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不靠谱的富集软件太多了!
Y叔
YuLabSMU
2022-09-20
哟西,图片上有GO和Reactome的条目,总的注释基因数是一样的,那么提问的这个问题就确实存在,而且不混的话,估计也没什么注释的覆盖度可以这么高,达到两万四千多个!超几何分布无非N, M, n, k四个参数,混起来等同于说把N变大而其他三个数不变,这样p值就小了。像KEGG这种人的基因注释的不到一万,N值却被设为两万多,一大波不显著的的都变得显著了,我收到很多人的邮件问我说,为什么用别人的软件富集出来,用我的软件却富集不出来,或者条目变少了,我也很无语,因为我写的软件靠谱好么😜
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