circRNA研究汇总 | 20200330-0405

欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目，本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献共计27篇，下面我们一起来看看，circRNA研究最近有哪些新进展。

检索式：(circRNA[Title/Abstract]) OR Circular RNA[Title/Abstract] 

1、通过合理设计前体链，T4 RNA连接酶2优先生产环形RNA分子而不需要splint。

标题：Preferential production of RNA rings by T4 RNA ligase 2 without any splint through rational design of precursor strand.

杂志：Nucleic Acids Res

影响因子：11.147

通讯作者：梁兴国教授（中国海洋大学食品科学与工程学院）

环状单链RNA在许多实际应用中很有前途，但尚未建立规模制备方法。以前，RNA环化是通过T4 RNA连接酶2（Rnl2，dsRNA连接酶）使用夹板实现的，但由于并发分子间聚合，收率低。该研究发现，各种功能性RNA（siRNA，miRNA，核酶等）被Rnl2显性地转化为环，而大小和序列没有明显的限制。关键是设计一种前体RNA，该前体RNA被高度激活以实现高效环化而不需要任何夹板。首先，通过Mfold模拟靶RNA环的二级结构，然后假设在一个位点切割，从而在末端形成一些分子内碱基对。简单地通过用Rnl2处理该RNA，可以选择性且有效地产生靶环。出乎意料的是，即使在3'-OH侧仅形成2 bp且在5'-磷酸侧不形成完全匹配的碱基对，也可以高产率（> 90％）获得环状RNA。通过将常规Rnl2缓冲液稀释至异常低的浓度，进一步抑制了聚合物副产物的形成。即使在高RNA浓度（例如50μM）下，也可以实现极高的选择性（> 95％）。

图注：Rnl2通过常规方法（A和B）或新方法（C和D）制备c-erbB-2特异性锤头状核酶环。

2、circFNDC3B编码的新型蛋白质通过调节结肠癌中的Snail抑制肿瘤进展和EMT。

标题：A novel protein encoded by circFNDC3B inhibits tumor progression and EMT through regulating Snail in colon cancer.

杂志：Mol Cancer

影响因子：10.679

通讯作者：张磊和郑俊教授（中山大学附属三医院）和Qiao Liang（悉尼西米德医院）

结肠癌（CC）是一种常见的恶性肿瘤。该研究发现circFNDC3B在多种癌症中发挥生物学功能。但是，尚不清楚circFNDC3B编码的潜在蛋白是否参与CC的致癌作用。研究者使用Sanger序列和RNase R消化测定法确认circFNDC3B的存在，并使用定量实时PCR评估circRNA的表达。然后进行荧光原位杂交（FISH）研究circFNDC3B的定位。使用LC-MS / MS对circFNDC3B编码的蛋白质进行鉴定。通过CCK8分析，集落形成分析，transwell分析，伤口愈合分析和动物实验评估了circFNDC3B-218aa对增殖，侵袭和迁移的功能。RNA测序和western blot用于鉴定由circFNDC3B-218aa调控的基因。最后，进行了葡萄糖代谢相关的测定，以进一步研究circFNDC3B-218aa的功能。结果表明：CircFNDC3B主要位于细胞质中，而在CC细胞系和组织中表达水平减少。circFNDC3B表达低的患者的OS（P = 0.0014）比高表达的患者短。此外，circFNDC3B抑制CC细胞的增殖，侵袭和迁移。circFNDC3B可以编码一种新型蛋白质circFNDC3B-218aa。此外，circFNDC3B-218aa而非circFNDC3B抑制了CC的增殖，侵袭和迁移。另外，体内实验暗示circFNDC3B-218aa上调对CC进展显示出抑制作用。通过RNA测序，蛋白质印迹和葡萄糖代谢相关的测定，结果发现circFNDC3B-218aa抑制Snail的表达，并随后促进FBP1在CC中的肿瘤抑制作用。新型circFNDC3B-218aa可以作为肿瘤抑制因子和潜在的生物标志物，可以为CC提供潜在的治疗靶点。

图注：circFNDC3B编码能力的评估

3、环状RNA circSKA3与整联蛋白β1结合，从而诱导侵袭性伪足形成、增强了乳腺癌的侵袭能力。

标题：The Circular RNA circSKA3 Binds Integrin β1 to Induce Invadopodium Formation Enhancing Breast Cancer Invasion.

杂志：Mol Ther

影响因子：8.402

通讯作者：杨柏华教授（加拿大多伦多大学）

转移性癌细胞通过形成动态的基于肌动蛋白的侵袭伪足，侵袭周围组织，从而降解周围的细胞外基质并允许癌细胞侵袭。调控RNA，包括环状RNA，已经牵涉到该过程中。通过微阵列芯片技术，研究者发现环状RNA circSKA3在乳腺癌细胞和人类乳腺癌组织中高表达，进一步发现，通过侵袭伪足的形成，乳腺癌细胞的侵袭能力与circSKA3表达正相关。从机制上讲，研究者将Tks5和整联蛋白β1鉴定为这些肿瘤来源的伪足中circSKA3的结合伴侣。过表达circSKA3赋予肿瘤体外和体内侵袭性增加。作者进一步确定了circSKA3，Tks5和整联蛋白β1之间的RNA蛋白结合位点。在肿瘤形成实验中，结果发现circSKA3表达促进了肿瘤的进展和invadopodium（侵袭伪足）的形成。circSKA3结合位点的突变或siRNA的转染抑制了伪足的形成。因此，该研究结果表明环状RNA circSKA3通过与Tks5和整联蛋白β1结合，促进了invadopodium的形成，促进了肿瘤的进展。

参考文献列表

转载请联系邮箱授权：[e-mail]

 近期热文 

“circRNA”微信公众平台由

『广州吉赛生物科技股份有限公司』运营，

旨在为circRNA研究同行

提供最新科研资讯和研究方法，

服务广大生命科学工作者和医学工作者。

如果您有好的文章或Idea，

千万别让它埋没，

欢迎大家分享或投稿。

小编在编辑微文时特别鸣谢，

另有惊喜送出！

投稿邮箱：[e-mail]

长按下方图片识别二维码，一起涨知识吧！

最新研究进展

分享科研干货

长按识别关注公众号

分享研究技巧

经验交流平台

长按识别进入群聊