circRNA研究汇总 | 20200824-0830

欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目，本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献共计41篇，下面我们一起来看看，circRNA研究最近有哪些新进展。

检索式：(circRNA[Title/Abstract]) OR Circular RNA[Title/Abstract]

1、CircRNA通过与宿主基因相互作用抑制DNA损伤修复。

标题：CircRNA inhibits DNA damage repair by interacting with host gene.

杂志：Mol Cancer

影响因子：15.302

通讯作者：Ke Chen （武汉同济医院）, 何春江和魏蕾（武汉大学基础医学院）

环状RNA（circRNA）失调与癌症的发展和治疗耐药性密切相关。但是，目前circRNA的功能研究主要集中在其潜在的miRNA或蛋白质结合上，探讨circRNA对宿主基因DNA的更多潜在调节作用非常必要。该研究首先对临床乳腺癌样品进行了总RNA测序，并鉴定了circRNA和相应宿主基因在患者血液，肿瘤和邻近正常组织中的表达模式。使用qPCR，northern blot和原位杂交实验验证到circRNA——circSMARCA5的失调。进行了R-loop斑点印迹，DNA-RNA免疫沉淀和质谱分析等一系列实验探索circSMARCA5对SMARCA5的15号外显子转录的调控。研究结果发现circRNA在外周血中比其宿主线性基因平均表达更高。与邻近的正常组织相比，乳腺癌组织中的circSMARCA5减少，与宿主基因SMARCA5相反。circSMARCA5的过表达在体外和体内均可诱导乳腺癌细胞株的药物敏感性。此外，研究者还证明circSMARCA5可以与其亲本基因座结合，形成一个R-loop环，从而导致SMARCA5的15号外显子的转录暂停。CircSMARCA5的表达导致SMARCA5的下调和截短的非功能蛋白的产生，而circSMARCA5的过表达足以提高对细胞毒性药物的敏感性。该研究结果揭示了circRNA在其宿主基因上的新调控机制，并提供了证据表明circSMARCA5可以作为耐药性乳腺癌患者的治疗靶标。

图注：CircSMARCA5表达调控其亲本基因SMARCA5下调的作用机制模式图

2、环状RNA：大脑转录组的闪闪发光的一类分子。

标题：Circular RNAs: The Brain Transcriptome Comes Full Circle.

杂志：Trends Neurosci

影响因子：12.891

通讯作者：Irina Voineagu（新南威尔士大学）

环状RNA（circRNA）是一类RNA分子，具有通过外显子-外显子的反向剪接形成的共价闭环结构。多真核物种保守性，通常具有细胞类型和组织类型的特异性表达，circRNA的这些特征已经激发了人们对circRNA生物形成及其潜在功能的兴趣。circRNA在大脑中富集，并在神经元分化和去极化时积累，这表明这些RNA是大脑转录组的组成部分，并可能发挥功能。在这篇综述中，作者概述了对circRNA的生物形成和功能的当前研究进展，讨论了circRNA如何促进大脑中转录组的复杂性，并讨论了关于circRNA在大脑中的功能作用的最新数据。作者还讨论了关于circRNA在脑部疾病中的新兴的作用，探讨解决死后人类大脑中circRNA定量的常见挑战等问题。

3、MNDR v3.0：注释信息覆盖和收录更全面的哺乳动物ncRNA疾病数据库。

标题：MNDR v3.0: mammal ncRNA-disease repository with increased coverage and annotation.

杂志：Nucleic Acids Res 

影响因子：11.501

通讯作者：王栋教授（南方医科大学）

许多研究表明，非编码RNA（ncRNA）功能障碍与多种疾病密切相关。最近，ncRNA-疾病关联研究数据积累非常迅速，原有的相关数据库记录的数据慢慢不能满足现有生物医学研究的需求，因此ncRNA疾病数据库的不断更新已变得至关重要。研究者已将哺乳动物ncRNA疾病信息库（MNDR，http：//www.rna-society.org/mndr/）更新为3.0版。MNDR（哺乳动物ncRNA-疾病存储库）主要存储和管理ncRNA与疾病之间的关联一个数据库。MNDR数据库开发者通过人工整合从文献和其他资源中精选的实验支持和预测的ncRNA疾病关联数据，此次更新到最新版3.0版。MNDR v3.0包含超过一百万个ncRNA疾病条目，包括6,300多种miRNA，39,880个lncRNA，20,256个circRNA，10,894个piRNA和521个snoRNA，覆盖1,600多种疾病和11种哺乳动物。与以前的数据相比，此次更新数据增加了四倍。整合了实验性和预测性的circRNA疾病关联数据。此外，增加了ncRNA疾病相关的药物注释以及ncRNA亚细胞定位和相互作用，还提供了三种ncRNA疾病（miRNA/lncRNA/circRNA）预测工具，并且对网站也进行了优化，使其更加实用和用户友好。总而言之，MNDR v3.0将是用于研究疾病机制和临床治疗策略的宝贵资源。

图注：MNDR v3.0数据库网址：http://www.rna-society.org/mndr/

参考文献列表

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