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CAS SciFinder Discovery Platform检索案例 | 医药中间体的酶催化信息获取

CAS ACS美国化学会 2023-03-21

CAS SciFinder Discovery Platform是美国化学文摘社(CAS)出品的权威化学及相关学科智能研究平台,提供全球全面、可靠的化学及相关学科研究信息和分析工具,集成新一代的SciFinder平台CAS SciFindern、分析方法解决方案CAS Analytical Methods以及配方(制剂)解决方案CAS Formulus


检索案例精选”栏目将为大家介绍CAS SciFindern在各领域中的具体应用。这些案例将展示目标问题、检索思路、检索过程、检索结果。


无论您是刚刚接触CAS SciFindern的检索新手,还是多年老用户,都能从中获得启示。也欢迎您向我们的栏目投稿,展示您的检索技能和思路,或告诉我们您希望看到哪个研究领域应用案例。欢迎给我们发邮件:china@acs-i.org


医药中间体的酶催化信息获取


检索内容:医药中间体的酶催化反应、作为催化剂的酶序列等信息,以旋光性胺外消旋体的酶催化手性拆分为例。


推荐检索策略:

方法一:从物质检索出发,获取具有特定立体构型的物质结果,再获取相关生物转化/酶催化反应信息。

方法二:从序列检索出发,获取物质/酶序列关联文献中的反应。

方法三:从文献检索,利用文本和结构联合检索,再获取文献相关反应。

还可利用CAS Analytical Methods查看手性拆分中涉及的分析物的分析方法


方法一

在结构编辑器中,分别绘制 (上传结构文件、或利用CAS RN、SMILES或InChl编码输入结构) 酶催化反应的底物、产物结构,执行物质检索,选择立体异构类型,分别获取作为底物或产物的相关反应,保存结果,用combine功能取交集,获取目标反应。


1. 绘制底物结构。如:旋光性胺外消旋体


2. 如允许查询结构发生非氢取代,选择查看亚结构Substructure;对于外消旋体,选择Stereochemistry筛选项No Stereo in Answer Structure。

选择As Drawn,获取精确结构检索结果;

选择Substructure,获取包含绘制结构的亚结构的检索结果。


3. 获取关联的反应,并限定其作为起始物reactant,并保存检索式。


4. 绘制产物结构。立体键绘制为S型或R型 (按需求) 。如允许查询结构发生非氢取代,选择查看亚结构Substructure;选择Stereochemistry筛选项下Absolute Stereo Match 、Absolute Stereo Mirror Image、Relative Stereo Match。


5. 获取关联的反应,并限定其作为产物product,并点击与已保存reactant的检索式合并取交集Intersect,来精准获取手性拆分反应。


利用科学家标引的信息快捷获取酶催化反应、特定酶作为催化剂的反应。

6. 获取combine的反应,在反应结果集筛选项Reaction Notes下选择Biotransformation和Enzyme选项。

反应结果集筛选项Catalyst下选择目标酶类相关选项,来获取特定酶类作为催化剂的反应。


7. 查看反应结果。


Synthetic Methods获取CAS科学家增值标引的反应详情。


查看文献结果集关联的物质/生物序列。

在物质结果筛选项Substance class下,选择Protein/Peptide Sequence或Nucleic Acid Sequence,获取生物序列。


在Reaction Role筛选项下勾选Catalyst,查看由科学家明确标引作为反应催化剂的序列;在Reference Role下,查看由科学家明确标引了文献中研究角色为Catalyst Use的序列。


点击CAS RN,查看酶序列信息。


方法二

酶序列检索


查看序列结果,获取关联文献。


查看关联反应,二次筛选目标产物结构的反应。


方法三

文献检索,可利用文本和结构联合检索,获取关联的反应和酶的信息。


分析方法

还可在CAS Analytical Methods查看手性拆分相关分析方法

访问网址:https://methods.cas.org

在分析方法分类中选择Chiral Separation。

选择分析物、基质、方法、技术&仪器、年份,快捷定位目标物质的手性拆分分析方法。


CAS Analytical Methods查看分析方法详情

所用材料、标题摘要、著录信息、仪器、实验条件、操作步骤和数据有效性验证等。


总结:

CAS SciFinder Discovery Platform支持使用多种方法获取医药中间体的酶催化反应、作为催化剂的酶序列等信息。

CAS科学家人工标引,能够揭示隐藏在数据间的隐秘关联,助力精准定位目标信息。


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