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ggplot2 - 3.0.0版本的新功能

Y叔叔 biobabble 2020-02-05

CRAN发布ggplot2 3.0.0版本,主要是加入了tidy evaluation,和其它tidyverse包结合更紧密,有很多大的更新,估计很多包又要爆了,但我还是很期待的,因为确实更好玩了。

比如可以直接用tag来标记ggplot,然后我们就可以通过patchwork使用+号来拼图了,这让cowplot情何以堪!!!下面再介绍一下随手涂鸭的功能:

ggplot2字体溢出的那点破事》这是经典老问题了,现在新版本的ggplot2有新的解决方案了,在coord_cartesian中新加入了clip参数,这样可以支持把图层画在画布之外,那么文本打过界也就支持了。这有一个好处,是可以支持direct label,而不需要调整xlimylim,毕竟你把xlimylim搞大有时候会给人以误导,认为你的数据取值范围就是图中的xlimylim,但实际上要小一些。

我以ggtree为例,为了让tip label打全,那么p1把时间给搞到2020,但实际上最近的采样时间是2013年,这样你单看x轴的标记,总感觉有一点点不对路,或者有一点点别扭。现在好了,我不设置xlim,而是让label打过界,当然还是需要有足够的空间来放这些文本,这个可以通过把margin搞大来实现。

require(ggtree)
beast_file <- system.file("examples/MCC_FluA_H3.tree", package="ggtree")
beast_tree <- read.beast(beast_file)
ggtree(beast_tree, mrsd="2013-01-01") + geom_tiplab(size=2, align=TRUE, linesize=.5) + theme_tree2()  -> p
p1 = p + xlim(NA, 2020)
p + coord_cartesian(clip="off") + theme_tree2(plot.margin=margin(6, 80, 6, 6)) -> p2
cowplot::plot_grid(p1, p2, ncol=2)

如果你脑洞够大,你甚至于可以用theme把坐标轴给去掉,然后自己用geom_segment画坐标轴,于是你可以把ggplot2画成类似于base plot,可以装得特别像。

再者,因为我们可以随意把各种元素画到画布的任何区域上,放开脑洞,各种鬼畜的ggplot2可以走你了!像下面这个GIF,我能盯着看很久:


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