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Eteplirsen:杜兴式肌肉萎缩症(DMD)的外显子跳跃疗法

实验技巧 邦耀实验室 2022-03-29
导读
近期在一片争议声中,Eteplirsen成为第一个被FDA批准上市的杜兴式肌肉萎缩症药物。抛开其有争议的临床结果不谈,Eteplirsen本质是一种基于外显子跳跃疗法开发的寡聚核酸类药物,那么究竟什么是外显子跳跃,究竟是怎么起的作用呢?下面对于这个外显子跳跃疗法及治疗DMD的机制进行简单的介绍。


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杜兴式肌肉萎缩症简介

杜兴式肌肉萎缩症DMD (Duchenne Muscular Dystrophy)是一种严重的神经肌肉遗传性疾病,一种X染色体连锁隐性遗传病,国内一般称为杜氏型肌营养不良或假肥大型进行性肌营养不良。而且基本只有男孩子会得。大约每3500个男性婴儿会有1个患这种肌肉萎缩症。DMD是肌营养不良中发病率最高的一型。


由于肌肉细胞呈进行性破坏。若不治疗干预,两岁开始就逐渐表现走路艰难,不能跳跃,到12岁前就失去独立行走能力,进而更加恶化身体的骨骼等。到严重的时候不能控制咀嚼,不能控制排便,心肌萎缩,呼吸肌萎缩,最终因心肺功能衰竭在20~30岁死亡。


还有一种良性亚型,叫BMD(Becker Muscular Dystrophy),称为贝克型肌肉营养不良。由于体内能够保留部分的不完整的抗肌萎缩蛋白,患者通常较晚出现症状(5-15岁),临床表现较轻,发展相对缓慢,病程较DMD更长,寿命通常在50岁以上。


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DMD病因:

医学界普遍认为DMD是因为编码Dystrophin蛋白的基因突变缺陷引起的。Dystrophin基因定位于Xp21.1-p21.3,为迄今为止发现的人类最大基因,由79个内显子组成。在正常肌肉中,Dystrophin位于肌肉纤维细胞的细胞膜附近,通过α-dystroglycan 把肌肉细胞内的细胞骨架与细胞外的基质连接起来,肌肉才能够发挥正常功能。


当基因的缺失、重复或发生移码突变时,蛋白结构发生较大变化,不能形成有功能的Dystrophin蛋白。


正常外显子


DMD病人外显子(以Exon 49-50为例)



基因突变或缺失使蛋白功能缺失

功能缺失Dystrophin蛋白不能定位于细胞膜附近,肌细胞膜失去完整骨架,造成肌细胞膜损伤,肌肉细胞进行性破坏。


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外显子跳跃(Exonskipping)

Dystrophin蛋白并不是一个传统意义上的药物靶点如GPCR、受体、离子通道、酶等,他是迄今为止发现的人类最大基因,约2400kb,79个内显子组成,因此很难使用传统意义上的药物去回复蛋白功能。


但研究人员从BMD病人找到了灵感: BMD肌营养不良的病人,他们病情较轻,进展较慢,病人平均寿命能够达到50岁以上,BMD病人Dystrophin基因突变并不改变翻译阅读框架结构,且具有部分功能。科学家们通过外显子跳跃药物实现在DMD病人中表达有部分功能的Dystrophin蛋白(类似BMD病人体内蛋白),可能会大大缓解病情。


究竟外显子跳跃药物是什么呢?想要了解外显子跳跃首先要理解mRNA的可变剪接。大多数真核生物的基因均由多个外显子及内含子构成。基因表达过程中,基因被转录成包含多个外显子及内含子的Pre-mRNA,Pre-mRNA在间接复合体的作用下切除内含子,连接外显子,形成mRNA并在细胞质内翻译成蛋白质。


真核细胞pre-mRNA的剪接位点处存在一定的序列保守性,内含子5’端(供体位点)和3’端(受体位点)的碱基几乎都是GT和AG,因此称为GT-AG规则。有些基因的一个mRNA前体通过不同的剪接方式(选择不同的剪接位点)产生不同的mRNA剪接异构体,这一过程称为可变剪接(或选择性剪接, alternative splicing)。在剪接过程中在哺乳动物中,外显子跳跃是可变剪接的最常见形式。

外显子跳跃药物

外显子跳跃药物的作用机制与可变剪接类似,外显子跳跃是通过药物改变mRNA剪接方式,跳过DMD病人产生错误的外显子,表达类似BMD病人仍具有部分功能的Dystrophin蛋白,治疗DMD疾病。其核心有二:1. 靶蛋白有多个外显子,缺失部分外显子后蛋白仍有全部或部分功能;2.通过靶向pre-mRNA剪切位点产生可变剪接mRNA。


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Eteplirse作用机理

Dystrophin在转录后形成包含外显子内含子的 pre-mRNA,在细胞内被剪接复合体识别,通过剪切,形成mRNA,然后翻译成为蛋白质。是一段靶向Dystrophin Pre-mRNA的反义核酸类似物,其序列为CTCCAACATCAAGGAAGATGGCATTTCTAG。


其序列与细胞内Dystrophin 的Pre-mRNA中第51号外显子及其前部的剪切信号配对,并特异性结合,阻断了剪切必须的信号序列,形成不能够被剪接复合体识别的结构。剪接复合体跳过产生错误蛋白的51号内显子,产生缺少51号外显子的mRNA,通过外显子跳跃的方式实现可变剪接,产生类似BMD病人的具有部分功能的Dystrophin蛋白,减轻DMD症状。



可以用以下句子比喻:

正常人Dystrophin蛋白:

The mad cat ate the fat rat.


BMD病人Dystrophin蛋白:

The mad cat ate the fat rat.

The mad cat ate the rat.


DMD病人蛋白突变:

The mad cat ate the fat rat.

The mad cat ate hef atr at.


DMD病人exon skipping疗法:

The mad cat ate the  fat rat.


Eteplirsen本质是寡聚核酸类似物。核酸类药物本身的稳定性较差,蛋白结合率高,容易被核酸酶降解,且容易被TLR识别,发生自身免疫反应;为了提高成药性,对核酸的核糖骨架进行修改,以PMO(phosphorodiamidate morpholino oligomers)为骨架(如下)。


修饰后的核酸解决了上述问题,电荷中性大大降低了蛋白结合率及脱靶效应,不激活TLR通路,半衰期达到3-5小时,提高了成药性。

 

 

参考文献:

Aartsma-RusA, van Ommen GJ. Progress in therapeutic antisense applications forneuromuscular disorders. Eur J Hum Genet.2010 Feb;18(2):146-53. doi: 10.1038/ejhg.2009.


Kole R, Krainer AR, Altman S. RNA therapeutics: beyond RNA interference andantisense oligonucleotides. Nat Rev DrugDiscov. 2012 Jan 20;11(2):125-40. doi: 10.1038/nrd3625.


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