circRNA研究汇总 | 20200406-0412
欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目,本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献共计29篇,下面我们一起来看看,circRNA研究最近有哪些新进展。
检索式:(circRNA[Title/Abstract]) OR Circular RNA[Title/Abstract]
1、E2F1和EIF4A3介导的circRNA circSEPT9促进三阴性乳腺癌的发生和发展。
标题:The circRNA circSEPT9 mediated by E2F1 and EIF4A3 facilitates the carcinogenesis and development of triple-negative breast cancer.
杂志:Mol Cancer
影响因子:10.679
通讯作者:陈俊霞教授(重庆医科大学)
越来越多的研究表明,circRNA与许多癌症的癌变和发展密切相关。然而,到目前为止,尚不清楚三阴性乳腺癌(TNBC)中circRNA的生物学功能和潜在的分子机制。该研究中,作者使用RNA高通量测序研究了circRNA在四对TNBC组织和癌旁正常组织中的表达模式。通过qRT-PCR和原位杂交在两个TNBC队列中评估了circSEPT9的表达和预后意义。通过Kaplan-Meier方法绘制生存曲线,并进行了一系列的体外和体内功能实验,以研究circSEPT9在TNBC癌变和发展中的作用。从机制上讲,染色质免疫沉淀(ChIP),萤光素酶报告基因和RNA免疫沉淀(RIP)分析方法探讨了E2F1和EIF4A3对circSEPT9生物发生的潜在调控作用。此外,荧光原位杂交(FISH),荧光素酶报告基因和生物素偶联的RNA-pulldwon技术,验证TNBC中circSEPT9和miR-637之间的关系。结果表明:circSEPT9在TNBC组织中的表达增加,这与TNBC晚期临床和预后不良呈正相关。敲低circSEPT9可以显著抑制TNBC细胞的增殖,迁移和侵袭,诱导TNBC细胞凋亡和自噬,并抑制体内肿瘤的生长和转移。而上调circSEPT9则发挥相反的作用。进一步的机制研究表明,circSEPT9可以通过使miR-637海绵化来调节白血病抑制因子(LIF)的表达,并激活涉及TNBC的LIF / Stat3信号通路。该研究结论表明,E2F1和EIF4A3介导的circSEPT9通过circSEPT9 / miR-637 / LIF轴促进了三阴性乳腺癌的发生和发展。因此,circSEPT9可用作TNBC的潜在预后标志物和治疗靶标。
图注:circSEPT9促进三阴性乳腺癌的发生和发展的作用机制示意图。
2、(综述)在过去的几十年中出现的用于肝细胞癌的机制,诊断和治疗的新型核酸分子。
标题:The mechanistic, diagnostic and therapeutic novel nucleic acids for hepatocellular carcinoma emerging in past score years.
杂志:Brief Bioinform
影响因子:9.101
通讯作者:裘云庆教授(浙江大学第一附属医院)Feng Zhu(浙江大学药学院)。
尽管中心法则指出基因的命运是“ DNA转录RNA和RNA翻译蛋白质”,但核酸不仅存储和传递遗传信息,而且可调控细胞内重要活动,成为基因表达的调节剂。生物信息学为一系列新兴的新型核酸分子的研究做出了贡献。典型的如:microRNA(miRNA),长非编码RNA(lncRNA)和环状RNA(circRNA)在调节重要的生物学过程(尤其是恶性疾病)中起着至关重要的作用。由于恶性肿瘤的异质性,肝细胞癌(HCC)在诊断和治疗方面已存在巨大的局限性。该综述文章对过去的几十年中出现的用于HCC的机制,诊断和核酸治疗进行了系统的整理。特别是,作者将HCC相关的核酸分子的最新进展分为三个方面进行阐述:(i)概述了各种核酸分子及其修饰(miRNA,lncRNA,circRNA,ctDNA和ctDNA甲基化),它们在HCC诊断中起着潜在的生物标志物作用;(ii)三种主要非编码RNA(miRNA,lncRNA和circRNA)在基因调控中的不同模式,以及(iii)概述用于肝癌诊断和治疗的新型核酸在临床试验中的进展,并讨论其在临床应用中的可能性。总而言之,该综述详细探讨了HCC新型核酸分子的发展,从潜在的生物标志物到具体分子机制以及过去20年的早期临床应用进行了详尽阐述。
图注:HCC肝癌相关的circRNA分子统计表
3、环状RNA hsa_circ_0000326可作为miR-338-3p海绵来促进肺腺癌的进展。
标题:Circular RNA hsa_circ_0000326 acts as a miR-338-3p sponge to facilitate lung adenocarcinoma progression.
杂志:J Exp Clin Cancer Res
影响因子:5.646 ;
通讯作者:赵建平和熊维宁教授(华中科技大学附属同济医院)
该研究主要聚焦circRNA在肺腺癌中的作用机制研究。研究者首先使用微阵列芯片和qRT-PCR在人肺腺癌组织中鉴定了一种新型上调的circRNA分子——hsa_circ_0000326。然后,研究者通过功能获得和功能缺失研究测定肺腺癌细胞中的hsa_circ_0000326的生物学作用。生物信息学数据库用于筛选circRNA潜在的靶标miRNA,萤光素酶报告基因和RNA-FISH进一步验证了两者相互作用。通过WB实验检测下游蛋白质。最后,建立裸鼠异种移植,以评估hsa_circ_0000326体内的功能。研究结果表明,hsa_circ_0000326的高表达与人类肺腺癌的肿瘤大小,区域淋巴结状态和分化程度相关。此外,体外细胞功能实验,发现hsa_circ_0000326充当细胞增殖和迁移的正调节剂和凋亡的负调节剂。机理研究表明,hsa_circ_0000326充当miR-338-3p海绵并改变了miR-338-3p的功能,进而上调了其下游靶标RAB14的表达并影响了肺腺癌细胞的增殖,迁移和凋亡。总体而言,该研究结果揭示了hsa_circ_0000326在肺腺癌细胞的增殖,迁移和凋亡中的关键作用,并暗示hsa_circ_0000326可能代表了肺腺癌患者的潜在治疗靶标。
图注:hsa_circ_0000326在肺腺癌中的作用功能示意图
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