circRNA研究汇总 | 20200203-0209

欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目，本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献共计36篇，下面我们一起来看看，circRNA研究最近有哪些新进展。

检索式：(circRNA[Title/Abstract]) OR Circular RNA[Title/Abstract] 

1、circSamd4抑制PUR蛋白的成肌转录活性。

标题：circSamd4 represses myogenic transcriptional activity of PUR proteins.

杂志：Nucleic Acids Res. 

影响因子：11.147

通讯作者：Myriam Gorospe （美国NIH国家衰老研究所）

许多与年龄相关的慢性肌肉骨骼疾病，包括肌少症，骨关节炎，慢性心力衰竭和慢性阻塞性肺疾病，都与异常的肌肉发生有关。该文研究者先前发现随着年龄的增长，猴子骨骼肌中的circRNA表达发生变化，并提出其中一些circRNA可能会影响衰老过程中的肌肉功能。在这篇论文中，作者采用RNA测序分析鉴定了在肌肉分化过程中差异表达并在人类肌肉细胞中保守的circRNA--circSamd4，小鼠C2C12细胞在分化为肌管过程中，circSamd4表达水平显著增加，此外，沉默circSamd4后可延缓成肌过程并降低成肌标记物的表达。对circSamd4的Pulldown产物质谱分析发现，circSamd4与PURA和PURB相关，这两个肌发生抑制因子可抑制肌球蛋白重链（MHC）蛋白家族的转录。沉默circSamd4可以增强PUR蛋白与Mhc启动子的结合，而过表达circSamd4则会干扰PUR蛋白与Mhc启动子的结合。当使用缺少PUR结合位点的circSamd4突变体时，这些作用将被消除。该结果表明，PUR蛋白与circSamd4的缔合通过促成MHC的转录抑制而增强肌肉发生过程。

图注：circSamd4与PUR蛋白相互作用

2、lncRNA和circRNA编码多肽的肿瘤相关新功能。

标题：Emerging role of tumor-related functional peptides encoded by lncRNA and circRNA.

杂志：Molecular Cancer

影响因子：10.679

通讯作者：熊炜教授（中南大学肿瘤研究所）

通常认为非编码RNA不编码蛋白质，在肿瘤发展过程中主要起基因调控功能，它们也是重要的癌症诊断和预后生物标志物。但随着研究的推进，生物信息学和翻译组学已经开始阐明ncRNA编码的功能肽的作用和作用方式。这篇综述汇总了长非编码RNA（lncRNA）和环状RNA（circRNA）编码的小肽的最新进展。作者介绍了预测ncRNA编码肿瘤功能多肽的计算和分析方法，还介绍了许多特定的lncRNA和circRNA编码的蛋白，以及它们促进癌症或抑制癌症的分子机制。这些非编码RNA翻译功能多肽的研究信息和思路可能加快发现、开发和优化基于癌症的新型诊断，治疗和预后蛋白质有效的工具。ncRNA编码功能肽的作用在癌症研究中具有广阔的应用前景。这篇综述的目的是促进发现由ncRNA编码的更多功能性肽提供理论基础和相关参考，并进一步开发新的抗癌治疗靶标以及诊断和预后标志物。

图注：一些特定circRNA和lncRNA编码多肽的肿瘤功能

3、circRIP2通过miR-1305 /Tgf-β2/ smad3途径加速膀胱癌的进展。

标题：circRIP2 accelerates bladder cancer progression via miR-1305/Tgf-β2/smad3 pathway.

杂志：Molecular Cancer

影响因子：10.679

通讯作者：林天歆和黄健教授（中山大学孙逸仙纪念医院）

环状RNA在癌症中的研究主要分为两个部分，一个是确定其是否有致癌作用，另一个是证明其作为生物标志物的应用。在膀胱癌中，ciRS-7可通过升高p21来抑制膀胱癌的生长。缺氧诱导circELP3的升高可促进膀胱癌的进展和耐药性；环状RNA CEP128通过调节MAPK信号传导促进膀胱癌细胞的增殖和迁移；circHIPK3通过抑制乙酰肝素酶的表达减少肺转移。此外，作为生物标志物，血清和尿液中外泌体中的circPRMT5上调与膀胱癌患者的转移呈正相关。circ-ITCH 和circHIPK3 在膀胱癌组织中表达较低，并且与膀胱癌患者的分级，分期以及淋巴结转移呈负相关。综上所述，这些结果暗示了环状RNA在调节膀胱癌行为中的重要作用，并可作为膀胱癌的新型生物标志物。为了鉴定膀胱癌中更多的环状RNA，该研究重新分析了先前在2对成对的膀胱癌组织中的RNA-seq测序数据，发现circRIP2在膀胱癌组织中显著下调，并且与膀胱癌的分级，分期，转移以及患者预后更好相关。体外和体内研究表明，circRIP2通过Tgf-β2/ smad3刺激的EMT途径促进膀胱癌的增殖，侵袭和迁移。简而言之，该研究提供了第一个证据，证明circRIP2在膀胱癌中差异表达，并可预测癌症进展。有效的circRIP2活性通过激活miR-1305 /Tgf-β2/ smad3途径诱导EMT来加速膀胱癌的发展。该研究表明，circRIP2可能是膀胱癌患者的潜在生物标志物和治疗靶标。

图注：circRIP2在膀胱癌中表达及预后情况

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