circRNA研究汇总 | 20200615-0621
欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目,本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献共计39篇,下面我们一起来看看,circRNA研究最近有哪些新进展。
检索式:(circRNA[Title/Abstract]) OR Circular RNA[Title/Abstract]
1、干细胞衍生的外泌体可通过新的外泌体/circHIPK3/FOXO3a途径防止细胞焦亡并修复缺血性肌肉损伤。
标题:Stem cell-derived exosomes prevent pyroptosis and repair ischemic muscle injury through a novel exosome/circHIPK3/ FOXO3a pathway.
杂志:Theranostics.
影响因子:8.063
通讯作者:李杨欣(苏州大学附属第一医院)
骨骼肌缺血性损伤仍然是一个严重的临床问题,目前尚无有效的治疗方法。本研究的目的是确定人脐带间充质干细胞衍生的外泌体(UMSC-Exo)是否可以通过释放环状RNA来修复缺血性损伤。为了产生后肢缺血模型,研究者通过外科手术结扎了C57BL / 6小鼠的左股动脉。使用来自缺血和对照肌肉的总RNA进行circRNA-seq分析,结果发现缺血性肌肉中circHIPK3的表达减少。为了探索circHIPK3在缺血性损伤中的作用,将小鼠在手术后随机分为三组:1)载体;2)UMSC-Exo;3)UMSC-Exo和靶向circHIPK3的siRNA(UMSC-Exo / si-circHIPK3)。UMSC-Exo处理显著增加了circHIPK3的表达并改善了血液灌注,运行距离和肌肉力量,注射UMSC-Exo / si-circHIPK3可以逆转这种现象,表明UMSC-Exo通过释放circHIPK3改善了肌肉功能。UMSC-Exo治疗还可抑制局部缺血诱导的细胞凋亡-炎症小体引起的细胞死亡,如NLRP3的激活,caspase-1的裂解以及随后IL-1β和IL-18的增加。生物信息学分析确定miR-421 / FOXO3a为circHIPK3的潜在靶点,荧光素酶报告基因分析证实了这一点。在C2C12细胞中敲除circHIPK3导致miR-421表达增加。研究者通过用LPS和ATP刺激C2C12细胞建立了体外模型。LPS和ATP处理导致circHIPK3的表达减少,而miR-421的表达增加,这一过程可被UMSC-Exo阻止。蛋白免疫印迹分析表明,当用UMSC-Exo处理细胞时,NLRP3的水平降低,胱天蛋白酶-1裂解。在miR-421抑制剂存在下,FOXO3a在C2C12细胞中的表达增加,而当用LPS和ATP处理细胞时,FOXO3a的表达减少。重要的是,FOXO3a的表达被UMSC-Exo上调,但是当存在si-circHIPK3时FOXO3a的表达降低。使用丧失/获得功能的方法,该研究证明了miR-421 / FOXO3a是circHIPK3的直接靶标,而UMSC-Exo通过释放circHIPK3来预防缺血性损伤,后者反过来调节miR-421,从而导致FOXO3a表达增加并抑制凋亡和释放IL-1β、IL-18。
图注:UMSC-EXo中的circHIPK3抑制炎性体诱导的骨骼肌细胞凋亡
2、Hsa_circ_0085576通过miR-498/YAP1轴促进透明细胞肾细胞癌的发生和转移。
标题:Hsa_circ_0085576 promotes clear cell renal cell carcinoma tumorigenesis and metastasis through the miR-498/YAP1 axis.
杂志:Aging (Albany NY).
影响因子:5.515
通讯作者:纪志刚教授(北京协和医院)
越来越多的证据表明,环状RNA(circRNA)在各种癌症中起着重要的调节作用。然而,尚不清楚circRNA在透明细胞肾细胞癌(ccRCC)的肿瘤发生和转移中起什么作用。在这项研究中,研究者使用生物信息学分析和一系列实验,表征了一种新型circRNA hsa_circ_0085576,其在ccRCC组织和细胞系中显著上调。高表达hsa_circ_0085576与肿瘤大小、临床分期、转移状态和较差的生存率显著相关。体外敲低hsa_circ_0085576可显著抑制ccRCC细胞的细胞增殖、迁移、侵袭和促进细胞凋亡。而hsa_circ_0085576的过表达具有相反的效果。此外,hsa_circ_0085576沉默在体内显著抑制了肿瘤的生长和转移,而hsa_circ_0085576的过表达在体内具有相反的作用。研究结果进一步表明,hsa_circ_0085576可以作为竞争性内源RNA与microRNA-498相互作用,从而减弱其对靶基因(YAP1)的抑制作用。最后,功能研究表明,在ccRCC细胞中,抑制hsa_circ_0085576可通过调节miR-498 / YAP1信号传导来抑制细胞生长和转移。基于这些发现,hsa_circ_0085576可能代表了ccRCC有价值的预后生物标志物和抑制肿瘤发生和转移的潜在治疗靶标。
图注:Hsa_circ_0085576通过YAP1信号通路促进ccRCC进展
3、RNA携带的多种信息:日全食还是隧道尽头的光?
标题:Multiple information carried by RNAs: total eclipse or a light at the end of the tunnel?
杂志:RNA Biol.
影响因子:5.477
通讯作者:Dr. Florent Hubé (巴黎大学)
大约15年前,研究者发现RNA不一定是编码的或非编码的,前体RNA可以产生不同类型的成熟RNA,这些发现跟RNA是否编码或长短没有必然联系。越来越多的研究都对RNA世界的这种二分类法(编码或非编码的、长或短)提出了挑战,但对RNA的传递信息多样性,在进一步的功能研究中还是很大程度上被忽略。该综述中,作者列举了相同RNA或由相同前体RNA产生的RNA在大多数生物体中的生物相关性最新案例,发现一个重要的结论即RNA的总体功能实际来自不同起源或不同功能的各种RNA之间的平衡来实现。所以当目标功能分子不是人们认知的那个分子时,此时考虑RNA分子的多样性对其下游功能研究显然至关重要。
图注:组成性或选择性剪接使蛋白质组和转录组的产物多样化
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