碳材料3D模型的简单画法：利用 NanotubeModeler 和 chembio 3D
1.利用NanotubeModeler构建各种碳材料的坐标，如单壁（多壁）碳纳米管，石墨烯，富勒烯。
选择碳材料的类型，如下图中的碳管，输入手性，长度，层数等，就可以得到3D碳管模型了。
PS：也可以画BN管，BN二维材料等等。
又如：石墨烯
富勒烯：
数据库里面包含了很多种富勒烯，可以自由选择。如我选择了个很大的C180.
2.输出模型的坐标。
如我选择输出（6,5）碳管的坐标，mol格式。
会询问单键还是双键，选择单键。
再保存一个富勒烯的模型，如C60。以及一个窄的石墨烯带。
3.用chembio3D打开刚刚保存的碳管文件，发现碳原子上面连有氢键，这是因为我们保存坐标的时候，碳之间的键保存成了单键，需要氢键使模型稳定。这个没关系，只需要选择不显示氢键。
先选择所有的氢原子，然后隐藏。或者直接选择空白的地方鼠标右键，选择隐藏氢原子。
效果如下：
4.导入石墨烯和C60，同样隐藏氢原子。
也可以选择某些原子，改一下颜色。
也可以选择某个原子，调节其位置。如下图石墨烯中的蓝色C原子。
首先利用像箭头的那个工具选中这个原子，然后用第三个工具扭转图像，最后利用第五个工具改变目标原子的位置。（这在画石墨烯缺陷，掺杂或者被氧化等示意图的时候很有用，你也可以改变原子为O或者增加原子，等等。）
选中之后右键，可以改变原子的大小。
还可以选中原子后，右键，选择模型的显示方式，如球棍模型或者其他几种。
如，我选了wire frame之后的碳管：
Spacefilling之后的C60。
也可以在碳管中填充你要的分子，或者Graphene nanoribbons等等。只需要改变他们的位置关系。
如下图，我再复制一个C60，然后放入（10,10）碳管中。
在另一个角度改变C60的位置。换个颜色。
假如给碳管换个别的显示模式，可以突出填充的C60。
还可以自己制作动态图，让你画的图围绕某个轴旋转。
自己调整图像到某个角度之后，再选择保存，你会看到，即使都选择围绕着Y轴转动，其实每次都不一样。
如，我调整到这个角度之后的动态图。见附件。
就到这里吧。已经用了两个小时了。自己多练习，就一定能画出漂亮的示意图。
来源：小木虫论坛 作者：wulishi8
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