用户测评丨凌恩生物基于华大智造DNBSEQ-G99的环境DNA检测方案

环境DNA测序技术可应用于水、土壤和大气环境的监测，是评估生态环境状况和生物多样性的重要手段，也是环境科研领域的重要工具。
为了共同搭建环境DNA科研生态、聚焦组学研究热点，国内环境DNA检测领域领先企业凌恩生物，基于华大智造DNBSEQ-G99平台，推出eDNA metabarcoding（环境DNA宏条形码）检测项目。

eDNA（environmental DNA）即环境DNA，是指环境介质（土壤、水源、空气）中存在的DNA，在我们生存的环境内，到处都可能存在生物体释放的DNA（如毛发、粘液、唾液、尿液粪便等）。

图1. eDNA来源

利用高通量测序技术检测和分析环境样本中每个物种释放痕量DNA，可以在不破坏生态系统的情况下检测物种是否存在，或进行具体物种的种属鉴定。动态的eDNA检测，亦可研究生物多样性的动态变化、监测生态系统的演变等。基于高通量测序的eDNA检测技术具有高灵敏度、高分辨率、高效快速和低样本量需求的特点，已成为研究生态环境的强大工具，未来将赋能多个应用方向。

图2. eDNA检测技术应用方向得益于“速度王者”DNBSEQ-G99 快速、灵活、简单、读长选择多样化等优势，凌恩生物基于G99平台，推出eDNA metabarcoding测序技术服务，在确保更快交付准确可靠检测数据的前提下，提升eDNA检测效率，降低相关项目的科研成本，更好服务于我国的环境生态工作。

01产品方案

eDNA多样本类型建库：

水体样本淡水鱼类eDNA检测，引物选择：Tele02，扩增子长度~200bp。

底泥样本水生植物eDNA检测，引物选择：rbcL，扩增子长度~520bp。

测序方案：

华大智造DNBSEQ-G99 （PE300测序）

分析方案：

凌恩生物配套eDNA分析方案

02检测流程

图3. 凌恩eDNA metabarcoding测序技术检测流程示意图

03eDNA检测物种的检出情况

无论是较短的扩增产物（如：淡水鱼类eDNA引物 Tele02），还是较长的扩增产物（如：水生植物eDNA引物 rbcL），利用G99平台均可以高灵敏度检测物种的存在状态。

图4. eDNA种水平物种分类统计（上图：水生植物研究；下图：淡水鱼类研究）

注：测序方案及结果来源于凌恩生物

除了建库测序周期更短、检测更高效，G99平台还能满足较大范围的扩增子长度检测类型，尤其对较长片段扩增子检出及分类注释的效果好，可匹配多方向eDNA检测项目需求。

04凌恩生物基于G99测序平台eDNA项目特色

多种样本类型核酸提取方案

凌恩生物eDNA metabarcoding检测项目，针对水体、土壤、底泥、空气、动物消化道内容物等多种类型样本开发出特色eDNA核酸提取方案，解决eDNA含量极低微且难以获取的技术瓶颈，攻克多种类型eDNA研究方向，能够为广大生态研究科学家提供高效稳妥的eDNA研究办法。

数据急速交付效率

凌恩生物eDNA Metebarcoding技术，联合“速度王者”G99测序平台，开展PE300测序，测序步骤仅需30小时即可完成，可满足不同长度片段eDNA扩增子研究需求，适用于更多类型eDNA引物测序，可短时间内快速获得测序数据，极大程度压缩科研成本及科研时间，为科研用户提供更广阔的研究空间。

升级eDNA分析流程及个性化数据库定制

凌恩生物历经五年精心打磨eDNA专属分析流程。更大、更全面的鱼类物种注释数据库，目前包含淡水鱼类名录18686种，海水鱼类名录17828种，并增加濒危物种鱼类分析、潜在外来物种检测分析、配图及中文描述。更多实用型分析内容，检测更精准，更适合中国科研用户。

产出数据产出稳定、快速、准确

凌恩生物引入华大智造DNBSEQ-G99测序平台，采用华大智造核心的DNBSEQ测序技术，依据其高准确性、低重复序列、低标签跳跃等优势，打造凌恩生物eDNA metabarcoding检测项目专属实验及分析流程，助力科研用户取得准确的检测结果、精准分析生态构成、实时监测环境变化。

G99测序平台除了具有PE300等多样的读长选择，以其极致的测序速度、灵活简单的上机体验、通量适宜的载片规格，完美地解决了在16S等测序服务中凑样困难、交付周期长等痛点问题。G99广泛多样的应用场景，将持续赋能高通量测序技术在生态环境领域的快速发展。

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