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根据国家税务总局工作部署，全国各省市税务局于2019年11月1日起全部正式上线运行增值税发票综合服务平台。外贸企业、外贸综合服务企业需在增值税发票综合服务平台完成退税发票、代办退税发票的勾选与确认、出口转内销发票勾选和查询、抵扣勾选与退税勾选相互调整等业务。为确保纳税人出口退税业务顺利开展，现整理了相关操作指引，供纳税人在日常申报操作中参考。
01
外贸企业、外贸综合服务企业操作注意事项
（一）登陆增值税发票综合服务平台需使用金税盘、税控盘或税控Ukey。
（二）未在增值税发票综合服务平台上进行退税勾选确认的增值税专用发票，不能用于出口退税。
02相关操作流程
（一）出口退税勾选操作流程增值税发票综合服务平台“退税勾选”模块下设“发票退税勾选”、“退税批量勾选”、“退税确认勾选”和“退税勾选统计”四项功能。外贸企业、水电气等其他企业、外贸综合服务企业具有“退税勾选”功能权限，可作退税勾选的发票类型为增值税专用发票（不包括代办退税专用发票）。
外贸企业退税勾选的流程为：先通过“发票退税勾选”和“退税批量勾选”功能逐票勾选或批量勾选多份发票，再通过“退税勾选确认”功能进行确认。外贸企业未进行退税勾选确认的发票不能用于出口退税，一个自然月内可对当期勾选的发票进行多次确认，一经确认无法撤销。
注意：外贸企业退税勾选成功后，必需在“退税确认勾选”功能对已勾选为退税用途的发票进行确认，确认成功才能完成退税发票的认证；如果未做退税确认勾选，相应发票不传递到出口退税审核系统，会导致获取不到发票信息无法受理退税申报。
（二）“抵扣勾选”与“退税勾选”相互调整的操作
1.“抵扣勾选”调整为“退税勾选”
外贸企业误将用于退税的增值税专用发票，勾选为抵扣，区分以下不同情形调整。
⑴若应勾选为退税的数据错误勾选为抵扣，但该发票尚未用于纳税申报的，应按以下规则处理。
①已“抵扣勾选”数据尚未“申请统计”和“确认签名”的，纳税人可以自行将用途调整为退税：撤销勾选框中的“√”，点击提交确认，这些发票就会再次回归到未勾选状态。这时就可以进入退税勾选模块对该发票进行退税勾选。
②“抵扣勾选”数据已“申请统计”或“确认签名”，但尚未进行纳税申报的，企业应先撤销“确认签名”并撤销统计，然后按照前一种情形进行操作，即取消原勾选，再在“退税勾选”中进行勾选。
⑵若应勾选为退税的数据错误勾选为抵扣，且该发票已增值税纳税申报的，应按以下规则处理。
①当月的增值税纳税申报如果可以撤销，纳税人可以在撤销申报之后，在“增值税发票综合服务平台”的首页选择“回退税款所属期”重新回到上一所属期，再按照上述第一条第（一）款第2项的方法操作即可（撤销“确认签名”和“申请统计”，然后撤销“抵扣勾选”并进行重新“退税勾选”）。
②当月的增值税纳税申报如果不能撤销，那么纳税人应向主管税务机关申请办理《增值税扣税凭证进项税额转出情况核实函》业务，并按审核结果进行处理。
注意：提出《增值税扣税凭证进项税额转出情况核实函》申请前，首先应将相应的税款从进项税额中转出，且每张发票只能开具一次《增值税扣税凭证进项税额转出情况核实函》
2.“退税勾选”调整为“抵扣勾选”
外贸企业误将用于抵扣的增值税专用发票，勾选为退税，区分以下不同情形调整。
⑴已“退税勾选”但未“确认退税勾选”的发票，发现勾选错误，需要调整为“抵扣勾选”的，应按以下规则处理。
可以撤销勾选框中的“√”，点击提交确认，这些发票就会再次回归到未勾选状态。这时就可以进入抵扣勾选模块对该发票进行抵扣勾选。
⑵已“退税勾选”且已“确认退税勾选”的发票，发现勾选错误，需要调整为“抵扣勾选”的，应按以下规则处理。
①如果该发票尚未申报退税，纳税人应使用外贸企业出口退税申报系统（或出口退税综合服务平台），在“其他申报向导—发票误勾退税且未报退税申请录入”模块生成申报数据，再通过出口退税综合服务平台提交相应申报数据。企业可在审核通过的次日后，在增值税发票综合服务平台的抵扣勾选功能模块重新进行抵扣勾选。注意，进行以上操作应确保该发票尚未进行退税申报。
②如果该发票已经申报退税，且符合开具“出口转内销证明”的条件，企业可向税务机关申请“出口转内销证明”。在税务机关审核通过次日之后，可以登录“增值税发票综合服务平台”，在“出口转内销发票勾选”模块进行勾选，然后进行统计、确认，相关税款可以用于抵扣。
（三）外贸综合服务企业代办退税勾选操作增值税发票综合服务平台“代办退税勾选”模块下设“代办退税勾选”、“代办退税批量勾选”和“代办退税统计”三项功能。“代办退税勾选”功能仅适用于外贸综合服务企业对有代办退税标识的增值税专用发票（即备注栏注明“代办退税专用”的专用发票）进行勾选。
勾选流程为：通过“代办退税勾选”和“代办退税批量勾选”功能，逐票勾选或批量勾选多份发票。
注意：代办退税勾选流程无需确认，一经勾选不可撤销。
03外贸企业原已认证发票信息下载流程
外贸企业通过电子税务局“我要办税→出口退税管理→出口退税在线申报→出口退（免）税申报→认证发票反馈下载”，按起始年月、截止年月下载相关的增值税发票认证信息后导入到外贸企业出口退税申报系统。