实验技术：Real time PCR
作为在实验室奋斗的“奋青”们，都知道Realtime PCR(RT-PCR)是并列于western blot的基础实验之一。不会做PCR的人都不好意思说自己在搞科研，呵呵哒。作为一门核心技术，也是相对来说出结果快速的技术，本次小笔将一改逗比风格，高冷正经脸来分享该技能，各位接好了啊。
RT-PCR原理的话简单来说，就是采用荧光基团标记的特异性探针来跟踪PCR产物，做到全程监控，后期结合电脑软件分析定量得出待测样品的初始量。步骤如下：
1. RNA提取和测定
（1）平衡：-80℃取出TRIZOL裂解的细胞（也可以当时裂解；如果是组织，需要超声破碎后再进行后续步骤），置于室温使其完全溶解（3-5min左右）；
（2）分离：随后按照裂解液：氯仿（5：1）的比例加入氯仿，剧烈震摇30 S（自认为手劲儿大的就手动摇，扛不住的话也可以涡旋仪，当然我是一直手动的哈哈）后，室温静置3min，4℃，13,000rpm离心10 min，取上清置于干净的RNAfree的EP管中。
【小提示：取上清的时候很容易将中间层的絮状物吸出，导致蛋白质污染，可以采用PhaseLock Gel的离心管，有效分层水相和有机相，避免吸取的上清混杂杂质。】
（3）沉淀：在上清中加入等体积的异丙醇，轻微上下翻动混合，冰上孵育20min后，4℃，14,000rpm离心20 min，管底部有可见沉淀，即为RNA（如果裂解的细胞较少，沉淀可能肉眼看不见）。
（4）清洗干燥：轻柔的倒掉上清，每管加入1 ml 75%乙醇溶液（采用DEPC水配置），混匀，4℃，14,000 rpm离心15 min。小心倒掉上清，于超净台边缘干燥5min。
（5）溶解测定：根据具体的RNA的量，加入适当的DEPC水溶解（沉淀可见，加入的DEPC水多一些，反之少加），静置后即可于nanodrop检测浓度（一般我们暂定A260/A280比值在1.8-2.0即可使用）。
2. cDNA合成
说了这么多终于完成了第一大步，虽然步骤看似较多，但是掌握后还是蛮简单的，而且在做该步骤的时候还可以穿插很多其他的实验，非常不占用时间。
在小笔的实验中，采用的是TransScript One-Step gDNA Removal and cDNASynthesis SuperMix试剂盒，只需要根据试剂盒说明书的配比加入八连排管，设置好程序即可。
当然，每个实验室使用的试剂盒不同，具体根据各自实际情况来定，但是原理是相同的，最终得到cDNA产物即可，储存于-20℃备用。
3. RT-PCR
这部分其实是最简单也是最难的一步，简单在于只要把相应的引物，cDNA产物，SubGreen染料等以合适的比例混合在一起即可；而难点在于加样的精准性，会极大的影响实验的结果。
我以ABI 7500fast为例，采用subgreen荧光染料，按照以下反应体系进行配比：
序号 | 反应物 | 剂量 μL |
1 | 上游引物Forward | 0.6 |
2 | 下游引物Reverse | 0.6 |
3 | SubGreen染料 | 10 |
4 | cDNA | 5 |
5 | DEPC水 | 3.8 |
总 | 20 μL |
反应温度为:
95℃预变性3min, 随后40个PCR循环（95℃ 3 seconds；60℃ 31 secends），最后加上溶解曲线即可。
最后得出以上这样的曲线，如何解读下期说啦。
备注：因为ABI的这台仪器可以全自动分析实验数据，操作较为简单。其他仪器要根据相应的操作手册来进行，要注意各自的反应体系和温度设置，不同仪器会略有差异。
最后几点重要的小提示：
1. 最后进行PCR后的PCR产物可以通过琼脂糖凝胶电泳来检测其产物是否是单一的扩增条带，小笔比较懒，较少采用该步骤。
2. PCR引物的设计也是十分重要的环节。设计不合理，很容易P出不对的结果或者根本P不出来，下次有时间再专门讲解如何设计合适的引物。
3. 最最重要的是，提取RNA的所有的操作过程都要保证无污染，比如使用RNAfree的EP管，采用DEPC水，戴口罩和手套等等；PCR的过程要保证精准度，新手可能一次性加满96孔板会导致复孔结果偏差很大，先少后多，保证质量，相信我，不然一溜加完加到手酸无比，也出不来好的结果的时候，你会崩溃的。
RT-PCR从收细胞开始到最后出结果，看似时间很长，但是可以一次得到很多结果，还是属于高效性的实验，只要把握实验的关键技术难点，出数据是分分钟的事情，好啦，啰嗦到此，诸位使出洪荒之力好好做实验吧，如果在实验中太辛苦，生不如死的话，找我找我（找傅园慧宝宝也行）来帮你，哈哈哈！
附赠表情包，好好享受吧，乐观向上，向这个妞学习，欧也！
小笔，我浙药学院的一名普通老博，“长期奋斗”在肿瘤药理及神经药理学领域，经常跟老鼠细胞啥么的打交道，不过马上要滚蛋了，但仍然会活跃在这几个领域继续做实验，聊八卦。其实小笔最初的自我定位是成为一枚文艺女青年，不过每天在实验室泡着久而久之也就只是枚伪文青了。小笔想用一颗文艺加逗比的心，把枯燥的实验操作转化为轻松清新的语言传递给大家，生活还是可以很美好，课题实验也还是可以继续哒!
科研路，不孤单！
Freescience医学科研联盟全国火热招募ing
50家高校及医院的小伙伴已经加入啦
具体点这里
想围观一篇SCI论文是怎样写成的吗？
Freescience线上沙龙之SCI论文合作呼唤你
具体点这里
FS科研软件库，集合50+医学科研必备神器，现在统统打包分享，点这里
还有Freescience科研交流群
长按二维码加小秘书为好友
未经许可 不得转载长按二维码关注