circRNA研究汇总 | 20191223-1229

欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目，本期从pubmed中检索（收集最新发布的circRNA文献共计19篇，下面我们一起来看看，circRNA研究最近有哪些新进展。

检索式：circRNA[Title/Abstract]) OR Circular RNA[Title/Abstract] 

1、PTBP1调控CircRNA_001160的形成并通过CircRNA_001160/miR-195-5p/ETV1轴调节BTB的通透性。

标题：Biosynthetic CircRNA_001160 induced by PTBP1 regulates the permeability of BTB via the CircRNA_001160/miR-195-5p/ETV1 axis.

杂志：Cell Death & Disease

IF：5.959

通讯作者：薛一雪（中国医科大学基础医学院神经生物学教研室）

血液肿瘤屏障（BTB）的存在严重阻碍了抗肿瘤药物向中枢神经系统的运输，影响了神经胶质瘤的治疗效果。胶质瘤内皮细胞（GEC）是BTB的主要结构基础。环状RNA被认为是内皮细胞生长的重要调节剂。在这项研究中，研究者发现在GEC中，聚嘧啶束结合蛋白1（PTBP1）和circRNA_001160被显著上调。敲低PTBP1或circRNA_001160分别显著增加了BTB的通透性。作为miR-195-5p的分子海绵，circRNA_001160通过吸附miR-195-5p减弱了其对靶基因ETV1的负调控。此外，ETC1在GEC中过表达。ETV1绑定到紧密连接相关蛋白的启动子区域，并增加了启动子活性，从而显著提高了紧密连接相关蛋白的表达水平。该研究表明，PTBP1，circRNA_001160和miR-195-5p与抗肿瘤药物Dox的联合应用有效地促进了Dox通过BTB，并极大地诱导了神经胶质瘤细胞的凋亡。研究结果表明PTBP1/circRNA_001160/miR-195-5p/ETV1轴在调节BTB渗透性中至关重要，并为神经胶质瘤的治疗提供了新的靶点。

图注：PTBP1, circRNA_001160, miR-195-5p增强Dox的抗肿瘤效应促进U87细胞凋亡

2、小鼠视网膜发育的环状RNA转录组研究。

标题：The Circular RNome of Developmental Retina in Mice.

杂志：Molecular Therapy-nucleic Acids

IF：5.919

通讯作者：MengZhou和金子兵教授（温州医科大学附属眼视科医院）

环状RNA（circRNA）是一类具有广泛表达模式的非编码RNA，它们构成了基因组调控网络的重要组成部分。迄今为止，尚未很好地了解circRNA在视网膜（中枢神经系统的关键部分）中的表达模式和调控能力。在这项研究中，研究者对小鼠视网膜发育五个阶段（E18.5，P1，P7，P14和P30）的RNA进行了测序。总共鉴定出9,029个circRNA。大多数circRNA在不同阶段以特定的特征表达，它们的表达模式与宿主线性转录本不同。一些circRNA可以充当多个视网膜microRNA（miRNA）的海绵。此外，circTulp4可以充当竞争性内源RNA（ceRNA）来调节靶基因。值得注意的是，体内沉默circTulp4导致小鼠的外核层薄（ONL）和视网膜功能缺陷。另外，在视网膜变性模型（rd8小鼠）中，circRNA在疾病发作更早的时间点失调。总而言之，该研究提供了视网膜发育过程中第一个circRNA表达图谱，并突出了circRNA在视网膜发育和变性中的关键生物学作用。

图注：circRNA在小鼠视网膜发育阶段的表达特征

3、去极化相关的CircRNA调节神经基因表达，在某些情况下可能充当翻译模板。

标题：Depolarization-Associated CircRNA Regulate Neural Gene Expression and in Some Cases May Function as Templates for Translation.

杂志：Cells

IF：5.656

通讯作者：Murray J. Cairns（澳大利亚纽卡斯尔大学）

环状RNA（circRNA）是一类相对较新的RNA转录本，在哺乳动物脑中具有较高的丰度。该研究结果显示分化的神经母细胞瘤细胞中的circRNAs表达明显改变，去极化后有107个上调和47个下调的circRNAs。这与去极化细胞中microRNA（miRNA）（n = 269）和mRNA（n = 1511）表达的整体变化相吻合，表明circRNA-miRNA-mRNA的调控轴参与了对神经活动的细胞反应。生物信息学分析表明，环状RNA通过与常见miRNA相互作用来影响mRNA表达的能力。高表达的circRNA——circ-EXOC6B的功能缺失导致与EXOC6B功能相关的过程的大量mRNA的表达改变，这表明circRNA可能特异性调节与其宿主基因相关的基因。研究还发现，circRNA的一个子集，特别是在去极化细胞中与核糖体有关，表明它们可能被翻译成蛋白质。总体而言，这些数据支持circRNA在神经元活性相关的基因修饰和调控中起作用。

图注：分化的神经母细胞瘤细胞中的circRNAs表达谱

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