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表观遗传系列视频15 | 同济大学张勇:ChIP-seq及DNA甲基化分析策略(附PPT)

2017-09-06 Epiview Epigenetics表观遗传学

 去年 8 月,「表观基因组学暑期国际讲习班」于复旦大学召开。大会邀请了国内外表观基因组学顶尖的学者,为学员们分享表观基因组学的最新进展。讲习班持续 10 天,积累了大量的视频教学资源,经过漫长整理,系列视频终于跟大家见面了。


今天分享第 15 期视频。其他系列视频将陆续发布,敬请持续关注。


主讲人简介:


张勇博士,2001 年毕业于北京大学地球物理系,获学士学位。2006 年毕业于中国科学院生物物理研究所,获得博士学位。2006-2009 年,在美国哈佛大学和 Dana-Farber 癌症研究所从事博士后研究。自 2009 年起被聘为同济大学生命科学与技术学院教授。


主持多项基金委、科技部和上海市科研项目。在国内外学术期刊上发表论文六十余篇,文章总计被引用超过 5500 次,其中作为通讯作者在 Nature, Genome Research, Genome Biology, Cell Research, Nature Protocols, Nucleic Acids Research, Bioinformatics 等期刊发表论文 20 余篇。先后获得上海市科技启明星计划(2009年)、教育部新世纪优秀人才支持计划(2011年)、上海市科技“启明星”计划(跟踪)(2013年)、国家自然科学基金委优秀青年科学基金项目(2013年)、中组部“青年拔尖人才”(2015年)、中国干细胞学会“干细胞青年研究员奖”(2016年)、上海市优秀学科带头人(2017年)。目前担任 Genome Biology 期刊编辑委员会成员、中国细胞生物学学会功能基因组学与系统生物学分会委员、中国遗传学会青年委员会委员、中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专业委员会委员、中国细胞生物学学会染色质生物学分会委员。


研究方向:针对高通量生物学数据,以发展生物信息学方法为核心,从核小体定位、组蛋白修饰、DNA甲基化等不同表观遗传层面,研究胚胎发育及干细胞分化中的表观遗传预编程机制。主要研究成果可以归纳成为三个方面:开发了包括 MACS 方法(被引用超过2300次)在内的一系列高通量生物学数据分析方法;揭示了脊椎动物在胚胎发育早期的表观遗传组建立过程及其与基因转录激活的关联;揭示了胚胎干细胞的表观遗传调控新机制。


演讲主题:ChIP-seq 及 DNA 甲基化分析策略

  • 基因剪接的生物学意义与检测 ChIP-seq 常用分析策略及问题分析

  • ChIP-seq 分析优化及标准化

  • 全基因组 DNA 甲基化分析策略及问题解析


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▲ ChIP-seq 及 DNA 甲基化分析策略(2h 33min)


PPT 获取:在后台回复“ZY”,即可获得本讲PPT下载链接。


特别声明:本系列视频版权归复旦大学表观基因组学暑期国际讲习班组委会所有,不得用于任何商业用途。


此前已经推送了 14 期视频:

视频1 | UCSD 任兵教授:3D基因组及其应用(附PPT)

视频2 | UCSD 任兵教授:表观基因组学及其方法学(附PPT)

视频3 | 北大伊成器:表观基因组动态调控与机制(附PPT)

视频4 | 北大肿瘤医院 邓大君:表观基因组学与肿瘤发生发展及转移

视频5 | 清华颉伟:表观遗传的遗传与重编程(附PPT)

视频6 | 港科大 Danny Leung:表观基因组学与胚胎发育(附PPT)

视频7 | 复旦马端:环境表观遗传学

视频8 | 复旦李伟:表观遗传学常用软件级网站资源介绍(附PPT)

视频9 | 复旦于文强:细胞核内miRNA的功能与疾病

视频10 | 中科院汪海林:DNA损伤修复的表观遗传学及DNA 6mA的动态调控

视频11 | 中科院杨运桂:RNA 修饰的表观遗传学

视频12 | 中科院杨力:环形 RNA 及其调控

视频13 | 复旦倪挺:表观遗传调控与可变剪接(附PPT)

视频14 | Penn State 岳峰:增强子与基因表达调控

更多精彩视频,敬请期待!


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