小结 | 11月上半月circRNA研究报道汇总

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声 明

欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目，本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献28篇，下面我们一起来看看circRNA研究有哪些新进展。

1、来自胃癌外泌体的circRNA通过靶向miR-133/PRDM16途径促进白色脂肪褐变

文献标题：Exosomal circRNA derived from gastric tumor promotes white adipose browning by targeting the miR-133/PRDM16 pathway

期刊：Int J Cancer. 

影响因子：7.36

通讯作者单位：天津医科大学肿瘤医院

癌症相关的恶病质是一种代谢综合征，其特征在于脂肪和骨骼肌的消耗紊乱，并伴有体重减轻和全身性炎症。癌症恶病质的治疗选择是有限的，并且分子机制仍然知之甚少。环状RNA（circRNA）是一种新的内源性RNA家族，已被发现广泛参与调节哺乳动物的基因表达。外泌体是源自细胞的小囊泡，并且最近的研究表明circRNA在外泌体中稳定存在。然而，关于circRNA在外泌体中的生物学作用知之甚少。在这项研究中，我们发现在胃癌（GC）血浆外泌体中的circRNAs具有特异性表达特征，并且ciRS-133与GC患者中白色脂肪组织（WAT）的褐变相关。源自GC细胞的外泌体将ciRS-133递送到前脂肪细胞中，通过激活PRDM16和抑制miR-133促进前脂肪细胞分化成棕色样细胞。此外，ciRS-133的敲低减少了肿瘤移植小鼠的癌症恶病质，减少了氧气消耗和产热。因此，外泌体递送的circRNA参与WAT褐变并在癌症相关的恶病质中起关键作用。

图注：A:电镜检测分离自人血浆外泌体；B：NTA纳米颗粒示踪仪分析外泌体粒径；C：Western blot分析外泌体表面标志物；D:circRNA芯片初步筛查胃癌血浆来源外泌体中的circRNAs；E:RT-qPCR验证ciRS-133在胃癌血浆中显著高表达。

图注：F：相对于癌旁组织，ciRS-133在胃癌组织中显著高表达；G：生信预测发现ciRS-133上存在2个miR-133结合位点；H:ciRS-133与褐色脂肪组织（BAT）质量正相关；I：ciRS-133与个体脂肪比率负相关。

2、一种新的环状RNA circFAT1(e2)通过靶向细胞质中的miR-548g并与细胞核中的YBX1相互作用来抑制胃癌的进展

文献标题：A novel circular RNA, circFAT1(e2), inhibits gastric cancer progression by targeting miR-548g in the cytoplasm and interacting with YBX1 in the nucleus

期刊：Cancer Lett. 

影响因子：6.494

通讯作者单位：苏州大学第一附属医院

在本研究中，研究者通过分析挖掘GEO数据库中胃癌(GC)组织环状RNA (circRNA)表达谱。发现一个新的circRNA, has_circ_0001461，我们称之为circFAT1(e2)并进一步证实circFAT1(e2)在胃癌组织和细胞系中显著下调，并与胃癌患者的总体生存率相关。荧光原位杂交(FISH)分析显示circFAT1(e2)分布在GC细胞的细胞质中，也可分布在细胞核中。功能实验表明，circFAT1(e2)的过表达抑制了GC细胞的增殖、迁移和侵袭。然后，我们研究circFAT1(e2)是否作为microRNA-549g(miR-548g)的海绵并调控肿瘤抑制因子RUNX1在GC细胞中的表达。此外，我们发现位于核的circFAT1(e2)可以直接与Y-box结合蛋白-1 (YBX1)相互作用并抑制其功能。综上所述，circFAT1(e2)可能通过调节细胞质中的miR-548g/RUNX1轴，靶向细胞核中的YBX1，在GC细胞中发挥抑癌作用。

图注：A：通过生物信息学技术挖掘GEO中胃癌中差异表达的circRNA表达谱并绘制聚类热图；B：两个GEO数据集中存在两个重叠的circRNA（GSE100170和 GSE83521）；C: circFAT1(e2)基因组定位示意图；

图注：D:RT-PCR在gDNA和cDNA中验证circFAT1(e2)的表达；E:sanger测序验证circFAT1(e2)的反向拼接位点序列；F：RT-PCR检测circFAT1(e2)和linFAT1在放线菌D处理MGC803细胞中的表达情况；G：RT-PCR检测circFAT1(e2)和linFAT1在RNase R处理MGC803细胞中的表达情况；

3、环状RNA表达谱鉴定前列腺癌特异性环状RNA

文献标题：Circular RNA Expression Profiling Identifies Prostate Cancer- Specific circRNAs in Prostate Cancer

期刊：Cell Physiol Biochem. 

影响因子：5.5

通讯作者单位：上海复旦大学

前列腺癌(PCa)是严重损害男性健康的主要癌症之一，发病率和死亡率均较高，但目前对于前列腺癌的诊断和预后尚无理想的分子标志物。该研究采用ceRNA芯片在4对前列腺癌及癌旁组织中筛选差异表达环状RNA，以确定其是否可作为前列腺癌诊断的新生物标志物。利用Cytoscape软件构建了circRNA-miRNA-mRNA的差异环状RNA及其宿主基因调控网络。通过qRT-PCR技术验证微阵列数据。结果表明我们在PCa肿瘤中发现了1021个差异表达的环状RNA，并通过qRT-PCR分析证实了circ_0057558、circ_0062019和SLC19A1在PCa细胞系和肿瘤组织中的表达。我们发现，PSA水平与两种差异表达的环状RNA联合使用后，诊断性能AUC灵敏度和特异性(分别为0.938、84.5%和90.9%)均明显高于单独使用PSA(血清PSA的AUC为0.854)。此外，circ_0057558与总胆固醇呈正相关。circRNA-miRNA-mRNA分析的功能网络显示circ_0057558和circ_0034467调控了miR-6884, circ_0062019和circ_0060325调控了miR-5008。研究结果表明，circ_0062019和circ_0057558两个差异表达环状RNA和circ_0062019的宿主基因SLC19A1可作为前列腺癌潜在的新型生物标志物。

图注： circRNA芯片的散点图和聚类热图展示了circRNA和mRNA在前列腺癌组织和正常组织中的差异表达情况

图注：前列腺癌中差异表达circRNA的宿主基因gene ontology富集分析结果（前30个term）

表2:生物信息学预测4个差异表达的circRNA可能结合的miRNAs

图注：三个circRNA分子（circ_0057558, circ_0062019, circ_0075538）和SLC19A1在前列腺癌和癌旁组织中的差异表达情况（采用qRT-PCR技术检测）

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