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小结 | 10月上半月circRNA研究报道汇总

木禾 circRNA 2021-02-21

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声 明




欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目,本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献19篇,下面我们一起来看看circRNA研究有哪些新进展。

 

1、环状RNA-PRMT5通过吸附miR-30c诱导上皮-间质转化并促进膀胱尿路上皮癌转移

论文标题:PRMT5 circular RNA promotes metastasis of urothelial carcinoma of the bladder through sponging miR-30c to induce epithelial-mesenchymal transition

杂志:Clin Cancer Res. 

影响因子:10.199

通讯作者单位:中山大学癌症中心

环状RNA(circRNA)是一类新的RNA分子,最近其在人类癌症的发病机制中引起了很多关注。然而,circRNA在癌细胞上皮-间质转化(EMT)中的作用仍不清楚。该研究中,研究者鉴定出调节膀胱尿路上皮癌(UCB)细胞EMT的新型circRNA,并探讨其在UCB中的调节机制和临床意义。研究者首先使用circRNA微阵芯片在成对的UCB和正常组织中筛选circRNA表达谱,最终筛选出在大量UCB患者中上调的circRNA(circPRMT5)的临床意义。研究者进一步研究了circPRMT5在UCB细胞EMT中的功能和潜在机制。此外,研究者结合自己研究数据和癌症基因组图谱(TCGA)的两个独立队列中评估了circPRMT5对miR-30c及其靶基因SNAIL1和E-钙粘蛋白的调节作用。结果显示circPRMT5的上调表达与UCB患者的晚期临床分期和更差的存活率呈正相关。我们进一步揭示circPRMT5通过海绵样吸附miR-30c促进UCB细胞EMT。来自两个独立UCB群组的临床分析显示,circPRMT5 / miR-30c / SNAIL1 / E-钙粘蛋白途径对于支持UCBs进展是必需的。重要的是,我们发现circPRMT5在UCB患者的血清和尿外泌体中上调,并且与肿瘤转移显着相关。综上结论表明CircPRMT5在促进UCB细胞EMT和/或侵袭性方面发挥关键作用,并且是该疾病的预后生物标志物,表明circPRMT5可以作为UCB患者的潜在治疗靶标。

图注:UCB疾病中CircPRMT5调控miR-30c/SANIL1/E-cadherin影响UCB进程


A:CircPRMT5与miR-30c的表达水平成负相关(来自SYSUCC的UCB患者样本);

B:CircPRMT5与SNAIL1的表达水平成正相关(来自SYSUCC的UCB患者样本);

C:CircPRMT5与E-cadherin的表达水平成负相关(来自SYSUCC的UCB患者样本);

D:miR-30c差异表达水平的kaplan meier曲线分析,UCB患者中整体生存(左)和DFS(右)的分析(P<0.01,log-rank分析)结果(来自TCGA数据);

E:qPCR检测miR-30c在淋巴结转移和非转移UCB样本中的表达情况分析(来自TCGA数据);

F:miR-30c表达水平与SNAIL1表达呈负相关(来自SYSUCC和TCGA数据);

G:SNAIL1与E-cadherin的表达水平成负相关(来自SYSUCC和TCGA数据);

H:CircPRMT5调控miR-30c/SANIL1/E-cadherin的ceRNA机制抑制UCB细胞EMT和侵袭假说;

 

2、环状RNA BCRC-3通过miR-182-5p/p27轴抑制膀胱癌增殖

论文标题:Circular RNA BCRC-3 suppresses bladder cancer proliferation through miR-182-5p/p27 axis

杂志:Mol Cancer 

影响因子:7.776

通讯作者单位:华中科技大学同济医学院

背景:最近研究表明环状RNA(circRNA)是基因表达的关键调节因子。我们之前的研究已经确定了circHIPK3与膀胱癌分级,侵袭以及淋巴结转移之间的负相关。然而,circRNA在膀胱癌细胞增殖中的作用很大程度上仍然未知。


方法:我们通过高通量测序技术在人体组织中分析了circRNA表达情况,并确定了膀胱癌相关的circRNA-3(BCRC-3,GenBank:KU921434.1),BCRC-3是来源自PSMD1基因的新circRNA。通过定量实时PCR技术检测人组织和细胞中circRNA,mRNA和miRNA的表达水平。通过在体外和体内用质粒转染来研究BCRC-3对癌细胞的作用。应用RNA-pulldown试验,荧光素酶报告基因检测和荧光原位杂交来验证BCRC-3与microRNA之间的相互作用。通过流式细胞术,蛋白质印迹和qRT-PCR测量茉莉酸甲酯(MJ)的抗癌作用。


结果:BCRC-3在膀胱癌组织和细胞系中低表达。在体外和体内中,BCRC-3的过表达可抑制BC细胞的增殖。在机制上,BCRC-3的过表达诱导细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂1B的表达(p27)。BCRC-3可以直接与miR-182-5p相互作用,并随后充当miRNA海绵样吸附作用以促进p27活性。此外,MJ显着增加BCRC-3的表达,导致p27的明显上调。


结论:BCRC-3作为肿瘤抑制剂起作用,通过miR-182-5p / p27轴抑制BC细胞增殖,BCRC-3是BC治疗的潜在新靶标。

图注:BCRC-3在膀胱癌细胞中的调控通路示意图

 

3、circDiaph3调节大鼠血管平滑肌细胞分化,增殖和迁移

论文标题:circDiaph3 regulates rat vascular smooth muscle cell differentiation, proliferation, and migration

杂志:FASEB J. 

影响因子5.595

通讯作者单位:西南医科大学附属医院

血管损伤是由心血管疾病的诊断或治疗程序引起的血管再狭窄的主要原因,而血管损伤主要表现为血管内膜增生。已有报道表明环状RNA(circRNA)与多种心血管疾病有关,但血管内膜中circRNA的表达尚未见详细报道。在这项研究中,我们建立了球囊损伤的大鼠颈动脉模型,并用微阵列芯片检测了颈动脉中circRNA的表达。我们发现健康组的颈动脉和受损动脉的circRNA表达谱有显著差异。我们研究了rno-circ_005717(circDiaph3)在大鼠血管平滑肌细胞(VSMC)分化中的作用,敲低circDiaph3可上调formin-3(维持细胞骨架肌动蛋白的重要调节因子)蛋白水平,促进VSMC分化为收缩型。此外,circDiaph3可上调Igf1r的转录并支持VSMC的增殖和迁移。研究结果表明circDiaph3可能是对抗内膜增生的分子靶点。

图注:血管损伤后circDiaph3调控血管生成示意图


正常情况下,Diaph3会促进VSMCs中收缩标记物的合成。在动脉损伤后,circDiaph3增加,导致线性Diaph3的mRNA相对减少,进而Diaph3蛋白合成下降。因此,VSMCs表现特征是收缩标记的减少,胶原蛋白合成的升高,以及细胞增殖和迁移的增加。在血管损伤后,VSMCs中miR-148a-5p的表达减少,miR-148a-5p靶向的Igf1r的mRNA,Igf1r蛋白减少。此外,circDiaph3通过ceRNA机制与胞质中游离的miR-148a-5p结合,从而减少了miR-148a-5p的活性。miR-148a-5p的丰度和活性的减少,在VSMCs中引发了Igf1r转录的升高,从而通过IGF-1信号通路促进血管内膜增生。

 

4、通过微阵列揭示喉鳞状细胞癌中的环状RNA表达谱

论文标题:Circular RNA Expression Profile in Laryngeal Squamous Cell Carcinoma Revealed by Microarray.

杂志:Cell Physiol Biochem 

影响因子:5.5

通讯作者单位:中国医学科学院

背景:越来越多的证据表明环状RNA(circRNAs)在基因表达调控中具有重要功能,并且它们的调节异常与各种类型的癌症有关。然而,circRNA在喉癌中的作用仍然很大程度上未知。该研究调查了喉鳞状细胞癌(LSCC)中circRNA表达模式的全局变化,以鉴定潜在的差异表达的circRNA。


方法:在LSCC和成对的正常喉组织中微阵列芯片法测定circRNA表达,筛选出的差异表达的circRNA的进行功能富集分析。通过实时定量PCR验证候选circRNA和微小RNA(miRNA)的表达水平。使用生物信息学方法构建circRNA / miRNA相互作用网络,以预测miRNA与circRNA的结合。


结果:我们从人LSCC和正常喉粘膜组织中鉴定出506个差异表达的circRNA,证实hsa_circ_0044520和hsa_circ_0044529在LSCC组织中显着上调。hsa_ circ_0044520和hsa_circ_0044529的最可能的潜在靶miRNA分别是hsa-miR-4726-5p和hsa-miR-4640-5p。功能分析显示hsa_circ_0044520和hsa_circ_0044529参与胶原合成过程。


结论:竞争性内源性RNA网络预测和生物信息学功能分析表明,hsa_circ_0044520和hsa_circ_0044529通过竞争性吸附hsa-miR-4726-5p和hsa-miR-4640-5p发挥重要的调节作用,该研究为LSCC的肿瘤发生提供新的见解。

图注:hsa_circ_0044520和hsa_circ_0044529通过竞争性吸附hsa-miR-4726-5p和hsa-miR-4640-5p调控喉癌LSCC形成的可能分子机制

 



文献列表:







1

荐读 | EML4-ALK融合基因形成的F-circEA对于NSCLC的病理意义

2

荐读 | Aβ circRNA与阿尔茨海默病

3

优品 | 一群特立独行的DNA(一)

4

荐读 | 体外合成的circRNA可以用于肿瘤治疗?

5

荐读 | 印迹基因也可以形成circRNA?

6

小结 | 9月上半月circRNA研究报道汇总




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