circRNA研究汇总 | 20200127-0202

欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目，本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献共计24篇，下面我们一起来看看，circRNA研究最近有哪些新进展。

检索式：(circRNA[Title/Abstract]) OR Circular RNA[Title/Abstract]

1、精神病相关的环状RNA控制突触基因的表达和认知。

标题：A psychiatric disease-related circular RNA controls synaptic gene expression and cognition.

杂志：Molecular Psychiatry

影响因子：11.973

通讯作者：Nikolaos Mellios （新墨西哥大学医学院）

尽管环状RNA（circRNA）富集在哺乳动物的大脑中，但关于其参与脑功能和精神疾病的潜在功能知之甚少。这篇研究中，作者发现一种在额叶皮层神经元中大量表达富集的circRNA——circHomer1a，衍生自Homer蛋白同源物1（HOMER1），在精神分裂症（SCZ）和双相情感障碍（BD）患者的额叶前皮层（PFC）和诱导的多能干细胞来源的神经元培养物中均显著减少。此外，circHomer1a的改变与精神分裂症（SCZ）的背外侧前额叶皮层（DLPFC）和眶额叶皮层（OFC）发病年龄呈正相关。没有观察到SCZ发病年龄和线性HOMER1 mRNA之间的相关性，其表达在BD和SCZ死后大脑中基本不变。使用体内circRNA特异性敲低技术敲低小鼠额叶前皮层（PFC）中circHomer1a，结果显示circHomer1a调节了突触可塑性和许多精神病相关基因的可变剪切mRNA的表达。有趣的是，小鼠眶额叶皮层（OFC）中circHomer1a的敲低导致OFC介导的认知灵活性的特定缺陷。最后，作者证明了神经元RNA结合蛋白HuD与circHomer1a结合并可以影响其在额叶皮层中的突触表达。总的来说，该研究成果揭示了一种新型的精神疾病相关的circRNA——circHomer1a调节突触基因的表达和认知的灵活性。

图注：circHomer1a敲低后影响精神疾病和神经相关基因的可变剪切mRNA表达

2、胶质瘤中circ-MAPK4通过海绵吸附miR-125a-3p抑制经由MAPK信号通路的细胞凋亡。

标题：Circular RNA MAPK4 (circ-MAPK4) inhibits cell apoptosis via MAPK signaling pathway by sponging miR-125a-3p in gliomas.

杂志：Molecular Cancer

影响因子：10.679

通讯作者：尹东 和 刘安民（中山大学孙逸仙纪念医院）

神经胶质瘤是中枢神经系统（CNS）中最常见，最具侵略性的原发性恶性肿瘤，环状RNA在其中的作用还有很多未解之谜。在这项研究中，研究者通过生物信息学分析早期神经发育过程中的失调circRNA，筛选鉴定到circ-MAPK4（has_circ_0047688），circ-MAPK4在早期神经分化过程中被显著下调。在神经胶质瘤中，circ-MAPK4作为一种癌基因，被逆向上调并与神经胶质瘤的临床病理阶段有关（P <0.05）。最后，体内外实验证实circ-MAPK4在体外和体内均可促进神经胶质瘤细胞的存活并抑制其凋亡。此外，研究者还证明circ-MAPK4参与调节p38 / MAPK通路，从而影响神经胶质瘤的增殖和凋亡。miR-125a-3p（一种miRNA）通过削弱p38 / MAPK途径显示出肿瘤抑制功能，这种抑制作用可通过抑制circ-MAPK4而增强。抑制miR-125a-3p可以部分挽救p38 / MAPK磷酸化水平的提高和circ-MAPK4敲低诱导的凋亡增加。研究结论表明，circ-MAPK4是通过调节miR-125a-3p的p38 / MAPK信号通路在神经胶质瘤细胞存活和凋亡中发挥关键作用，可以作为神经胶质瘤治疗的新靶点。

图注：人神经胚状体和神经胶质瘤中circ-MAPK4的表达特征

3、综述：环状RNA数据库的现状和观点。

标题：Closing the circle: current state and perspectives of circular RNA databases.

杂志：Briefings In Bioinformatics

影响因子：9.101

通讯作者：Marieke Vromman，Pieter-Jan Volders和Pieter-Jan Volders（比利时根特大学）

环状RNA（circRNA）与多种疾病（包括癌症）密切关联。但是，大多数circRNA的精确功能和分子机制还不清楚。目前，许多研究者遵循不同的实验和计算方法鉴定circRNA，开发了多个circRNA数据库，为circRNA研究带来了许多便利。但当前的circRNA数据库存在几个主要问题，克服这些问题将大大提高该领域的发展。首先，由于circRNA的低丰度和高度特异性表达，以及各种测序方法，circRNA检测工具和数据分析方法不同，导致circRNA内容重叠，因此缺少真正的circRNA参考集。第二个主要问题是circRNA术语的模棱两可，跨不同数据库的circRNA的冗余名称甚至冲突名称都会导致重现性危机。第三，circRNA数据库本质上依赖于circRNA反向剪接拼接的位置，而选择性剪接可能导致circRNA具有不同的长度和序列。为了唯一地识别circRNA分子，需要完整的环状序列。第四，有些circRNA数据库注释了circRNA的miRNA结合和蛋白质编码潜力，但这些注释通常基于假定的circRNA序列。最后，一些数据库没有定期更新，包含不完整的数据或存在链接问题。在这篇综述中，作者对当前circRNA数据库及其内容，功能和可用性进行了全面概述。除了讨论有关circRNA数据库的当前问题外，作者还提出了一些重要建议。

表注：已有的circRNA数据库简介

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