人工设计环状RNA作为miRNA抑制剂治疗心肌肥大
2020年4月4日,新加坡国立大学Matthew Ackers-Johnson和Roger S-Y Foo为共同通讯作者在Molecular Therapy预先发表了一篇题为“Engineered circular RNA sponges act as miRNA inhibitors to attenuate pressureoverload induced cardiac hypertrophy”的文章,阐述了一种针对心室肥大高效又稳定的新型治疗策略,即人为构建可以靶向降解miR-132 / 212家族的circRNA海绵(circmiR),向心肌细胞递送circmiR,使肥厚性疾病特征减弱,心功能得以稳定([1])。
心力衰竭是很多心血管疾病晚期的共同特征,它在全世界都有着高发病率和死亡率,并构成重大的医疗负担,迫切需要新的治疗方法。miRNA在正常发育和动态平衡中起着至关重要的作用,其失衡涉及各种疾病的发病机制。因此,靶向miRNA是一条可利用的治疗途径。circRNA的经典功能是作为miRNA海绵,如果circRNA作为药物,可以解决半衰期短、脱靶效应和非代谢分子积累等传统药物缺点。
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circRNA海绵(circmiR)序列的设计
已知miR-132/212可以推动心脏病理性肥厚,设计可以降解miR-132/212的circRNA海绵(circmiR)。设计针对miR-132-3p完全匹配和不完全匹配的miRNA结合位点(MBS)。不完全匹配的MBS是不与miR-132-3p的9-12nt结合。设计的circRNA海绵交替与miR-132和miR-212结合,miRNA结合位点之间有6个核苷酸(nt)的裂缝,即不与miRNA结合的区域。为了使circRNA海绵环化,在它的两侧添加较长的反向互补内含子,使用发散引物的实时定量聚合酶链反应(qPCR)检测circmiR的头尾连接,并通过Sanger测序进行了验证。
图1 circmiR的设计和验证
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circmiR的功能测试与优化
使用双萤光素酶报告基因实验,证实设计的MBS对miR-132和miR-212有抑制作用。接下来,通过测试MBS不同间隔区长度,结合类型和总数的海绵作用来优化circmiR结构。设计miRNA结合位点间隔为6、12、24、36和72核苷酸,并验证它们对miR-132/212的抑制作用,12核苷酸的间隔显示出最好的效果。设计不同长度的MBS,随着MBS长度的增加,对miRNA的抑制作用在加强,12个核苷酸MBS达到峰值。检测完全和不完全匹配MBS的抑制作用,结果表明不完全匹配MBS抑制作用更强。然而,完全匹配MBS可以被miRNA降解。以上实验在大鼠的心肌细胞中执行,结果同上。得出一个最佳的circmiR,具有12个核苷酸间隔和12个核苷酸不完全匹配的MBS。
图2 circmiR设计的优化
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体内circmiR给药可减轻小鼠TAC模型诱导的疾病
作者验证了miR-132和miR-212在横向主动脉缩窄(TAC)心脏超负荷小鼠模型中上调。在TAC处理前一周,腹腔注射腺相关病毒,使心肌细胞(CM)转入circScram, circmiR和线性miR-132/212海绵,TAC处理后来观察各组心脏的受损情况。circmiR和线性miR-132/212海绵组小鼠与circScram组小鼠比较,室间隔(IVS)和左室后壁(LVPW)的厚度薄、心脏功能得以保留并且病理性肥大明显减轻。表明,circmiR具有与线性miR-132/212海绵一样的功能,可以治疗心脏功能受损。有趣的是,在circmiR和线性miR-132/212海绵组中miR-132和miR-212的丰度明显更高。这可能是由于螯合的miRNA保留而没有被降解引起的。
图3 circmiR可以减轻心力衰竭
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体外检测circmiR的疗效及其稳定性
利用排列内含子-外显子的方法在体外合成circmiR,顺序是5’端内含子-外显子1-miRNA海绵序列-外显子2-3’端内含子。随后,circmiR在体外转录和纯化,与antagomir比较对miRNA的抑制效果。antagomir为miRNA拮抗剂,可以治疗心肌肥厚,正在进行一期的临床试验。双萤光素酶报告基因显示,circmiR相比于antagomir和线性miRNA海绵,对miRNA的抑制更显著。circmiR的疗效是antagomir的两倍。因此,体外试验表明,合成的circmiR比antagomir疗效更加显著。
最后,证实circmiR的稳定性。HEK293T细胞转染circmiR或线性miRNA海绵的表达质粒,转染人工合成circmiR或线性miRNA海绵。用放线菌素D处理,在指定时间点测量两者的表达量,绘制circmiR和线性miRNA海绵随时间的变化图。在处理72小时,不管是人工合成还是质粒表达的circmiR都未曾被降解,相比较于线性miRNA海绵有更好的稳定性。
图4 人工合成circmiR及其疗效
图5 circmiR比较线性miRNA海绵更加稳定
参考文献
1. Lavenniah A, Anh Luu TD, Li YP, Lim TB, Jiang J, Ackers-JohnsonM, S-Y Foo R, Engineered circular RNA sponges act as miRNA inhibitors to attenuate pressureoverload induced cardiac hypertrophy, Molecular Therapy (2020), doi: https://doi.org/10.1016/j.ymthe.2020.04.006.
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