文献管理软件 Zotero 的使用心得
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本文是相关网络资源和个人使用经验的一些总结，软件使用环境为 Win，Mac 下可做参考。
Zotero [zoh-TAIR-oh] is a free, easy-to-use tool to help youcollect, organize, cite, and share your research sources.
Zotero是一个免费且易用的工具，可以帮助你收集、整理、引用和分享你的研究资讯。
☞ 数据的组织形式采用树形目录结构，并且是无限层级，有大量的实践和论文证明，这是最适合人类大脑的知识储存方式
☞ 可以配置为，Zotero服务器仅同步数据库，文档通过软链接指向本地或者网络服务器，几乎是无限制存储空间，数据库同步可以使用Zotero的服务器，而数据文档可以使用第三方的网络存储功能，如：百度盘、dropbox，google driver，iCloud等，甚至是NAS
☞ 编辑文档使用外部工具，不存在编辑功能不够强大的问题，不够强大你就去装更强大的编辑器好了
☞ 开源，在世界范围内有很多人用，插件丰富，你不用担心某一天挂了会没人接手
☞ 收集信息 使用Firefox、Chrome、Safari插件，随手收藏喜欢的网页和参考文献（及其pdf文档），同时也会对网页信息生成快照留存。
☞ 组织信息为收藏的条目增加分组；为条目贴上标签
☞ 在线同步 方便在多个屏幕（PC，平板，手机等）间同步文献数据库。
☞ 多用户协作
类别 | Endnote | Zotero |
文献导入 | 手动、RIS | 手动、RIS、 网页导入 |
全文检索 | 支持 | 支持 |
整理方式 | 分类、笔记 | 收集/分类、 笔记、标签 |
建立引文 | 支持且 可扩充 | 支持且可扩充 |
操作系统 | Win、Mac | Win、Mac、linux |
费用 | 收费 | 免费 |
多种软件的详细对比见维基：
https://en.wikipedia.org/wiki/Comparison_of_reference_management_software
Zotero 主页
https://www.zotero.org/download/
Win 用户下载 chrome 插件 和 Zotero standalone版
文献信息的同步
1. 设置同步账户并取消内置文件同步
工具->首选项（Windows版本）或Zotero->Preferences（Mac版本），在同步（Sync）一栏注册登录 Zotero 账户，文献库便可以自动同步到Zotero官网。
zotero免费账户包含300mb同步空间，经测试，zoteo条目的存储并不记录在这300mb以内，但是仍显得太小，故应取消内置文件同步，在首选项->同步->设置中取消文件同步下面两个选项的勾选。
2. 取消自动生成快照
zotero 默认设置为保存快照，网页快照包含了大量零碎的文件，估计同步起来也会有困难，对于一部分想保留的快照，依旧可以手动保存，所以建议取消自动生成快照。
Zotero 自身的免费储存空间有限，若附件文件较多几百兆的空间是不够用的，下面提供两种方法使用网盘同步附件且与文献信息保持关联，便于管理使用。
1.软链接同步
1. 配置数据存储路径，工具->首选项->高级->文件和文件夹中配置数据存储位置为自己创建的某个目录，可起名为Zotero
2. 在百度云同步盘中创建目录Zotero/storage，作为文献资料的实际存储位置
3. 将第2步配置的数据存储位置超链接到第3步创建的云盘中位置，在 cmd 命令行中输入
4. mklink /jD:\Zotero\storage D:\百度云同步盘\Zotero\storage
如此便可以将资料保持到百度云中，而Zotero中只需要存储超链接即可。此方法适用于Windows系统和Linux系统。
2.zotfile插件同步
数据存储位置是zotero本地几乎所有的配置、文献数据库、附件存放的地方，可以说除了可执行文件和插件都在此处。一般来说，并不需要同步。该目录下的storage子目录，存放有本地所有文件格式的附件，我们需要将storage设置为zotfile的监听目录。
链接附件的根目录是zotero保存文件链接的目录，当zotero以文件链接形式保存附件时，会记住在这目录下找相对路径。
1. 配置附件链接根目录
将链接附件的根目录设置为同步盘可以同步的位置
2. 下载安装 zofile
下载 zotfile-4.2.6-fx.xpi 插件（百度云 http://pan.baidu.com/s/1c2iqst6 ） ，工具->插件，按右上角齿轮选择Install Add-onForm File ...，选中刚刚下载的zotfile-4.2.6-fx.xpi文件进行安装
3. 配置zotfie
打开ZotFile Preferences ...， GeneralSettings标签页， Source Folderfor Attaching new Files设置为数据存储位置下的storage。 Location ofFiles设置为链接附件的根目录。
4. 同步
开启同步就好了，对于已经存在本地的附件，请选中所有条目，右键Manage Attachments->Rename Attachments。
3.注意
1. zotfile 插件同步方法相对软链接方法，实现了跨平台同步且方便更换网盘和目录。
2. 软链接方法向本方法的迁移
装zotfile，除了附件链接根目录不动，剩下都按照本文叙述来，zotfile重命名后，再修改附件链接根目录
3. 修改目录/更换网盘
其实本质还是改目录，将附件链接根目录剪切到新位置，修改附件链接根目录和Location of Files为新位置即可。
1. 在插件中心，安装Markdown here插件，http://t.cn/8kxA5bG （百度云
http://pan.baidu.com/s/1jHCVVAA ）
2. 重启后，新建笔记，输入快捷键ctrl+alt+m，效果如下
3.zotfle插件
1. 自动提取注释文本
在Zotero软件界面，对应条目上，单击右键，在弹出对话框选择ExtractAnnotations，在提取注释的同时，Zotfile在每条注释下还创建了超链接，点开注释文本后面的蓝色超链接，就可以顺利定位到你的笔记位置。在读一篇长达数百页的综述，如Chemical Review以及书籍时，可以先做高亮笔记，导出注释，然后想查阅的时候，直接点击超链接，直达目的页面，非常方便。
2. 自动重命名附件文本
zotfilePreference -> Advanced settings -> Other Advanced Settings 中，将 Autoatically rename new attachments 选成Always rename
3. 添加书籍书籍目录
添加书籍附件文本后，选中文本，右键Manage Attachments->Rename Attachments，即可自动生成目录，Open Link 即可打开对应章节，前提是附件文本中需包含目录信息。
4. 修改笔记行距与字体
默认行距太挤，且文字过小，不便阅读。打开工具->首选项->高级->打开配置编辑器，在搜索栏中键入note 可以看到相的选项：
段落格式定义：extensions.zotero.note.css，双击该名称，在弹出窗口中粘贴如下内容，这样可以使行距比默认的大一些
p {line-height:1.4; margin-bottom: 2em;} li {line-height: 1.2;} blockquote {margin-left: 4em;}
字体大小定义：extensions.zotero.note.fontSize，双击该名称进行设值，如15
重新打开Zotero可以看到修改后的结果。
5. 与Endnote 的文献互导
1. Zotero 导入 Endnote
① 选定文献，右键点选 export selecteditems； 如果是导入整个 Library或者 cellection可在相应图标上右键点选；
② 在弹出的对话框中选择导出的格式为Refer/BibIX, 选择文件目录，保存文件，格式为.txt;
③ 在 Endnote 中打开一个library，执行files-import；
④ 在对话框中选择刚才的.txt文件, Impott Option 选Refer/BibIX，Text Translation 选Unicode(UTF-8)，点确定后即可导入。
2. Endnote导入 Zotero
① 选择文献后，执行files-export；
② 选择 Output Style 为 Endnote Export，命名后导入，得到.txt文件；
③ 在 Zotero 中执行actions-import，选择得到的文件，点确定即可导入， 上述导入方式仅能实现文献题录的导入。
❶ Zotero——知识管理工具
❷ 实现Zotero条目和附件的跨平台独立同步
❸ Zotero+百度云知识管理
❹ 参考文献管理工具zotero的使用经验分享
❺ Zotero（5）：电子文献管理攻略
❻ Zotero文献管理不完全教程之-Tips
❼ Zotero与Endnote的互相导入
（来源：直达理工网）
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