让测序流行起来！1min读懂RNA测序文库三部曲之MGIEasy RNA文库制备试剂套装

如何利用10 ng - 1 μg total RNA快速制备NGS文库，更准确地得到转录本序列、丰度信息，发现新转录本，分析转录本结构变异？华大智造MGIEasy RNA文库制备试剂套装了解一下！全文约800字，阅读时长1min。

  背景介绍

与DNA相比，RNA的种类更多，包括mRNA、小RNA、长链编码RNA、核糖体RNA、环状RNA等。不同类型的RNA在测序文库的制备过程中，需要不同的制备工具和平台。基于华大智造高通量测序平台BGISEQ/MGISEQ的RNA文库制备，已基本涵盖RNA-seq、转录组测序、total RNA测序、lncRNA测序和小RNA测序等多个研究方向，可搭配不同RNA富集方法及不同测序读长。

针对RNA测序，华大智造MGIEasy RNA文库制备试剂套装可利用10 ng - 1 μg total RNA快速制备NGS文库，更准确地得到转录本序列、丰度信息，发现新转录本，分析转录本结构变异，适用于人、动物、植物等多物种的基因表达和转录组研究。

  数据测评

以Universal Human Reference RNA（UHRR）标准品为测试样本，利用华大智造MGIEasy RNA文库制备试剂套装进行文库构建，在MGISEQ-2000上采用PE100测序。在基因组比对率、基因比对率、基因检出数、转录本检出数、重复性等性能方面进行评估，不同样本起始量下构建的文库均具有出色的测序数据质量。特别地，通过与不同平台不同试剂盒的转录本覆盖度对比分析表明，华大智造MGIEasy RNA文库制备试剂套装能够高度均匀的覆盖转录本5’端至3‘端，具有更优异的3’端覆盖度。

基因组/基因区比对率

图1  不同样本起始量下的基因组/基因区比对率

基因检出数及转录本检出数

图2 不同样本起始量下的基因检出数及转录本检出数

重复性

（点击查看大图）

图3 不同样本起始量的建库测序结果一致性比较

转录本覆盖度

图4 不同平台不同试剂盒的转录本覆盖度

想要了解更多？

欢迎关注ICG卫星会

基因组学技术与应用研讨会

线下注册名额大放送

长按二维码获取详情

拓展阅读