八月份上旬如“雨后春笋”般涌现的circRNA综述
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声 明
注:以下综述是按照pubmed收录的出版时间排序,与其在杂志正式online的日期不一致。
1. Wang Q, Qu L, Chen X, et al. “Progress in Understanding the Relationship Between Circular RNAs and Neurological Disorders”. J Mol Neurosci. 2018 Aug 1. doi: 10.1007/s12031-018-1125-z. (IF= 2.454) ——吉林大学第一医院神经外科罗祺教授
摘要:环状RNA(circRNA)是一种不同于线性形式的内源性非编码RNA,它是通过基因序列索尾剪接方式产生的。circRNAs是结构稳定的,高度保守的分子,广泛存在于生物体中,并具有组织类型和发育阶段特异性的表达模式,揭示了它们在基因表达中的重要调节功能。基于不断的研究,现在认为一些circRNA是一类调节基因表达的竞争性内源RNA。例如,circRNA作为海绵吸附miRNA,以防miRNA抑制靶RNA的表达,或者与RNA结合蛋白相互作用,从而有效地和转录后调节亲本和其他基因的表达。此外,越来越多的研究表明,circRNA在神经系统疾病的发生和发展中起着重要作用。在这篇综述中,我们提供了关于circRNA的生物发生,特征和功能的全面概述,重点讨论了circRNA在神经系统疾病中的关键作用。
第一,介绍了不同基因序列来源的circRNA的形成和降解机制;
第二,介绍了circRNAs的分布、稳定性、进化保守性、组织和发育阶段特异性的生物特性;
第三,通过举例子详细说明了circRNAs的生理功能:作为miRNA的sponge、调节母系基因转录、作为蛋白模板、与RNA结合蛋白相互作用等;
第四,这是本文的重点,通过已有的研究具体介绍了circRNAs与神经障碍性疾病的关系,如帕金森疾病、阿尔兹海默病和其他神经障碍性疾病;
表1 circRNA的发展史
2. Wang M, Yu F, Li P. “Circular RNAs: Characteristics, Function and Clinical Significance in Hepatocellular Carcinoma”. Cancers (Basel). 2018 Aug 2;10(8). pii: E258. doi: 10.3390/cancers10080258. (IF=5.326)—— 青岛大学转化医学研究院李培峰教授
摘要:肝细胞癌(HCC)是全球癌症相关死亡的主要原因之一。HCC患者通常被诊断为晚期,导致高效的治疗受到限制。此外,由于肿瘤转移和复发的频率高,HCC患者的五年存活率仍然很差。这些挑战产生了对发现HCC诊断的理想的生物标志物以及鉴定HCC治疗的新靶标的迫切需求。近年来,长期被忽视的环状RNA(circRNA)是一类非编码RNA,已被发现其为多功能的RNA。越来越多的证据表明,circRNA表达改变对HCC的生物学特性有广泛的影响。大多数这些circRNA通过充当miRNA的海绵来调节HCC的发展,表明circRNA可以作为理想的诊断生物标志物和HCC的理想治疗靶标。在这篇综述中,作者总结了研究circRNA在HCC发病机制中的功能作用的当前进展,并展示了它们作为诊断生物标志物和治疗靶标的潜在价值。对HCC中涉及的circRNA的功能和机制的深入研究将丰富我们对HCC发病机制的认识,并有助于开发有效的HCC诊断生物标志物和治疗靶点。
本文重点介绍了circRNAs在HCC发生发展过程扮演着不同的角色,发挥不同的作用,如作为致癌基因、作为肿瘤抑制者、抵抗肝炎病毒感染、作为潜在的HCC预后生物标志物。
图1 circRNAs在HCC致癌过程中发挥的功能及其机制
3. Zhang Z, Yang T, Xiao J. “Circular RNAs: Promising Biomarkers for Human Diseases”. EBioMedicine. 2018 Aug 2. pii: S2352-3964(18)30280-9. doi: 10.1016/j.ebiom.2018.07.036.(IF=6.183)——上海大学生命科学学院心血管科学研究所肖俊杰教授
摘要:环状RNA(circRNA)是一组内源性非编码RNA,其特征在于缺乏多腺苷酸化尾部的共价闭合环状结构。最近的研究表明,circRNA通过充当microRNA海绵,RNA结合蛋白海绵和翻译调节因子,在调节基因表达过程中发挥着关键作用。因为CircRNAs与疾病发展密切相关而成为研究的热点。一些circRNA以组织和发育阶段特异性方式表达。此外,由于circRNA具有稳定性,保守性和体液中的高丰度的特点,所以认为circRNA是各种疾病的潜在生物标志物。在本综述中,作者提供了目前对circRNA的生物发生和基因调控机制的理解,总结了最近关于circRNA作为潜在诊断和预后生物标志物的研究,并基于现有知识,突出了circRNA作为新型生物标志物的主要优点和局限性。
图2 circRNA作为液体活检生物标志物的潜在应用
4. Li X, Yang L, Chen LL."The Biogenesis, Functions, and Challenges of Circular RNAs". Mol Cell. 2018 Aug 2;71(3):428-442. doi: 10.1016/j.molcel.2018.06.034. (IF=14.248)——中科院陈玲玲教授
摘要:共价闭合的环状 RNA(circRNA)由真核生物中数千个基因的外显子的前体mRNA反向剪接产生。circRNA通常以低水平表达,并且通常表现出细胞类型特异性和组织特异性模式。最近的研究表明,它们的生物发生需要剪接体机制,并且可以通过顺式互补序列和蛋白质因子进行调节。大多数circRNA 的功能在很大程度上仍未被探索,但已知的功能包括吸附miRNA或蛋白质,调节转录和干扰剪接,甚至翻译以产生多肽。然而,由于它的环状构象和与对应线性mRNA序列重叠,因此深入理解调节circRNA的生成机制存在挑战。在这篇综述中,作者阐述了circRNA 生物发生和功能的最新进展,并讨论了circRNA研究中的技术障碍。(具体解读细节可看文章:杨力、陈玲玲教授在Molecular Cell杂志发表长篇circRNA综述)
5. Wang C, Jing J, Cheng L. “Emerging roles of non-coding RNAs in the pathogenesis, diagnosis and prognosis of osteosarcoma”. Invest New Drugs. 2018 Aug 6. doi: 10.1007/s10637-018-0624-7. (IF=3.502)——安徽医科大学第二附属医院骨科
摘要:已发现非编码RNA(ncRNA)在各种生理和病理过程中发挥重要作用。近年来大量研究发现,ncRNA参与骨肉瘤(OS)的发展。在这篇综述中,作者总结了microRNA,lncRNA和circRNA在OS发生和发展过程中的功能和机制。特别关注它们在OS的诊断,预后和治疗中的潜在应用。总结关于ncRNA参与OS过程的研究,不仅有助于理解OS发生和发展的复杂过程,而且有助于挖掘关于OS患者的诊断的理想生物标志物和治疗靶标。
这篇综述首先介绍了miRNA、lncRNA和circRNA的定义和生物形成机制,接着介绍了这三种ncRNAs表达失调与OS疾病的联系及其影响OS发生发展过程中涉及的信号通路,提示了这三种ncRNAs作为诊断OS和OS预后的生物标志物的可能性。不清楚这三种ncRNAs的研究者可以借鉴一下,学习一下基础知识。
6. Sheng JQ, Liu L, Wang MR, Li PY. "Circular RNAs in digestive system cancer: potential biomarkers and therapeutic targets". Am J Cancer Res. 2018 Jul 1;8(7):1142-1156. (IF=3.998)——武汉华中科技大学同济医学院附属同济医院消化科黎培员副教授
摘要:环状RNA(circRNA)是一系列具有稳定性和保守性的特殊闭合环状RNA分子。近年来,高通量RNA测序技术的进步已导致不同类型物种和细胞中circRNA的爆炸性发现。此外,circRNAs可以实现众多的生物学功能,如调节转录或剪接,作为miRNA的海绵,与RNA结合蛋白相互作用,以及翻译蛋白质。同时,circRNA涉及许多疾病的生物发生和发展,包括心血管疾病,神经系统疾病,癌症等。在此,作者讨论了circRNA的最新研究进展,以及它们在消化系统癌症(包括食管癌、胃癌、结直肠癌和肝癌)中的诊断和预后意义。
图3 circRNA在消化系统癌症中介导的信号通路
7. Zhou MY, Yang JM, Xiong XD."The emerging landscape of circular RNA in cardiovascular diseases". J Mol Cell Cardiol. 2018 Aug 14. pii: S0022-2828(18)30794-6. doi: 10.1016/j.yjmcc.2018.08.012. (IF=5.296)——东莞广东医科大学衰老研究所熊兴东教授
摘要:环状RNAs(circRNAs)是一种新型内源性转录本,已成为RNA生物学领域的一个新的研究热点。CircRNA主要通过多种机制从外显子或内含子中产生,并且大多数circRNA在不同物种中是稳定和保守的。最近的研究表明,circRNA可以作为miRNA海绵,蛋白质的结合配偶体,转录调节因子,甚至可以翻译成蛋白质。越来越多的证据表明,circRNA在多种生物过程中发挥重要作用,如细胞增殖,凋亡和衰老,并可作为各种心血管疾病的潜在诊断生物标志物或治疗靶点。在这里,作者回顾了circRNA的生物发生,特性和生物学功能,并总结了它们在心血管疾病(包括动脉粥样硬化、心肌梗塞、心肌症、冠状动脉疾病、心力衰竭等疾病)中的作用。
8. Cui X, Wang J, Guo Z, et al. “Emerging function and potential diagnostic value of circular RNAs in cancer”. Mol Cancer. 2018 Aug 15;17(1):123. doi: 10.1186/s12943-018-0877-y. (IF=7.776)——青岛大学医学院检验系
摘要:作为一类新的内源性RNA,circRNA具有共价闭合的连续环,既不具有5'至3'极性,也不具有多腺苷酸化尾部。许多circRNA的特征在于丰度,稳定性,保守性,并且表现出组织/发育阶段特异性表达。此外,circRNA在肿瘤发生和转移中起重要作用,例如作为ceRNA或miRNA海绵起作用,与蛋白质和编码蛋白质相互作用。越来越多的证据表明,它可能成为癌症诊断所需的新型生物标志物。本综述总结了对circRNA的最新研究,包括其分类和生物发生,机制和功能,以及在不同癌症(包括消化道癌症、膀胱癌、乳腺癌、肺腺癌和胶质母细胞瘤)中的circRNA作为潜在的生物标志物。
总结:小编搜索到的有关circRNA的综述都是国内学者发表的,其中不乏高IF的文章,最近国内涌现多篇,说明circRNA越来越火,越来越吸引国内学者去研究其在不同疾病过程中的作用,以上的综述涉及这么多种癌症,相信总有一款适合你们研究方向的,可以具体了解学习一下
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