circad数据库 | 基于ICD国际疾病分类的circRNA数据库

越来越多的证据表明circRNA在许多疾病中起着非常重要的作用，它们在这些疾病中有作为生物标志物或治疗靶点的潜在应用。印度CSIR-基因组学与整合生物学研究所的科学家，通过整理目前已发表的circRNA文献，创建了一个疾病相关的环状RNA的综合型数据库--circad database，该数据库根据ICD规范的国际标准疾病命名法对circRNA相关的疾病进行分类命名，还列出了circRNA测定的PCR引物详细信息，包括经过实验验证的细节，可供研究人员参考。circad是目前疾病相关环状RNA的最新的数据库。

注：国际疾病伤害及死因分类标准（英语：The International Statistical Classification of Diseases and Related Health Problems ，ICD）是世界卫生组织依据疾病的某些特征，按照规则将疾病分门别类，并用编码的方法来表示的国际通用的统一分类系统。《国际疾病分类》是确定全球卫生趋势和统计数据的基础，其中含有约5.5万个与损伤、疾病以及死因有关的独特代码，使卫生专业人员能够通过一种通用语言来交换世界各地的卫生信息。世界卫生组织新发布的《国际疾病分类》第11版草案首次将传统医学纳入分类系统。

Circad数据库目前收录信息统计如下：

疾病相关的circRNA数量：1388个

 涉及的疾病数量：150种

基因数：720个

对应的物种涉及了人、小鼠、大鼠、猪和鸡等，人（Homo sapiens）: 1270；小鼠（Mus musculus）: 66；大鼠（Rattus rattus）: 42；猪（Sus scrofa）: 6；鸡（Gallus gallus）: 4。

Circad数据库提供了友好的网页检索界面供研究者查询使用。

研究者可通过首页的搜索框，输入circRNA名称、gene名称、染色体坐标、物种名、疾病名，ICD-10编码或PMID（pubmed的文献编号）进行搜索。

Circad的搜索结果以表格形式返回，方便进一步统计整理。

同时，circad数据库也提供了具体circRNA的详细信息界面，记录了该circRNA的基因坐标、相关疾病名称、ICD编号、检测样本类型及数量、PCR引物序列、在疾病中的上下调状态及相关文献出处链接等。

circad数据库不仅对目前已研究circRNA进行了疾病分类，更贴心整理了文献给出的circRNA验证PCR引物序列及circRNA在疾病样本中的表达状态，极大方便了研究者对circRNA的认识速度。随着circRNA研究成果越来越丰富，我们也希望circad数据库能持续更新下去。

参考文献

1. Rophina M, Sharma D, Poojary M, et al. Circad: a comprehensive manually curated resource of circular RNA associated with diseases[J]. Database, 2020, 2020.

2.  国际疾病分类_百度百科

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