精选 | 基于DNBSEQ平台的新冠科研文章回顾

回顾刚刚过去的2020年，华大与广大科研工作者一道，在疫情重压下仍实现了不少学术突破。面对疫情，科学的力量增强了我们应对危机的信心。2020年，DNBSEQ平台助力各地疾病预防控制中心、公共卫生研究院、高校实验室等科研人员发表了数十篇新冠科研文章，以下精选部分成果邀您一同回顾。

1、新冠病毒的流行病学和基因组特征

文章标题：Genomic characterisation and epidemiology of 2019 novel coronavirus: implications for virus origins and receptor binding

发表时间：2020.1.30

发表期刊：The Lancet

影响因子：59.102

作者团队：中国疾控中心、山东第一医科大学、华大等

内容概述：采集新冠病人肺泡灌洗液样本，提取核酸进行高通量测序，通过进化树分析发现，2019-nCoV与两种源自蝙蝠的SARS类似冠状病毒的关联最为密切。

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DNBSEQ平台

2、基于DNBSEQ平台的支气管肺泡免疫微环境图谱绘制

文章标题：Single-cell landscape of bronchoalveolar immune cells in patients with COVID-19

发表时间：2020.5.12

发表期刊：Nature Medicine

影响因子：36.130

作者团队：国家感染性疾病临床医学研究中心、复旦大学附属上海市公共卫生中心、以色列魏兹曼研究所、深圳市第三人民医院等

内容概述：该研究描绘了与新冠肺炎COVID-19严重程度相关的肺泡灌洗液（BALF）免疫细胞特征，发现严重COVID-19患者的支气管肺泡灌洗液中富含促炎性单核细胞来源的巨噬细胞；中度病理的特征是存在高度克隆扩增的CD8+T细胞，为理解COVID-19重症化免疫学机制提供了重要研究数据，为寻找疾病的免疫干预策略提供了重要线索。

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3、揭示新冠肺炎与流感的免疫特征差异

文章标题：Single-cell sequencing of peripheral blood mononuclear cells reveals distinct immune response landscapes of COVID-19 and influenza patients

发表时间：2020.7.19

发表期刊：Immunity

影响因子：22.553

作者团队：中国疾控中心、华大、解放军总医院第五医学中心、北京地坛医院、深圳国家基因库等

内容概述：该研究系统描绘了新冠患者外周血免疫细胞的整体免疫反应特征，发现新冠肺炎患者免疫响应模式与发病轻重程度有密切关联。同时，利用单细胞测序对新冠和流感患者的外周血各种免疫细胞类型的响应情况进行了深度解析和比较，系统阐述了新冠和甲流感染免疫特征的异同点。该研究为理解新冠的发病机制、指导临床诊治和疫苗的研发及应用提供了重要的参考......成果详情>>

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4、新冠病毒检测和研究的三种基因组测序方法比较

文章标题：Multiple approaches for massively parallel sequencing of SARS-CoV-2 genomes directly from clinical samples

发表时间：2020.6.30

发表期刊：Genome Medicine

影响因子：10.675

作者团队：华大、广州医科大学附属第一医院

内容概述：基于ATOPlex多重PCR平台率先研发与应用专门针对新冠病毒的扩增子测序方法，并首次系统地对基于超高深度宏基因组测序、多重PCR扩增子测序以及探针捕获测序这三种手段进行新冠病毒基因组变异研究的效能进行了比对分析。

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5、新冠症状严重程度与患者自身遗传因素有关

文章标题：Initial whole-genome sequencing and analysis of the host genetic contribution to COVID-19 severity and susceptibility

发表时间：2020.11.10

发表期刊：Cell Discovery

影响因子：6.255

作者团队：深圳市第三人民医院、华大

内容概述：基于华大DNBSEQ平台首次探究了中国人群遗传背景对新冠症状严重程度以及易感性的影响。课题组招募了332例核酸阳性但表现为无症状、轻症、普通、重症和危重等不同严重程度的新冠患者。通过对患者及自然对照人群进行深度测序和分析，发现了位于六号染色体的人类白细胞抗原区域（HLA）特定单倍型以及GOLGA3、 DPP7等基因功能的缺失会增加罹患新冠重症的风险......成果详情>>

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为应对新冠疫情，华大与多个研究团队联合攻关，为揭秘病毒的遗传密码和攻克良方做出不懈努力。截止2020年11月，基于DNBSEQ自主平台已发表文章1500+，实现CNS主刊大满贯，拥有高准确度和敏感度、超低Dup率、无index hopping担忧等优点，助力全球科研工作者勇攀科研高峰，创科技硕果！

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