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enrichment map

2017-09-01 Y叔 biobabble

这个功能是好久以前在QQ群里(不要问我什么群,我老早退了),有人问cytoscape的enrichment map怎么改变颜色,我看了一下enrichment map,感觉对于展示富集结果还是蛮有用的,于是花了两个小时,写了enrichMap函数,效果棒棒哒。


不单单超几何检验的结果可以用,GSEA的结果也可以哦。虽然你很难看到GSEA可以这样展示,但DOSE, clusterProfiler包确实可以。

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