circRNA研究汇总 | 20201012-1018
欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目,本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献共计12篇,下面我们一起来看看,circRNA研究最近有哪些新进展。
检索式:(circRNA[Title/Abstract]) OR Circular RNA[Title/Abstract]
1、环状RNA circPPM1F调节1型糖尿病的M1巨噬细胞活化和胰岛炎症。
标题:Circular RNA circPPM1F modulates M1 macrophage activation and pancreatic islet inflammation in type 1 diabetes mellitus.
杂志:Theranostics..
影响因子:8.579
通讯作者:周玉峰(复旦大学附属儿科医院)
已有研究表明巨噬细胞在1型糖尿病(T1DM)的发病机理中起关键作用。环状RNA(circRNA)是一类新型的具有共价闭环结构的内源RNA,涉及多种疾病过程。但是,它们对巨噬细胞激活和T1DM发病机理的影响仍然难以捉摸。该研究方法上采用全转录组芯片技术检测T1DM患儿外周血单核细胞(PBMCs)的circRNA表达谱,并进行了生物信息学、实时定量PCR、蛋白质免疫印迹(WB)、RNA免疫共沉淀(RIP)、细胞共培养、细胞增殖和细胞凋亡检测,以研究circPPM1F在体外的表达,功能和调控机制。在链脲佐菌素诱导的糖尿病小鼠模型中评估了circPPM1F在体内的调节作用。研究结果显示,在T1DM患者中鉴定了27个上调和31个下调的差异表达circRNA。circPPM1F是一种功能未知的circRNA,在单核细胞中占优势,在T1DM患者中明显上调。在功能上,circPPM1F通过增强NF-κB信号通路来促进脂多糖(LPS)诱导的M1巨噬细胞活化。从机理上讲,circPPM1F与HuR竞争性相互作用,削弱了蛋白磷酸酶Mg2 + / Mn2 +依赖性1F(PPM1F)的翻译,从而减轻了PPM1F对NF-κB途径的抑制作用。此外,真核起始因子4A-III(EIF4A3)和FUS在M1巨噬细胞激活过程中协同调节circPPM1F表达。此外,circPPM1F可能通过体内激活M1巨噬细胞而加剧链脲佐菌素诱导的糖尿病小鼠的胰腺损伤。研究结论表明:circPPM1F是通过circPPM1F-HuR-PPM1F-NF-κB轴激活M1巨噬细胞的新型正调控因子。circPPM1F的过表达可以通过增强M1巨噬细胞的活化来促进胰岛损伤,而circPPM1F可以作为儿童T1DM的新型潜在治疗靶点。
图注:circPPM1F在T1DM患者PBMC细胞中显著上调,并与炎症因子相关。
2、分析H7N9甲型流感病毒感染小鼠肺中circRNA的表达情况。
标题:Analysis of the circRNAs expression profile in mouse lung with H7N9 influenza A virus infection.
杂志:Genomics.
影响因子:6.205
通讯作者:平继辉 (南京农业大学动物医学院免疫研究所)
甲型流感病毒是一种单链RNA病毒,会在全球范围内造成极大的死亡率和经济损失。环状RNA(circRNA)是非编码RNA,已被证明在调节生物过程中具有重要功能。但是,它们在甲型流感病毒感染过程中的功能仍不清楚。本文中,研究者利用RNA测序技术鉴定在感染H7N9 / PB2-627 K / 701D(H7N9 / Wild型)病毒和PB2突变病毒(H7N9 / PB2-627E / 701D和H7N9 / PB2- 627E / 701 N)的小鼠肺中circRNA表达情况。在H7N9流感病毒及其突变病毒感染期间,在不同基因组位置共鉴定了7126个circRNA,其中186个差异表达。富集分析表明差异表达的circRNA与病毒感染过程有关。此研究表明,在H7N9甲型流感病毒感染后circRNA表达谱发生了改变,差异表达的circRNAs在病毒感染过程中可能具有重要的免疫调节功能。
3、CircPDZD8通过吸附miR-197-5p调节CHD9来促进胃癌的进展。
标题:CircPDZD8 promotes gastric cancer progression by regulating CHD9 via sponging miR-197-5p.
杂志:Aging (Albany NY).
影响因子:4.831
通讯作者:夏天放(淮安市第一人民医院)
CircRNA已显示与胃癌的肿瘤发生有关。但是对circPDZD8在胃癌中的作用了解甚少。CircPDZD8在胃癌组织和细胞中上调,Kaplan-Meier生存分析表明,当circPDZD8水平高时,胃癌患者的总生存期较差。CircPDZD8基因敲低可能会阻碍胃癌细胞的增殖和迁移。在胃癌中下调的MiR-197-5p被证明是circPDZD8的靶标,并且与circPDZD8的表达呈负相关。CHD9作为miR-197-5p的靶基因,被miR-197-5p负调控,并与circPDZD8表达正相关。重要的是,circPDZD8可以通过吸附miR-197-5p来上调CHD9的表达,并通过调节miR-197-5p / CHD9轴来调节胃癌中的细胞进程。敲低CircPDZD8后miR-197-5p上调并下调CHD9来抑制胃癌细胞的进程。
图注:CircPDZD8在胃癌组织和细胞中显著上调。
参考文献列表
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