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circRNA研究汇总 | 20201019-1025

Original 木禾 circRNA 2021-02-21

欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目，本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献共计73篇，下面我们一起来看看，circRNA研究最近有哪些新进展。

检索式：(circRNA[Title/Abstract]) OR Circular RNA[Title/Abstract]

1、肾细胞癌中的环状RNA：对肿瘤发生，诊断和治疗的意义。

标题：Circular RNAs in renal cell carcinoma: implications for tumorigenesis, diagnosis, and therapy.

杂志：Mol Cancer.Review

影响因子：15.302

通讯作者：王平（浙大一院）；傅湘辉（华西医院）；林伟强（浙江大学转化医学研究院）

肾细胞癌（RCC）是最常见的恶性肾脏肿瘤，发病率很高。环状RNA（circRNA）是具有广泛分布和多种细胞功能的非编码RNA。它们是高度稳定的，并具有器官和组织特异性的表达模式。CircRNA具有基本功能，如microRNA海绵，RNA结合蛋白和转录调节因子以及蛋白质翻译模板。最近的报道表明，circRNA在RCC中异常表达，并且是RCC癌变和进展的重要调节剂。此外，circRNAs已成为RCC诊断和预后的潜在生物标志物以及开发新疗法的靶标。但是，需要进一步的研究以更好地了解circRNA在RCC中的功能。在这篇综述中，作者总结并讨论了RCC相关circRNA的最新研究进展，重点关注其在RCC诊断和靶向治疗中的潜力方面。

图注：RCC相关的circRNAs的功能和参与信号通路。

2、TransCirc：基于多组学证据的可翻译环状RNA的交互式数据库。

标题：TransCirc: an interactive database for translatable circular RNAs based on multi-omics evidence.

杂志：Nucleic Acids Res.

影响因子：11.501

通讯作者：王泽峰研究员（中科院计算生物学重点实验室）；张国庆（中国科学院上海营养与健康研究所）

TransCirc（https://www.biosino.org/transcirc/）是一个专门提供全面的证据来支持人环状RNA（circRNA）的翻译潜力的数据库。该数据库是通过整合各种直接和间接证据来预测每个circRNA和推定翻译产物的编码潜力而生成的。包括circRNA翻译的七种证据：（i）支持核糖体在circRNA上的核糖体/多核糖体结合证据；（ii）实验定位的在circRNA上翻译起始位点；（iii）circRNA上的核糖体内部进入位点；（iv）已发表circRNA中促进翻译起始的N-6-甲基腺苷修饰数据；（v）circRNA特异性开放阅读框的长度；（vi）来自机器学习预测的所有潜在开放阅读框的序列组成分数；（vii）质谱数据，可直接支持circRNA编码的跨反向剪接连接的肽段。TransCirc提供了用户友好的搜索/浏览界面，可以预测circRNA的翻译可能性。另外，TransCirc开发了几种灵活的工具来辅助数据的检索和分析。TransCirc可以作为研究circRNA和潜在circRNA编码肽的翻译能力的重要资源，并且可以扩展为将来包括新证据或其他物种。

图注：TransCirc网站首页

3、CircRNA EPHB4通过海绵吸附miR-637并上调SOX10来调节神经胶质瘤的干细胞特性和增殖。

标题：CircRNA EPHB4 modulates stem properties and proliferation of gliomas via sponging miR-637 and up-regulating SOX10.

杂志：Mol Oncol.

影响因子：6.574

通讯作者：刘景平（中南大学湘雅医院）

神经胶质瘤是最常见的原发性脑肿瘤类型。circEPHB4是衍生自受体酪氨酸激酶EPHB4的环状RNA。但是，尚未研究circEPHB4在神经胶质瘤和神经胶质瘤癌干细胞（CSCs）中的临床意义和特定作用。该研究中，研究者发现在神经胶质瘤组织和细胞系中，circEPHB4（hsa_circ_0081519）和SOX10被上调，而miR-637被下调。circEPHB4与SOX10一致地正相关，但与miR-637负相关。这些分子表达的改变与患者的整体存活率独立相关。CircEPHB4通过直接海绵吸附miR-637来上调SOX10和Nestin，从而刺激神经胶质瘤细胞的干性，增殖和糖酵解。功能上，在神经胶质瘤细胞中沉默circEPHB4或增加miR-637水平足以抑制体内异种移植瘤的生长。总之，circEPHB4/miR-637/SOX10/Nestin轴在控制神经胶质瘤细胞的干细胞特性，自我更新以及糖酵解中起着核心作用，并可预测神经胶质瘤患者的总体存活率。靶向该信号轴可能为恶性神经胶质瘤提供治疗策略。

图注：表达水平上，circEPHB4与SOX10正相关，但与miR-637负相关

参考文献列表