8月上半月circRNA研究报道汇总

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声 明

欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目，本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献24篇，下面我们一起来看看circRNA研究有哪些新进展。

1、circEPSTI1作为三阴性乳腺癌独立预后因素的研究

论文标题：circEPSTI1 as a Prognostic Marker and Mediator of Triple-Negative Breast Cancer Progression.

杂志：Theranostics 

影响因子：8.573

通讯作者单位：中山大学肿瘤医院

三阴性乳腺癌（TNBC）是指癌组织免疫组织化学检查结果为雌激素受体（ER）、孕激素受体（PR）和原癌基因Her-2均为阴性的乳腺癌。TNBC是侵袭性最强的乳腺癌类型，该疾病复发率高和致死率高。这类乳腺癌占所有乳腺癌病理类型的10.0%～20.8%，具有特殊的生物学行为和临床病理特征，预后较其他类型差。广州中山大学肿瘤医院谢小明团队发现circEPSTI1环状RNA可通过miRNA sponge作用机制，通过竞争性吸附miR-4753和miR-6809后上调BCL11A的表达，促进三阴性乳腺癌（TNBC）细胞的增殖和降低凋亡功能，结合临床资料分析发现，circEPSTI1可作为TNBC患者的独立预后因素。该文详细解读请点击往期文章：circEPSTI1作为三阴性乳腺癌的预后标志物和介导因子。

图注：circEPSTI1在三阴性乳腺癌（TNBC）中的作用机制示意图

2、实体瘤中circRNA的功能及临床意义

论文标题：Function and clinical significance of circRNAs in solid tumors.

杂志：J Hematol Oncol 

影响因子：7.33

通讯作者单位：苏州大学附属第三医院

自1979年研究者第一次在真核细胞中发现circRNA到现在，circRNA研究并非一帆风顺，最初被认为是基因转录过程中错误剪切产物。高通量测序和生物信息学技术的发展才真正揭开circRNA的神秘面纱，circRNA非但不是转录垃圾，而且在各种生命体中普遍存在，数量众多，功能强大的一种5’和3’首尾相连不同于线性RNA的环形RNA分子，在生理疾病过程中扮演重要角色。该综述盘点了circRNA的各种特点，生物形成机制假说、分子功能和研究策略，以及circRNA与不同实体瘤的关系及潜在的临床价值，是一份很好的实体瘤circRNA研究快速入门文章。文章详细解读见本公众号文章：circRNA在实体瘤中的功能和临床意义的长篇综述。

3、敲低circRNA.2837可通过调节神经元自噬作用保护坐骨神经损伤

论文标题：Silencing of circRNA.2837 Plays a Protective Role in Sciatic Nerve Injury by Sponging the miR-34 Family via Regulating Neuronal Autophagy

杂志：Mol Ther Nucleic Acids 

影响因子：5.66

通讯作者单位：第二军医大学长征医院

周围神经损伤（PNI）是一种常见的临床问题，主要由创伤和外科手术引起，给患者造成长期经济和社会负担。目前已知受损的周围神经有一个轴突再生的内在能力，但功能恢复差。因此，越来越多的研究致力于开发有效的周围神经损伤治疗。目前，周围神经损伤的临床前研究主要在动物模型中进行，坐骨神经损伤（SNI）模型是研究周围神经损伤最常用的实验范例，使用SNI模型进行了许多实验试图在周围神经损伤后增加神经再生和功能恢复。然而，现有的神经损伤治疗方法似乎不足，部分原因是对损伤后细胞和分子事件的理解不足。因此，提高对周围神经损伤后分子和分子间相互作用的理解仍然很重要。

目前越来越多研究表明circRNA在多种疾病中起着重要调控功能，但在周围神经损伤方面研究还有很多空白，本文研究者利用去核糖体建库RNA-seq技术对大鼠SNI模型进行高通量测序，鉴定出4942个circRNA分子，并发现circRNA.2837环状RNA分子存显著差异，在受损坐骨神经组织中下调。进一步研究该circRNA的功能和机制发现，circRNA.2837的下调通过诱导自噬减轻了坐骨神经损伤。此外，荧光素酶报告基因实验显示circRNA.2837可以与miR-34家族成员结合，包括miR-34a，miR-34b和miR-34c。circRNA.2837的沉默通过直接靶向miR-34a诱导神经元中的自噬。综合各项实验证据表明，circRNA.2837可发挥ceRNA（竞争性内源RNA）作用，通过吸附miR-34家族调节神经元自噬。该研究结果表明，差异表达的circRNA.2837参与了坐骨神经损伤的发病机制，环状RNA在SNI中发挥调节功能，可作为SNI治疗的潜在靶点。

图注：circRNA.2837调节神经元自噬作用保护坐骨神经损伤作用机制示意图

4、NanoString nCounter一种优秀的circRNA定量技术

论文标题：Enzyme-free digital counting of endogenous circular RNA molecules in B-cell malignancies.

杂志：Lab Invest 

影响因子：4.254

通讯作者单位：丹麦奥胡斯大学

在前期高通量实验筛选多个差异circRNA后，进一步就是针对特定circRNA进行定量分析了，通常的PCR定量检测，看似分子生物学一项基础实验技术，但由于circRNA的特殊环形结构，且circRNA数量众多，可变剪切形式多样（可参看环状RNA的可变剪接研究又一新作），对circRNA的准确定量鉴定依然充满挑战，技术层面还有很多提升的空间。需要考虑的因素也相对较多，比如PCR前是否需要进行RNaseR消化，内参如何选择，引物设计技巧，如何识别circRNA“滚环扩增”等（可参看环状RNA定量PCR技术详解，环状RNA研究实验流程详解）。本文研究者就选用了基于NanoString nCounter 荧光条形码标记检测技术实现circRNA绝对定量分析，该技术一次可检测约800个circRNA的表达水平，通量上比定量PCR有明显优势，且定量效果和检测灵敏度也可以与定量PCR媲美，是一种不错的选择，该技术具体介绍可参看基于NanoString nCounter进行circRNA绝对定量。

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