3月份下半月circRNA研究报道汇总
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声 明
下旬circRNA相关文献数量共计20篇,涉及研究方向较丰富,机制方面研究主要还是环绕miRNA sponge展开,其中cancer reaserch杂志发布的circPRKCI促进肺腺癌发展的文章,思路清晰、实验详尽,非常值得参考,下面我们一起解读这篇文献。
circPRKCI促进肺腺癌发生发展
论文题目:The circular RNA circPRKCI promotes tumor growth in lung adenocarcinoma
杂志:cancer research
影响因子:8.55
通讯作者单位:南京医科大学附属肿瘤医院
肺腺癌LAC是目前最常见的一种实体肿瘤,研究者在前期的研究中,通过circRNA芯片发现了107个差异表达的circRNAs,通过整合TCGA肺腺癌的CNVs数据,联合分析发现一个circPRKCI的circRNA分子,该分子起源于PRKCI基因的(染色体3q26.2区异常扩增),并通过后续生物素标记miRNA探针共沉淀等实验,发现circPRKCI可吸附miR-545和miR-589后,上调E2F7进而促进肺腺癌的发展。
CircPRKCI促进肺腺癌发展的分子机制示意图
一、circPRKCI表达水平研究
图注: A,circRNA在5对肺腺癌中的表达热图展示;B:circos图展示circRNA和宿主基因的表达模式,内圈为circRNA,外圈为宿主基因。
图注:C图联合TCGA的CNV数据筛选基因扩增或缺失区域的circRNAs;D图circPRKCI来源于PRKCI15,16号外显子反向剪接示意图;E图RTPCR检测circPRKCI。
图注:LAC肺腺癌细胞中RNase R处理后qPCR检测circRNA和宿主基因的表达水平,circPRKCI耐受RNA酶消化。
图注:circPRKCI在48对肺腺癌患者组织标本中高表达,且与肿瘤级别正相关。
图注:E图生存分析发现circPRKCI高表达的患者生存期更短;F图cox多元回归分析发现circPRKCI表达是不良预后的独立预测因素。
二、circPRKCI促进肺腺癌细胞恶性增殖
图注:a图siRNA干扰circPRKCI设计示意图;b和c图qPCR检测siRNA干扰和过表达质粒处理后circPRKCI的表达水平,d、e、f图克隆形成、EdU和CCK8实验表明circPRKCI促进SPC-A1细胞增殖;G图干扰circPRKCI后细胞周期阻滞在G1期;H图transwell实验表明circPRKCI促进肺腺癌癌细胞SPC-A1侵袭。
三、circPRKCI吸附miR-545和miR-589上调E2F7表达
图注:a、b图显示经FISH实验表明circPRKCI主要定位在细胞质;c图用抗Ago2蛋白抗体RIP实验表明circPRKCI与Ago2结合;D图生物素标记 miR-545, miR-589, miR-600, miR-144 and miR-670免疫沉淀后检测circPRKCI的表达;e图Ago2 RIP实验表明Ago2蛋白可显著富集miR-545和miR-589;F图siRNA干扰circPRKCI不影响miR-545, miR-589表达水平;g图miR-545, miR-589不影响circPRKCI的表达;H、i、j、k图E2F7是miR-545, miR-589的靶基因。
图注:荧光素酶报告基因等实验进一步证明miR-545, miR-589调控E2F7。
四、circPRKCI通过结合miR-545, miR-589促进肺腺癌细胞增殖
图注:功能挽救实验证明circPRKCI通过miRNA发挥促癌功能。
五:体内动物实验证明circPRKCI促进LAC肿瘤形成
图注:裸鼠肺腺癌皮下移植模型结果显示circPRKCI是潜在的治疗靶标。
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2018年7月7日-7月8日
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