[免费版] 下一轮趋同演化新热点，未来的主流毒株，超长期的自信预测
各位五一节快乐~
同样的内容，昨天发了个付费版换了顿烧烤，
现在照惯例，重发一遍免费版。
首先解释一下，这次咱当了回标题党……
标题所谓的“自信预测”，
其实并不是咱来预测，
而是有真正的高手出马
——请品鉴：
总之，今天的预测，并不是来自咱这个便利店打工仔兼打印机维修员，
而是来自深受各位喜爱的曹老师~
上图是曹老师他们马上要出炉的某预印本的附图，其中：
图a是BA.5突破性感染的免疫背景下，以XBB为骨架的下一轮刺突蛋白趋同突变热点；
图b则是BA.1/BA.2突破性感染外加BA.5重复感染的免疫背景下，以XBB为骨架的下一轮刺突蛋白趋同突变热点；
每张图里的曲线越高，则说明对应的刺突蛋白位点成为趋同演化热点的可能性越大；
而每张图方框里的字母字号越大，则说明对应位点突变到对应氨基酸的可能性越大。
话说，上图由曹老师团队给大佬Jesse Bloom老师喂数据算出来的，
其中403和456两个位点已经被验证了，现在已经开始频繁出现这俩位点的突变。
不过呢，关注变异株进展的硬核玩家可能会略微觉得诧异——按说刺突蛋白478位点才是当前最热门的趋同演化热点，为啥曹老师加Jesse桑联手打造的计算器，却偏偏把这个重点位点给漏掉了呢？
原因其实很简单。
曹老师自己解释过（详见这里）：
478位点的趋同突变，需要宿主们已经先后多次感染过含有T478K突变的变异株（即Delta和Omicron）；
然而他的数据全都来自于国内的受试者血浆，可是这些受试者并没有先后多次感染过Delta和Omicron，所以无法复刻出一个适合478趋同演化发生的免疫地形……
不过呢，曹老师也贴心地安慰了大家：这个免疫地形马上就会有啦~
anyway，Nature背书的全球最强新冠预测者曹老师，最后的预测如下：
半年之内的新发主流毒株，将带有403+456+478三个位点的突变~
顺便一提啊，曹老师这份还没登场的预印本，标题是《Repeated Omicron infection alleviates SARS-CoV-2 immune imprinting》~
翻译成人话就是：《重复感染Omicron减轻了益生菌19的免疫印记效应》。
嘿嘿，这标题听着，是不是挺像一颗大号定心丸？
含焦量十足的免疫印记/抗原原罪，居然是可以减轻的？
而且只需要重复感染人畜无害的益生菌19奥宝宝，就可以在积极偿还免疫债的同时，顺便把原罪的毒咒给破解了？
可惜，这个充满希望的标题背后，却隐藏着含焦量更高的发现~
关于这一点，其实之前咱已经暗搓搓地抢跑过了，这里就不再重复了。
以上，搬运完毕~
下面咱自己贩卖一些焦虑吧。
正如开局一张图所述，
下一轮趋同演化热点，除了曹老师力推的403、456和478之外，
还有417、440和505。
而且很不巧的是，在这三个位点，增加适应性最明显的突变选项，刚好都是回复突变，
也就是恢复成原始株的造型……
并且吧，导致发生回复突变的选择压，还统统都是免疫逃逸~
于是现在问题就来了……
——首先，请品鉴啊：
对于Omicron进一步变异的空间，之前不少心理按摩大湿都抱有一种幼稚到可笑的乐观期望——它已经接近饱和啦！就快要走进死胡同，变不动啦！
现在曹老师加Jesse桑这张强强联手的预测图告诉我们：
饱和什么的，不存在的，大不了就反复横跳呗~
全靠回复突变，益生菌19照样轻松实现免疫逃逸
然后呢，更现实的麻烦在于，由于纯技术方面的原因，现有的测序和撸树机制，没法高效且准确地区分dropout等测序记录质量问题，以及真正的回复突变~
所以哪怕这样的突变真的发生了，研究人员的反应也多半会慢上一拍。
以上！
多谢各位昨天赞助的烧烤资金！