据库使用分析,到高阶的组学测序数据挖掘。既有基础理论、实操讲解,还有研究设计与实例解析,更有独创分析方法/数据库讲解。学员可根据自身研究方向及实际科研需求选择多种课程。


体系课学术指导委员会(按姓氏拼音排序)


关于体系课1-“肿瘤标志物研究的实用数据库资源”

您将学到什么

在本课程中,您将认识并操作29个常用公共数据库以及7个自主开发数据库。本次课程将带你了解6个层面的数据以及相关数据库,包括基因表达、突变、表观遗传、非编码RNA调控、信号通路和转录调控。您将掌握如何查询并使用这些数据资源,学习如何在科研或文章中应用这些数据。将学会如何通过综合运用这些资源筛选相关肿瘤标志物。


体系课1-“肿瘤标志物研究的实用数据库资源”

讲师团队




  郭安源  教授

华中科技大学生命科学与技术学院教授、博导

国家自然科学基金委“优青”(2018)和教育部新世纪优秀人才(2012)获得者。研究方向为生物信息学,癌症基因组学;包括肿瘤多组学数据挖掘及表达调控网络分析方法和数据库构建,及其在肿瘤和细胞外囊泡中的应用研究。主要研究成果:在数据库构建、miRNA和转录因子共调控网络分析、癌症基因组挖掘和细胞外囊泡调控等方面有深入研究。围绕转录因子和非编码RNA建立了一系列有一定国际影响的数据库,如AnimalTFDB、hTFtarget、miRNASNP、lncRNASNP和EVmiRNA等(http://bioinfo.life.hust.edu.cn/)。发展了转录因子和miRNA共调控前馈环模块方法(FFLtool),发现了白血病和肿瘤微泡中的重要调控因子。开发了基因集的癌症多组学分析平台GSCALite、特异表达基因工具SEGtool、T细胞丰度预测方法ImmuCellAI、癌症细胞系鉴定方法CCLA和TCR丰度预测方法CATT等。发表论文70余篇,总引用5000余次(google)。近5年来以通讯作者在Advanced Science、Nucleic Acids Research、Cancer Research、Bioinformatics等期刊发表论文30多篇。




  柳纯洁  博士

华中科技大学遗传学博士毕业,目前是郭安源教授实验室博士后。主要从事癌症基因组学数据挖掘以及生物信息工具和数据库的构建。构建了癌症基因集分析平台GSCALite,miRNA和RNA在癌症和正常组织表达谱展示工具GEDS,miRNA相关SNP数据库miRNASNP以及snoRNA表达和泛癌临床相关数据库。发表SCI论文10余篇。




  胡 慧  博士

生物信息学博士毕业,目前为郭安源教授实验室博士后。研究方向主要为转录因子和转录调控研究,通过高通量测序数据分析(包括RNA-Seq、miRNA-Seq、ChIP-Seq、BS-Seq)、miRNA-TF-靶基因共调控网络以及相关功能分析探究疾病机制。胡慧博士构建了动物转录因子数据库AnimalTFDB3.0,研究了CAR-T治疗前后转录谱差异以及调控网络,探究了3D细胞逆分化初步机制以及肝癌致病的部分机理等。已发表第一和共一作SCI论文4篇。




  谢贵燕  博士

生物信息专业博士研究生。研究方向为生物信息数据库构建以及非编码RNA调控网络分析,整合了miRNA靶基因数据,开发了转录因子和miRNA在复杂疾病中的网络研究平台(FFLtool,Bioinformatics 2020)。


体系课1-“肿瘤标志物研究的实用数据库资源”

课程内容


第一部分


  基因及表达、突变数据库

理论课:2h;实操课:1.5h

授课老师:郭安源 教授

本节概要:涉及11个公共数据资源详情如下


第二部分


  非编码RNA调控数据库

理论课:2h;实操课:2h

授课老师:谢贵燕 博士

本节概要:涉及10个公共数据资源详情如下


第三部分


  生信表观遗传和通路数据库

理论课:1.5h;实操课:1.5h

授课老师:柳纯洁 博后

本节概要:涉及8个公共数据资源详情如下


第四部分


  生信转录调控数据库

理论课:1.5h;实操课:2h

授课老师:胡 慧 博后

本节概要:涉及7个公共数据资源详情如下


第五部分


  答疑及实操练习

4h

本节概要:上课内容交流、答疑,数据库实操练习


上课时间

采纳学员建议,本期课程内容分散在一周内的周四至周日,便于知识消化吸收

8月27日19:00-21:00,28日19:00-21:00,29日全天30日全天


结业证书

将由肿瘤标志专委会和肿瘤测序及大数据分析专家委员会共同颁发、专家签名认证,是对您学习成果的权威认可。


优享福利

■ 独特授课

小班线上授课,直播+操作演示+1对1远程实操指导+听课群长期答疑

■ 专享回看

课程结束一周内听课群内获取回看地址,可限时回看授课视频一个月

■ 短期培养

可介绍推荐短期实习

■ 人才计划

得到肿瘤标志专委会“青年人才扶持计划”的机会

■ 培训优惠

可享受特别优惠参加体系课的其他课程


课程收费标准

■ 单价:

2400¥/人

■ 团购价(3人以上):

1800¥/人

■ 必修课(3门课):

4800¥/人(98%的学员选择,点击查看完整必修课


报名方式

1. 扫描填写报名表

2. 扫码添加工作人员微信咨询

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